Sari la conținut

Format:Infocaseta Proteină

De la Wikipedia, enciclopedia liberă
Infocaseta Proteină
Identificatori
Symbol?
Documentație
Documentație format
Această documentație este adusă de la pagina Format:Infocaseta Proteină/doc.

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Usage

To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.

{{Infobox protein family
| class = <!-- to save space: collapsible collapsed -->
| Symbol = 
| Name = 
| image = 
| caption = 
| Pfam = 
| Pfam_clan = 
| InterPro = 
| SMART = 
| PROSITE = 
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP = 
| TCDB = 
| OPM family = 
| OPM protein = 
| CAZy = 
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}

Examples

The following filled in Pfam infobox template produces the information box to the right.

Ligand-binding domain (LBD)

RORγ (PDB: 3L0L​)
Identificatori
SymbolHormone_recep
PfamPF00104
InterProIPR000536
SMARTSM00430
CATH1lbd
SCOP21lbd / SCOPe / SUPFAM
CDDcd06157
{{Infobox protein family
| Symbol = Hormone_recep
| class = collapsible
| Name = Ligand-binding domain (LBD)
| image = RORC_3L0L.png
| caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]] ({{PDB|3L0L}})
| Pfam = PF00104
| InterPro = IPR000536
| SMART = SM00430
| PROSITE = 
| SCOP = 1lbd
| CATH = 1lbd
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CDD = cd06157
}}

Maintenance

TemplateData

Aceasta este documentația TemplateData pentru format folosită de Editorul vizual și alte unelte.

Infocaseta Proteină

This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.

Parametrii formatului[Gestionează TemplateData]

ParametruDescriereTipStare
SymbolSymbol

fără descriere

Linieopțional
NameName

fără descriere

Linieopțional
Imageimage

fill in "NONE" if not needed to suppress the tracking category

Fișieropțional
Widthwidth

Width for image

Șiropțional
Captioncaption

Caption for image

Șiropțional
InterPro family identifierInterPro

fără descriere

Unknownopțional
Pfam family identifierPfam

Auto-links to Pfam family record

Linieopțional
Pfam clan identifierPfam_clan

Auto-links to Pfam clan record; a clan is a group of related families (~superfamily).

Linieopțional
Interpro identifierInterpro

Auto-links to an Interpro entry

Linieopțional
SMART accession numberSMART

Auto-links to a domain entry in the Simple Modular Architecture Research Tool

Linieopțional
PROSITE record identifierPROSITE

Auto-links to a PROSITE record search

Linieopțional
MEROPS record identifierMEROPS

Auto-links to a MEROPS record (MEROPS is scoped to peptidases and their inhibitors)

Linieopțional
SCOP (domain/PDB accession number)SCOP

Given a PDB accession number or SCOP domain name, auto-links to a SCOP and a SUPFAMpage.

Linieopțional
SCOP2 overrideSCOP2

SCOP and SCOP2 use different domain nomenclature. Use this value if a domain is specified for SCOP.

Exemplu
8029676
Unknownopțional
CATH (domain/PDB accession number)CATH

Given a CATH domain ID or a PDB accession number, auto-links to CATH (Classification of Protein Structural Domains).

Linieopțional
TCDB identifierTCDB

Auto-links to an identifier search in the Transporter Classification Database

Linieopțional
OPM superfamily identifierOPM family

Auto-links to a superfamily record in the database of Orientations of Proteins in Membranes.

Linieopțional
OPM protein identifierOPM protein

Value will typically be a PDB identifier; auto-links to a protein record in the database of Orientations of Proteins in Membranes

Linieopțional
CAZy family identifierCAZy

Auto-links to a family description page in the database of Carbohydrate-Active enZYmes.

Linieopțional
CDD uidCDD

Auto-links to a record in the Conserved Domain Database

Linieopțional
alignalign

fără descriere

Unknownopțional
image_sizeimage_size

fără descriere

Unknownopțional
altalt

fără descriere

Unknownopțional
Membranome superfamilyMembranome superfamily

fără descriere

Unknownopțional
Membranome familyMembranome family

fără descriere

Unknownopțional
classclass

infobox class

Exemplu
collapsible collapsed
Unknownopțional
belowbelow

footnotes

Unknownopțional
PDBPDB

PDB examples. Only use if all of: no image is available, no CATH/SCOP examples, InterPro or PDB search fails.

Conținutînvechit

Descriere scurtă a formatului și a scopului său.

Format de bază

Codul formatului, schematic, punând în evidență cei mai utilizați parametri.

Parametri

Descrierea completă a tuturor parametrilor, în cazul în care formatul are parametri.

Mod de folosire

Dacă trebuie urmați anumiți pași pentru a utiliza formatul, explicați procedura.

Exemple

Dați câteva exemple ale modului de folosire, folosind cod și exemple.

Codul exemplului 1

Format:Formatul care demonstrează exemplul 1

Codul exemplului 2

Format:Formatul care demonstrează exemplul 2

Detalii tehnice

Dacă formatul este mai complex, puteți da detalii despre modul în care este construit. Acestea pot fi utile utilizatorilor care vor să îmbunătățească formatul.

Vezi și

  • legături
  • spre alte
  • formate
  • sau pagini