O município de Itaquaquecetuba foi fundado aproximadamente entre 1560 e 1563 por jesuítas liderados pelo padreJosé de Anchieta, próximo a região do Rio Tietê, os primórdios do município se baseiam na capela católica de Nossa Senhora d'Aguda que foi fundada pelo próprio padre. O município teve um pequeno desenvolvimento e chegou a ficar quase deserto no início do século XX, até 1958 o município foi um distrito de Mogi das Cruzes, neste ano ouve a emancipação do município possuindo como primeiro prefeito Eugênio Victorio Deliberato, o desenvolvimento de Itaquaquecetuba só teve grande impacto geográfico e econômico a partir da industrialização ao longo das décadas.
A Bandeira do município de Itaquaquecetuba é representada com 3 palas e 3 faixas nas cores preto, branco e vermelho, que formam uma cruz, sendo que ao centro, dentro de um círculo esta o Brasão Municípal, tudo em fundo branco.
A história de Itaquaquecetuba, um município brasileiro localizado na região da grande São Paulo, Em 1624 missionários católicos constroem a capela de N. Sra. da Ajuda. Dois séculos depois, Itaquaquecetuba torna-se freguesia de Mogi. Somente em 1953 torna-se politicamente Independente. Boa parte do desenvolvimento do município se deu a construção da primeira estação ferroviária de Itaquaquecetuba em 1926, ante da emancipação do município.