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Formação de padrões

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(Redirecionado de Formação de Padrões)
Formação de padrões de dendritos em modelo computacional.

A ciência da formação de padrões lida com os resultados visíveis (estatisticamente) organizados da auto-organização e os princípios comuns por trás de padrões similares na natureza .

Na biologia do desenvolvimento, a formação de padrões refere-se à geração de organizações complexas de especificação celular no espaço e no tempo. A formação de padrões é controlada por genes. O papel dos genes na formação de padrões é um aspecto da morfogênese, a criação de diversas estruturas anatômicas a partir de genes semelhantes, agora sendo explorados na ciência da biologia do desenvolvimento evolucionário ou evo-devo. Os mecanismos envolvidos são observados, por exemplo, no padrão dos embriões do organismo-modelo Drosophila melanogaster (uma mosca da fruta), um dos primeiros organismos a ter sua morfogênese estudada, e nos desenhos de olhos nas asas de borboletas, cujo desenvolvimento é uma variante de o mecanismo padrão (mosca da fruta).

Exemplos de formação de padrões podem ser encontrados em Biologia, Química, Física, Matemática[1] e podem ser prontamente simulados com computação gráfica, como descrito abaixo.

Padrões biológicos como coloração em animais, segmentação e filotaxia são formados de diferentes maneiras.[2]

Na biologia do desenvolvimento, a formação de padrões descreve o mecanismo pelo qual células inicialmente equivalentes em um tecido se desenvolvendo em um embrião assumem formas e funções complexas.[3] A embriogênese, como a mosca da fruta Drosophila, envolve o controle coordenado dos destinos das células.[4][5][6] A formação de padrões é geneticamente controlada e freqüentemente envolve cada célula em um campo detectando e respondendo à sua posição ao longo de um gradiente morfogênico, seguido por comunicação entre células a curta distância através de vias de sinalização celular para refinar o padrão inicial. Nesse contexto, um campo de células é o grupo de células cujos destinos são afetados por responder às mesmas sugestões de informações posicionais definidas. Este modelo conceitual foi descrito pela primeira vez como o modelo da bandeira francesa na década de 1960.[7][8] De maneira mais geral, a morfologia dos organismos é modelada pelos mecanismos da biologia evolutiva do desenvolvimento, como a alteração do tempo e do posicionamento de eventos específicos de desenvolvimento no embrião.[9]

Possíveis mecanismos de formação de padrões em sistemas biológicos incluem o modelo clássico de reação-difusão proposto por Alan Turing [10] e o mecanismo de instabilidade elástica mais recentemente considerado responsável pelos padrões de dobras no córtex cerebral de animais superiores, entre outras coisas.[11][12]

Crescimento de colônias

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Colônias bacterianas mostram uma grande variedade de padrões formados durante o crescimento da colônia. As formas resultantes dependem das condições de crescimento. Em particular, as tensões (dureza do meio de cultura, falta de nutrientes, etc.) aumentam a complexidade dos padrões resultantes.[13] Outros organismos, como os fungos, exibem padrões notáveis causados pela dinâmica da sinalização química.[14]

A formação de padrões tem sido bem estudada em química e engenharia química, incluindo padrões de temperatura e concentração.[15] O modelo Brusselator desenvolvido por Ilya Prigogine e colaboradores é um desses exemplos que exibe a instabilidade de Turing.[16] A formação de padrões em sistemas químicos freqüentemente envolve cquímica inética oscilatória ou reações autocatalíticas [17] tais como a reação de Belousov-Zhabotinsky ou a reação de Briggs-Rauscher. Em aplicações industriais, como reatores químicos, a formação de padrões pode levar a pontos quentes de temperatura que podem reduzir o rendimento ou criar problemas de segurança perigosos, como uma fuga térmica.[15][18] O surgimento da formação de padrões pode ser estudado por modelagem matemática e simulação do sistema de reação-difusão subjacente.[15][17]

Nos anos 80, Lugiato e Lefever desenvolveram um modelo de propagação de luz em uma cavidade óptica que resulta na formação de padrões pela exploração de efeitos não-lineares.

Células de Bénard, Laser, formações de nuvens em faixas ou rolos. Ondulações em sincelos. Padrões de tábua de lavar em dirtroads. Dendritos em solidificação, cristais líquidos . Solitons

Embalagens e revestimentos de esfera . A matemática está na base dos outros mecanismos de formação de padrões listados.

Computação Gráfica

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Ficheiro:Homebrew reaction diffusion example 512iter.jpg
Padrão semelhante a um modelo de difusão-reação, produzido usando sharpen e blur.

Alguns tipos de autômatos foram usados para gerar texturas de aparência orgânica para sombreamento mais realista de objetos 3D .[19][20]

Um popular plugin do Photoshop, o KPT 6, incluía um filtro chamado 'KPT reaction'. A reação produziu padrões de estilo de reação-difusão baseados na imagem da semente fornecida.

Um efeito semelhante à 'reação KPT' pode ser obtido com funções de convolução no processamento de imagem digital, com um pouco de paciência, repetidamente aprimorando e desfocando uma imagem em um editor gráfico. Se outros filtros forem usados, como a detecção de relevo ou borda, diferentes tipos de efeitos podem ser obtidos.

Os computadores costumam são usados para simular os processos biológicos, físicos ou químicos que levam à formação de padrões e podem exibir os resultados de maneira realista. Cálculos usando modelos como Reação-difusão ou MClone são baseados nas equações matemáticas projetadas pelos cientistas para modelar os fenômenos estudados.

  1. Ball, 2009.
  2. Ball, 2009. Shapes, pp. 231–252.
  3. Ball, 2009. Shapes, pp. 261–290.
  4. «Notch signaling: control of cell communication and cell fate». Development. 131. PMID 14973298. doi:10.1242/dev.01074 
  5. «Cellular pattern formation during retinal regeneration: A role for homotypic control of cell fate acquisition». Vision Research. 47. PMID 17034830. doi:10.1016/j.visres.2006.08.025 
  6. «Biological pattern formation: How cell[s] talk with each other to achieve reproducible pattern formation» 
  7. «Positional information and the spatial pattern of cellular differentiation». J. Theor. Biol. 25. PMID 4390734. doi:10.1016/S0022-5193(69)80016-0 
  8. Wolpert, Lewis; et al. Principles of development. [S.l.: s.n.] ISBN 978-0-19-927536-6 
  9. «Evo-Devo: evolutionary developmental mechanisms». International Journal of Developmental Biology. 47. PMID 14756324 
  10. S. Kondo, T. Miura, "Reaction-Diffusion Model as a Framework for Understanding Biological Pattern Formation", Science 24 Sep 2010: Vol. 329, Issue 5999, pp. 1616-1620 DOI: 10.1126/science.1179047
  11. «Beyond Turing: mechanochemical pattern formation in biological tissues.». Biology Direct. 11. PMC 4857296Acessível livremente. PMID 27145826. doi:10.1186/s13062-016-0124-7 
  12. Tallinen et al. Nature Physics 12, 588–593 (2016) doi:10.1038/nphys3632
  13. Ball, 2009. Branches, pp. 52–59.
  14. Ball, 2009. Shapes, pp. 149–151.
  15. a b c «Linear stability analysis of high- and low-dimensional models for describing mixing-limited pattern formation in homogeneous autocatalytic reactors». Chemical Engineering Journal. 145. ISSN 1385-8947. doi:10.1016/j.cej.2008.08.025 
  16. Prigogine, I.; Nicolis, G. (1985), Hazewinkel, M.; Jurkovich, R.; Paelinck, J. H. P., eds., «Self-Organisation in Nonequilibrium Systems: Towards A Dynamics of Complexity», ISBN 9789400962392, Springer Netherlands, Bifurcation Analysis: Principles, Applications and Synthesis: 3–12, doi:10.1007/978-94-009-6239-2_1, consultado em 24 de março de 2019 
  17. a b «Dynamic Simulation of Mixing-Limited Pattern Formation in Homogeneous Autocatalytic Reactions». Chemical Product and Process Modeling. 3. ISSN 1934-2659. doi:10.2202/1934-2659.1135 
  18. «Dynamics of Transversal Hot Zones in Shallow Packed-Bed Reactors†». The Journal of Physical Chemistry B. 108. ISSN 1520-6106. doi:10.1021/jp049803p 
  19. Greg Turk, Reaction-Diffusion
  20. «Reaction-Diffusion Textures» (PDF). doi:10.1145/122718.122750 
  • Ball, Philip. Nature's Patterns: a tapestry in three parts. 1:Shapes. 2:Flow. 3:Branches. [S.l.: s.n.] ISBN 978-0199604869  Ball, Philip. Nature's Patterns: a tapestry in three parts. 1:Shapes. 2:Flow. 3:Branches. [S.l.: s.n.] ISBN 978-0199604869  Ball, Philip. Nature's Patterns: a tapestry in three parts. 1:Shapes. 2:Flow. 3:Branches. [S.l.: s.n.] ISBN 978-0199604869 

Ligações externas

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  • SpiralZoom.com [1], um site educacional sobre a ciência da formação de padrões, espirais na natureza e espirais na imaginação mítica.
  • '15-line Matlab code ', Um programa Matlab simples de 15 linhas para simular a formação de padrões 2D para o modelo de reação-difusão.