Lista odcinków serialu Z Archiwum X

Poniżej znajduje się lista odcinków serialu Z Archiwum X emitowanego przez telewizję FOX w latach 1993–2002 oraz 2016–2018. W Polsce serial emitowało wiele stacji m.in. TVP2 i Polsat, a także TVP Seriale i Tele 5 oraz Fox Polska.

Po dziewięciu latach produkcji powstało 9 sezonów, w których zostały zawarte 202 odcinki. Dodatkowo, do serii wliczają się 2 filmy kinowe oraz sezony 10 (wyemitowany na początku 2016 roku) i 11 (wyemitowany na początku 2018 roku), w których zawarto 16 odcinków.

20 kwietnia 2017 roku stacja FOX zamówiła 10 odcinków jedenastego sezonu, którego produkcja odbyła się w lecie 2017 roku. Premiera sezonu nastąpiła 3 stycznia 2018 roku na kanale FOX, natomiast w Polsce, podobnie jak w przypadku sezonu dziesiątego, dzień później na kanale FOX Polska.

Przegląd sezonów

Sezon		Odcinki	Pierwsza emisja		Pierwsza emisja
			Premiera sezonu	Finał sezonu	Premiera sezonu	Finał sezonu	Dystrybucja
	1	24	10 września 1993	13 maja 1994	20 marca 1996	30 września 1996	TVP2
	2	25	16 września 1994	19 maja 1995	7 października 1996	7 kwietnia 1997
	3	24	22 września 1995	17 maja 1996	14 kwietnia 1997	25 września 1997
	4	24	4 października 1996	18 maja 1997	2 października 1997	1 września 1998
	5	20	2 listopada 1997	17 maja 1998	8 września 1998	19 stycznia 1999
	Pokonać przyszłość		19 czerwca 1998		25 września 1998		Dystr. kinowa
	6	22	8 listopada 1998	16 maja 1999	2 września 1999	10 lutego 2000	TVP2
	7	22	7 listopada 1999	21 maja 2000	2 listopada 2000	10 maja 2001
	8	21	5 listopada 2000	20 maja 2001	6 marca 2004	12 sierpnia 2004
	9	20	11 listopada 2001	19 maja 2002	6 maja 2013	31 maja 2013	Tele 5
	Chcę wierzyć		24 lipca 2008		25 lipca 2008		Dystr. kinowa
	10	6	24 stycznia 2016	22 lutego 2016	25 stycznia 2016	23 lutego 2016	Fox Polska
	11	10	3 stycznia 2018	21 marca 2018	4 stycznia 2018	22 marca 2018

Seria 1 (1993−1994)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
1	1	Pilot	Odcinek pilotażowy (DVD) Mulder i Scully (Fox Polska)	Robert Mandel	Chris Carter	10 września 1993	20 marca 1996
Odcinek zaczyna się informacją, że przedstawiona historia jest oparta na udokumentowanych wydarzeniach, sugerując tym samym autentyczność historii. Pierwsza sprawa jaką badają Mulder i Scully dotyczy tajemniczych zgonów nastolatków, należących do tej samej klasy liceum w mieście Bellefleur w stanie Oregon. Mulder podejrzewa ingerencje istot pozaziemskich, o czym miałyby świadczyć dziwne ślady na ciałach osób rzekomo uprowadzonych, tajemnicze implanty, czy zmowa milczenia okolicznych mieszkańców i lokalnych władz. Kluczową postacią okazuje się być Billy Miles nastolatek w stanie śpiączki, który kierowany obcą siłą, przynosi do lasu osoby, które zostają później uprowadzone.
2	2	Deep Throat	Głębokie Gardło	Daniel Sackheim	Chris Carter	17 września 1993	12 kwietnia 1996
Mulder i Scully badają zaginięcie pilota wojskowego pracującego w tajnej bazie lotniczej. Trafiają na trop eksperymentalnych samolotów. Mulder podejrzewa, że wojsko wykorzystuje technologie ze statku z Roswell. Mulder spotyka po raz pierwszy tajemniczego mężczyznę, informatora, który ostrzega go przed niebezpieczeństwem związanym z prowadzonym dochodzeniem.
3	3	Squeeze	Przecisnąć się (DVD) Ścisk (Fox Polska)	Harry Longstreet	Glen Morgan, James Wong	24 września 1993	19 kwietnia 1996
Mulder i Scully prowadzą śledztwo w sprawie tajemniczych zabójstw. Jak się okazuje, mordercą jest człowiek, który dzięki hibernacji zachował wygląd 30-latka, choć naprawdę ma 100 lat, natomiast jego ciało potrafi rozciągać się jak guma.
4	4	Conduit	Kanał	Daniel Sackheim	Alex Gansa, Howard Gordon	1 października 1993	26 kwietnia 1996
W małym miasteczku, w Iowa, znanym z wysokiej aktywności UFO, znika dziewczyna, w okolicznościach bardzo podobnych do zaginięcia siostry agenta Muldera. Młodszy brat zaginionej, który był świadkiem zajścia, zaczyna odkodowywać szum pochodzący z przekazu satelitarnego. Mulder wierzy, że jest on kluczem do rozwiązania zagadki.
5	5	The Jersey Devil	Diabeł z Jersey	Joe Napolitano	Chris Carter	8 października 1993	9 maja 1996
Przyjaciel Scully prosi ją o pomoc, w rozwikłaniu sprawy brutalnych morderstw, mających miejsce w lasach pobliskich Atlantic City. Wszystkie poszlaki wskazują na to, iż podejrzanym jest, nieznany do tej pory nauce, gatunek inteligentnego hominida.
6	6	Shadows	Cienie	Michael Katleman	Glen Morgan, James Wong	22 października 1993	17 maja 1996
Agenci zajmują się sprawą Lauren – w jej otoczeniu zmarły ostatnio 3 osoby. Mulder podejrzewa, że może mieć to związek ze zjawiskami psychokinetycznymi. Scully pozostaje sceptyczna.
7	7	Ghost in the Machine	Duch w maszynie	Michael Jerrold Freedman	Alex Gansa, Howard Gordon	29 października 1993	24 maja 1996
W Bostonie dochodzi do nietypowego morderstwa. Wszystkie poszlaki prowadzą do twórcy systemu zabezpieczającego w budynku, w którym zaszło zdarzenie. Mulder uważa, iż jest on niewinny.
8	8	Ice	Lód	David Nutter	Glen Morgan, James Wong	5 listopada 1993	7 czerwca 1996
Ze stacji naukowców , badających na Alasce, lód sprzed tysięcy lat, do bazy ktoś przesyła komunikat mówiąc: „Nie jesteśmy tym, kim jesteśmy”, po czym popełnia samobójstwo. Mulder i Scully, wraz z pomocnikami, postanawiają pojechać do stacji, w przerwie między burzą śnieżną. Wszyscy w bazie nie żyją. Pilota helikoptera gryzie pies, który ma dziwne objawy choroby. Pilot zaraża się chorobą i bohaterowie muszą zarządzić kwarantannę.
9	9	Space	Przestrzeń (DVD) Kosmos (Fox Polska)	William Graham	Chris Carter	12 listopada 1993	14 czerwca 1996
Astronauci mają dostarczyć ładunek na orbitę okołoziemską. Na Ziemi ich dowódca zdaje się być opętany przez dziwnego ducha.
10	10	Fallen Angel	Upadły anioł	Larry Shaw	Alex Gansa, Howard Gordon	19 listopada 1993	21 czerwca 1996
W małym miasteczku dochodzi do dziwnego wypadku. Wojsko przejmuje dowodzenie, lecz mediom mówi, że to było wykolejenie się pociągu. Tak naprawdę ścigają oni stworzenie które atakuje wszystko co napotka. Mulder i Scully spotykają tam Maxa – fana teorii spiskowych.
11	11	Eve	Ewa	Fred Gerber	Kenneth Biller, Chris Brancato	10 grudnia 1993	5 lipca 1996
Zabito mężczyznę a jedynym świadkiem była jego córka Teena, która nic nie pamięta. W tym samym czasie na drugim końcu Ameryki też zamordowano mężczyznę i znaleziono identyczną dziewczynkę o imieniu Cindy. Okazuje się, że pewna lekarka sama się klonowała i eksperymentowała na dzieciach.
12	12	Fire	Ogień	Larry Shaw	Chris Carter	17 grudnia 1993	12 lipca 1996
W angielskim Bosham pewien starszy, bogaty mężczyzna ulega samozapłonowi. Tymczasem była kochanka Muldera, Phoebe Green prosi parę agentów do pomocy przy podpaleniu.
13	13	Beyond the Sea	Za morzem (DVD) Poza morzem (Fox Polska)	David Nutter	Glen Morgan, James Wong	7 stycznia 1994	19 lipca 1996
Umiera ojciec Scully. Tymczasem zaginęło dwoje nastolatków. Mulder prowadzi śledztwo i okazuje się, że na ten temat może coś wiedzieć skazaniec, czekający na komorę gazową. Twierdzi on, że ma zdolności telepatyczne. Tym razem to Mulder pozostaje sceptyczny.
14	14	Gender Bender	Zmiana płci	Rob Bowman	Larry Barber, Paul Barber	21 stycznia 1994	2 sierpnia 1996
Następuje seria tajemniczych zgonów w wyniku ciężkiego zawału. Trop prowadzi agentów FBI do pewnej sekty, która swoimi zasadami przypomina Amiszów.
15	15	Lazarus	Łazarz	David Nutter	Alex Gansa, Howard Gordon	4 lutego 1994	9 sierpnia 1996
Scully i agent Jack Willis uczestniczą w napadzie na bank. W wyniku strzelaniny Willis i napastnik – Warren zostają ranni. Napastnik umiera, a Jackowi udaje się przeżyć. Jednak w czasie śmierci klinicznej dochodzi do zamiany osobowości.
16	16	Young at Heart	Młody sercem (DVD) Młody duchem (Fox Polska)	Michael Lange	Scott Kaufer, Chris Carter	11 lutego 1994	16 sierpnia 1996
Ginie pracownica banku. Zabójcą jest Barnett, którego Mulder zamknął kiedyś na 350 lat więzienia, a wobec którego prowadził swoją pierwszą sprawę w FBI. W wyniku tamtej akcji zginął agent FBI, z winy Foxa. Problem w tym, że Barnett od kilku lat nie żyje. Mulder otrzymuje pogróżki od nieżyjącego więźnia. Śledztwo ujawnia tajemnicze eksperymenty medyczne, przeprowadzane w więzieniu federalnym, w którym przebywał Barnett.
17	17	E.B.E.	E.B.E. (DVD) Istota pozaziemska (Fox Polska)	William Graham	Glen Morgan, James Wong	18 lutego 1994	23 sierpnia 1996
Nad Irakiem zostaje zestrzelone UFO. Agencji prowadzą śledztwo w sprawie kierowcy ciężarówki, który twierdzi że widział latający spodek. Tymczasem Mulder i Scully odkrywają, że są podsłuchiwani, przez nieznane osoby. Informator Muldera udziela mu fałszywych informacji, aby zbić go z tropu. Chcąc uzyskać wiarygodne wskazówki Mulder zabiera Scully do tajemniczej grupy fanów teorii spiskowych nazywającej siebie Samotnymi Strzelcami. Od swojego informatora Mulder dowiaduje się o istnieniu tajnego międzynarodowego porozumienia, mającego na celu ukrywanie i likwidowanie wszelkich śladów aktywności istot pozaziemskich.
18	18	Miracle Man	Cudowny człowiek (DVD) Cudotwórca (Fox Polska)	Michael Lange	Howard Gordon, Chris Carter	18 marca 1994	29 sierpnia 1996
Mały chłopiec, Samuel ma moc uzdrawiania, a nawet wskrzeszania ludzi. Jednak jako nastolatek traci swą moc. Mulder i Scully postanawiają zająć się tą sprawą.
19	19	Shapes	Formy (DVD) Kształty (Fox Polska)	David Nutter	Marilyn Osborn	1 kwietnia 1994	30 sierpnia 1996
Na pewnej farmie mężczyzna zastrzelił człowieka myśląc, że to zwierzę. Agenci odnajdują syna mordercy z dziwnymi cięciami. Scully jedzie z chłopakiem ze szpitala. Ranny chłopak atakuje agentkę, gdyż okazał się on być bestią-wilkołakiem.
20	20	Darkness Falls	Zapada zmrok (DVD) Gdy zapada zmrok (Fox Polska)	Joe Napolitano	Chris Carter	15 kwietnia 1994	2 września 1996
W lesie ginie grupa doświadczonych drwali. Mulder i Scully zajmują się tą sprawą. Okazuje się, że tajemnicze owady owijają ludzi w kokony.
21	21	Tooms	Tooms	David Nutter	Glen Morgan, James Wong	22 kwietnia 1994	9 września 1996
Mimo starań Muldera, Eugene Tooms wychodzi z zakładu zamkniętego. Fox, przekonany, że Tooms będzie dokonywał kolejnych morderstw, robi wszystko, aby mu w tym przeszkodzić.
22	22	Born Again	Ponownie narodzony	Jerrold Freedman	Alex Gansa, Howard Gordon	29 kwietnia 1994	16 września 1996
Mała dziewczynka jest świadkiem kilku niewytłumaczalnych zgonów. Mulder z początku podejrzewa psychokinezę, jednak po pewnym czasie sprawa okazuje się być jeszcze bardziej zaskakująca.
23	23	Roland	Roland	David Nutter	Chris Ruppenthal	6 maja 1994	23 września 1996
Chory umysłowo Roland pracuje jako sprzątacz w ośrodku naukowym. W niewyjaśnionych okolicznościach ginie tam dwóch naukowców. Mulder i Scully postanawiają zająć się tą sprawą.
24	24	The Erlenmeyer Flask	Kolba Erlenmeyera	R.W. Goodwin	Chris Carter	13 maja 1994	30 września 1996
Policja ściga pirata drogowego, który wykazuje nadnaturalne zdolności. Deep Throat daje cynk Mulderowi, by ten zajął się tą sprawą. Scully znajduje bakterię pochodzącą spoza Ziemi. Mulder zostaje porwany przez organizację rządową, natomiast Scully próbuje go ratować. Tymczasem Palacz nakazuje zabić Deep Throat.

Seria 2 (1994–1995)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
25	1	Little Green Men	Mały zielony ludzik (DVD) Zielone ludziki (Fox Polska)	David Nutter	Glen Morgan, James Wong	16 września 1994	7 października 1996
Archiwum X zamknięte. Mulder wyrusza do tajnej bazy w tropikach, by przechwycić pozaziemski sygnał radiowy. Dochodzi do spotkania Muldera z Obcym.
26	2	The Host	Żywiciel	Daniel Sackheim	Chris Carter	23 września 1994	14 października 1996
W kanalizacjach grasuje mutant, człowiek-motylica.
27	3	Blood	Krew	David Nutter	Darin Morgan, Glen Morgan, James Wong	30 września 1994	21 października 1996
Na ekranach elektronicznych urządzeń pojawiają się komendy typu: „zabij, zabij wszystkich”. Komendy okazują się być podświadomością, ożywioną przez tajny rządowy eksperyment.
28	4	Sleepless	Bez snu (DVD) Bezsenność (Fox Polska)	Rob Bowman	Howard Gordon	7 października 1994	28 października 1996
Giną ludzie. Umierają na coś, czego w zasadzie nie ma. Po prostu, przyśniło im się. Mulder zostaje przydzielony do sprawy, którą prowadzi agent Alex Krycek, który od tej pory staje się jego nowym partnerem. Prowadząc śledztwo, Mulder dostaje tajemniczy telefon od nieznanej osoby, który okazuje się być nowym informatorem, przejmując tym samym rolę Głębokiego Gardła. Tajemniczy mężczyzna przekazuje Mulderowi informacje o tajnym wojskowym projekcie sprzed lat, który dotyczył eksperymentów nad snem, w celu stworzenia super żołnierza.
29	5	Duane Barry (Part 1)	Duane Barry (część 1)	Chris Carter	Chris Carter	14 października 1994	4 listopada 1996
Tytułowy Duane Barry, były agent FBI, uważa, że kilkanaście lat wcześniej został uprowadzony przez kosmitów. Przebywając w zamkniętym szpitalu psychiatrycznym porywa lekarza, a następnie w biurze podróży przetrzymuje zakładników. Mulder zostaje wezwany, aby prowadzić negocjacje z porywaczem. Barry opowiada agentowi, co zdarzyło się na pokładzie statku kosmicznego. W tym czasie Scully zdobywa zaskakujące informacje na temat przeszłości medycznej Barry’ego. Ostatecznie porywacz trafia w krytycznym stanie do szpitala, gdzie badania wydają się potwierdzać wersję o uprowadzeniu i eksperymentach medycznych. Wydostawszy się ponownie ze szpitala Barry napada na Scully.
30	6	Ascension (Part 2)	Wniebowstąpienie (część 2) (DVD) Ascendencja (część 2) (Fox Polska)	Michael Lange	Paul Brown	21 października 1994	18 listopada 1996
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Duane Barry porywa Scully. Na miejscu zdarzenia Mulder spotyka się z matką Scully. Mulder, współpracując z Krycekiem, próbuje odnaleźć porywacza kierującego się na miejsce kolejnego spotkania z Obcymi. Krycek, w porozumieniu z Palaczem, skutecznie utrudnia działanie Mulderowi. Pozwala to Barry’emu przekazać kosmitom Scully w zamian za siebie. Po ujęciu przez agentów Duane Barry umiera w niejasnych okolicznościach. Dochodzenie przejmuje wojsko, a Mulder zostaje oskarżony o morderstwo. Mulder oskarża Kryceka, ale ten znika. Skinner jest bezsilny, ale decyduje się reaktywować Archiwum X.
31	7	3	3	David Nutter	Chris Ruppenthal, Glen Morgan, James Wong	4 listopada 1994	25 listopada 1996
W ramach reaktywowanego Archiwum X Mulder próbuje rozwiązać sprawę szajki seryjnych morderców pozbawiających swoje ofiary krwi. Pierwszy z podejrzanych, wystawiony na działanie promieni słonecznych, umiera w areszcie. Trop prowadzi do podziemnego światka ludzi zafascynowanych wampiryzmem.
32	8	One Breath	Jedno tchnienie (DVD) Tchnienie (Fox Polska)	R.W. Goodwin	Glen Morgan, James Wong	11 listopada 1994	2 grudnia 1996
Matka Scully i Mulder przygotowują się do symbolicznego pogrzebu agentki. Niespodziewanie Scully odnajduje się w szpitalu, w stanie głębokiej śpiączki. Nie udaje się ustalić jak znalazła się w szpitalu. Zgodnie ze swoim testamentem, agentka nie chce, by jej życie podtrzymywała aparatura. Przy łóżku chorej czuwa, jako medium, Melissa, siostra Dany, oraz tajemnicza siostra Owens. Celem wyjaśnienia stanu chorej, Mulder korzysta z pomocy Samotnych Strzelców, a następnie Pana X, ale nie przynosi to rezultatów. Mulder odnajduje Palacza, próbuje wyciągnąć od niego istotne informacje, ale jest bezsilny. Skinner nie przyjmuje jego rezygnacji z FBI i motywuje go do dalszej pracy w Archiwum X. Zostaje podjęta decyzja o zaprzestaniu podtrzymywania życia agentki. Po odłączeniu urządzeń, agentka przytomnieje.
33	9	Firewalker	Firewalker	David Nutter	Howard Gordon	18 listopada 1994	9 grudnia 1996
Mulder i Scully prowadzą śledztwo w sprawie niewytłumaczalnych zdarzeń w wulkanologicznym ośrodku badawczym. Na miejscu okazuje się, że genialny, a jednocześnie chory psychicznie szef ekspedycji, Daniel Trepkos, morduje współpracowników. Jego ofiarą stał się już Erickson, wkrótce ginie Pierce. Pozostali naukowcy – Ludwig, Tanaka i O’Neil – żyją osaczeni w ośrodku badawczym. Mulder podejrzewa, że przyczyną psychozy kierownika ekspedycji jest odkrycie pasożytniczej formy życia opartej na związkach krzemowych, która żyje wewnątrz wulkanu. Jeden z naukowców, Tanaka, umiera zabity przez wzrastającego pasożyta. Pobieżne badanie próbek potwierdza podejrzenia Muldera. Agent w towarzystwie Ludwiga schodzi w głąb wulkanu, gdzie spotyka Trepkosa. Trepkos morduje Ludwiga, w tym czasie Scully próbuje uwolnić się od zarażonej O’Neil. Trepkos schodzi do wnętrza wulkanu z ciałem ukochanej, pozostali przy życiu Mulder i Scully zostają poddani kwarantannie. Wszystkie dane naukowe i szczątki robota badawczego nazwanego Firewalker przejmuje wojsko.
34	10	Red Museum	Muzeum Czerwieni (DVD) Czerwone muzeum (Fox Polska)	Win Phelps	Chris Carter	9 grudnia 1994	16 grudnia 1996
Mulder i Scully prowadzą śledztwo w sprawie uprowadzeń dzieci w Wisconsin. Nastolatki znajdowane są po kilkunastu godzinach, rozebrane, w szoku, z zaburzeniami pamięci, zatrute dużymi dawkami skopolaminy, z tajemniczym napisem na plecach. Miejscowy szeryf podejrzewa udział członków wegetariańskiej sekty Muzeum Czerwieni z charyzmatycznym przywódcą, byłym lekarzem, Richardem Odinem. Agenci badają inne dziwne wydarzenia w miasteczku: eksperymenty przeprowadzane na bydle rzeźnym, pomieszczenia ukryte za lustrami weneckimi w budynkach miasteczka, wypadek lotniczy małego samolotu. Okazuje się, że lekarz który zginął w katastrofie lotniczej opiekował się wszystkimi uprowadzonymi dziećmi. Przez wiele lat podawał im prawdopodobnie obce DNA wywołując nieprzewidziane efekty, w tym wzrost agresji. Kolejną ofiarą jest Rick, syn szeryfa, zostaje jednak znaleziony martwy. Podejrzany, Gerd Thomas, choć przyznaje się do uprowadzeń dzieci, nie jest winny morderstwa. Mordercą jest nieidentyfikowalny człowiek zastrzelony podczas incydentu w rzeźni przez zrozpaczonego szeryfa, rozpoznany wcześniej przez Scully (zabójca Głębokiego Gardła z ostatniego odcinka pierwszej serii serialu). Sekta Muzeum Czerwieni wydaje się być zaprojektowaną jako grupa kontrolna eksperymentu na ludziach.
35	11	Excelsis Dei	Excelsis Dei	Stephen Surjik	Paul Brown	16 grudnia 1994	23 grudnia 1996
W domu starców dochodzi do gwałtu. Ofiara twierdzi, że zgwałcił ją duch.
36	12	Aubrey	Aubrey	Rob Bowman	Sara Charno	6 stycznia 1994	30 grudnia 1996
W małym miasteczku Aubrey dochodzi do morderstw, podobnych do innych, sprzed kilkunastu lat. Treścią odcinka jest pamięć genetyczna.
37	13	Irresistible	Niepowściągliwy	David Nutter	Chris Carter	13 stycznia 1995	6 stycznia 1997
Bohaterem odcinka jest fetyszysta, który bezcześci zwłoki by zdobyć trofea – włosy i paznokcie zmarłych.
38	14	Die Hand die Verletzt	Ręka, która rani (DVD) Karząca ręka pana (Fox Polska)	Kim Manners	Glen Morgan, James Wong	27 stycznia 1995	13 stycznia 1997
Czterech nauczycieli tworzy sektę, wyznającą kult szatana. Nocą w lesie grupa nastolatków dla zabawy, wykonuje rytuał przyzywający demona, w trakcie którego jedyna osoba ginie w dziwnych okolicznościach. Na miejsce zdarzeń zostają wezwani Mulder i Scully, podczas oględzin spada na nich deszcz żab. W szkole pojawia się tajemnicza nauczycielka biologii pani Paddock, która przybyła w zastępstwie. Mulder dostrzega że w okolicy zaczynają dziać się dziwne rzeczy. Nowo przybyła nauczycielka w sekrecie odprawia dziwne obrzędy, na skutek których jedna z uczennic popełnia samobójstwo. Wyznawcy kultu szatana wyczuwają obecność, tajemniczej siły. Jeden z nich zaczyna wątpić w słuszność swoich dotychczasowych działań, składa zeznania Mulderowi za co zostaje ukarany przez panią Paddock, która zdaje się być diabłem wcielonym w człowieka. Pozostali członkowie sekty postanawiają złożyć w ofierze Muldera i Scully, aby załagodzić gniew demona.
39	15	Fresh Bones	Świeże kości	Rob Bowman	Howard Gordon	3 lutego 1995	20 stycznia 1997
Żołnierze, z obozu dla uchodźców z Haiti, giną w tajemniczych okolicznościach. Mulder podejrzewa, że to sprawa voodoo.
40	16	Colony (Part 1)	Kolonia (część 1)	Chris Carter	David Duchovny, Chris Carter	10 lutego 1995	27 stycznia 1997
W tym odcinku pojawia się siostra Muldera, Samantha. Na lekarzy poluje mężczyzna, który wbija im szpikulec w podstawę czaszki. Wszyscy mężczyźni byli klonami. Samantha wyjaśnia Mulderowi, że zamordowani lekarze to potomkowie dwóch obcych, którzy pojawili się na Ziemi w latach 40. Od tamtego czasu budują oni kolonie – zaplecze pod inwazje, wierząc że czas ludzi dobiega końca. Łowca który zabija lekarzy ma za zadanie zlikwidować kolonie klonów, ponieważ nie mają oni zgody na przeprowadzanie takich działań.
41	17	End Game (Part 2)	Koniec gry (część 2) (DVD) Ostateczna rozgrywka (część 2) (Fox Polska)	Rob Bowman	Frank Spotnitz	17 lutego 1995	3 lutego 1997
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Podczas próby uwolnienia Scully łowca zabija Samanthę. Mulder dostaje wiadomość, dzięki której odkrywa kolejne klony, które wyglądają jak Samantha. Kobiety proszą Muldera o pomoc w ukryciu przed łowcą pierwszego klona. Wkrótce pojawia się zabójca, obezwładnia Muldera i zabija wszystkie klony. Od swojego informatora Mulder dostaje informacje o lokalizacji statku łowcy, Fox postanawia ruszyć jego śladem. Dociera do opuszczonej łodzi podwodnej. Próbując obezwładnić łowcę strzela do niego zarażając się toksyczną krwią obcego. Na wpół żywy Mulder trafia do wojskowego szpitala, w którym pojawia się agentka Scully. Tylko ona wie jak wyleczyć partnera z tajemniczego wirusa.
42	18	Fearful Symmetry	Przerażająca symetria (DVD) Groza symetrii (Fox Polska)	James Whitmore Jr.	Steven DeJarnatt	24 lutego 1995	10 lutego 1997
Z ZOO znikają zwierzęta, po czym, ni stąd, ni zowąd, pojawiają się w różnych rejonach miasta. Mulder podejrzewa, że pozaziemska cywilizacja podjęła się utrzymania ginących gatunków na naszej planecie.
43	19	Dod Kalm	Spokojna śmierć	Rob Bowman	Howard Gordon, Alex Gansa	10 marca 1995	17 lutego 1997
Mulder i Scully trafiają na statek, który był przez dziesiątki lat toczony przez rdzę. Okazuje się, że agenci trafili na fałdę czasową i nie są zbyt odporni na taką nagłą zmianę czasu.
44	20	Humbug	Mistyfikacja	Kim Manners	Darin Morgan	31 marca 1995	10 marca 1997
Ginie cyrkowiec. Mulder początkowo sądzi, że to syrena z Fidżi, lecz prawda jest zupełnie inna i jeszcze bardziej zaskakująca.
45	21	The Calusari	Calusari	Michael Vejar	Sara Charno	14 kwietnia 1995	24 lutego 1997
Zdarzył się wypadek. Chłopca potrąciła lokomotywa, lecz balon, który trzymał w ręku, unosił się bez ruchu w powietrzu. Podczas jednej z rozmów okazuje się, że starszy brat chłopca miał bliźniaka, który umarł przy porodzie.
46	22	F. Emasculata	F. Emasculata (DVD) Zaraza (Fox Polska)	Michael Bowman	Chris Carter, Howard Gordon	28 kwietnia 1995	3 marca 1997
Szybko rozprzestrzeniająca się zaraza w więzieniu, w Wirginii.
47	23	Soft Light	Rozproszone światło (DVD) Przytłumione światło (Fox Polska)	James Contner	Vince Gilligan	5 maja 1995	17 marca 1997
Pewien naukowiec wytwarza coś w rodzaju czarnej dziury, przemieniając każdego w proch, gdy wejdzie na jego cień.
48	24	Our Town	Nasze miasto	Rob Bowman	Frank Spotnitz	12 maja 1995	24 marca 1997
W pewnym mieście następuje seria zaginięć. Nagle pewna dziewczyna zaczyna chorować na bardzo rzadką chorobę. Agenci w rzece znajdują wygotowane kości wielu zaginionych osób.
49	25	Anasazi (Part 1)	Anasazi (część 1)	R.W. Goodwin	David Duchovny, Chris Carter	19 maja 1995	7 kwietnia 1997
W rezerwacie Indian w Navajo, zostaje znaleziony szkielet Obcego. Tymczasem Mulder dostaje od pewnego anarchisty-hakera kasetę z tajnymi danymi Departamentu Obrony nt. kosmitów. Tekst jest jednak zaszyfrowany w języku indiańskim.

Seria 3 (1995–1996)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
50	1	The Blessing Way (Part 2)	Błogosławiona droga (część 2) (DVD) Indiański rytuał (część 2) (Fox Polska)	R.W. Goodwin	Chris Carter	22 września 1995	14 kwietnia 1997
Kontynuacja ostatniego odcinka drugiej serii. Albert Hosteen przetłumaczył zapis z taśmy lecz wojsko, z nakazu Palacza odbiera Scully papiery. Okazuje się, że Mulder przeżył atak i leczy się u Indian. Scully zostaje zawieszona w wykonywaniu czynności. Przypadkowo odkrywa, że ma pod skórą wszczepiony implant. Tajemniczy mężczyzna ostrzega Scully przed planowanym zamachem na jej życie. Mulder odwiedza swoją matkę, pyta ją o przeszłość ojca i tajemnicze zdjęcie, na którym widnieje m.in. pierwszy informator Muldera. Krycek przez pomyłkę strzela do Melissy, siostry Scully. Dana podejrzewa, że to Skinner ma ją zabić, ale on twierdzi, że ma dla niej kasetę z danymi.
51	2	Paper Clip (Part 3)	Spinacz (część 3) (DVD) Operacja Paperclip (część 3) (Fox Polska)	Rob Bowman	Chris Carter	29 września 1995	21 kwietnia 1997
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder i Scully, wspólnie z Samotnymi Strzelcami, rozwiązują zagadkę kasety. Trafiają do rządowych archiwów, gdzie są przetrzymywane informacje nt. wielu ludzi, w tym agentów FBI. Skinner mówi Palaczowi, że ma zapis z kasety. Albert Hosteen i 20 członków jego plemienia nauczyło się go na pamięć. Melissa Scully umiera w szpitalu.
52	3	D.P.O.	D.P.O.	Kim Manners	Howard Gordon	6 października 1995	28 kwietnia 1997
Młody chłopak z Oklahomy, Darin Peter Oswald jest w stanie władać piorunami. W miasteczku ginie kilku młodych chłopaków. Agenci postanawiają zająć się tą sprawą.
53	4	Clyde Bruckman's Final Repose	Ostatnia droga Clyde’a Bruckmana (DVD) Ostatni spoczynek Clyde’a Bruckmana (Fox Polska)	Rob Bowman	Darin Morgan	13 października 1995	5 maja 1997
Mulder i Scully zajmują się sprawą morderstw wróżbiarzy. Pomaga im Clyde Bruckman, który potrafi przewidzieć czyjąś śmierć.
54	5	The List	Lista	Chris Carter	Chris Carter	20 października 1995	3 lipca 1997
Skazaniec z celi śmierci, Napoleon „Neech” Manley, zostaje stracony na krześle elektrycznym. Przed egzekucją mówi, że zemści się na wszystkich, którzy go źle traktowali. Wkrótce giną strażnicy więzienni.
55	6	2Shy	Zbyt nieśmiały	David Nutter	Jeffrey Vlaming	3 listopada 1995	10 lipca 1997
Pan Incanto umawia się z samotnymi kobietami na randki. Jednak zamiast z nimi flirtować, zjada ich skórę.
56	7	The Walk	Spacer	Rob Bowman	John Shiban	10 listopada 1995	12 maja 1997
W zakładzie opieki nad weteranami wojennymi, pewien były żołnierz pragnie popełnić samobójstwo, ale ciągle mu się nie udaje. Wkrótce potem, w jego dawnej jednostce dochodzi do serii niewytłumaczalnych zjawisk.
57	8	Oubliette	Loch	Kim Manners	Charles Grant Craig	17 listopada 1995	2 czerwca 1997
W Seattle, Carl porywa dziewczynkę Amy i mówi jej „nikt nas nie zniszczy”. W tym samym momencie na drugim końcu miasta, kobieta, która była kiedyś porwana, Lucy ma krwotok i wypowiada te same słowa.
58	9	Nisei (Part 1)	Drugie pokolenie (część 1)	David Nutter	Chris Carter, Howard Gordon, Frank Spotnitz	24 listopada 1995	19 maja 1997
W Knoxville, grupa japońskich naukowców zostaje zabita w trakcie sekcji Obcego. Wkrótce potem, Mulder trafia do tajnego laboratorium, gdzie Amerykanie i Japończycy badają wrak UFO. Mulder widzi również, jak do pociągu ładują żywą, zamaskowaną istotę. Postanawia on dostać się do tego pociągu.
59	10	731 (Part 2)	731 (część 2)	Rob Bowman	Frank Spotnitz	1 grudnia 1995	26 maja 1997
Kontynuacja poprzedniego odcinka. W Wirginii Zachodniej dochodzi do masowego mordu na trędowatych. Mulder, który wskoczył do pociągu, znalazł tam japońskiego lekarza, uczestniczącego w zabiegach na Scully. Okazuje się, że w pociągu jest bomba.
60	11	Revelations	Objawienia	David Nutter	Kim Newton	15 grudnia 1995	9 czerwca 1997
Zabity zostaje pastor-oszust. Udawał stygmatyka. Niedługo potem młody chłopiec Kevin naprawdę ma stygmaty. Zabójca usiłuje go zamordować.
61	12	War of the Coprophages	Wojna koprofagów	Kim Manners	Darin Morgan	5 stycznia 1996	17 lipca 1997
Inwazja karaluchów z metalowymi pancerzykami w Massachusetts.
62	13	Syzygy	Syzygy (DVD) Syzygium (Fox Polska)	Rob Bowman	Chris Carter	26 stycznia 1996	24 lipca 1997
W małym miasteczku dochodzi do serii zabójstw nastolatków. Lokalni mieszkańcy podejrzewają, że za zbrodnie odpowiedzialni są członkowie sekty satanistycznej. Mulder współpracuje z detektyw White, którą jest zainteresowany. Scully jest wyraźnie zazdrosna. Okazuje się, że winnymi tajemniczych zgonów i niewytłumaczalnych zjawisk są dwie nastolatki obdarzone nadprzyrodzonymi zdolnościami. Mulder podejrzewa, że ich moc pochodzi ze zbliżającej się koniunkcji planet.
63	14	Grotesque	Gargulec	Kim Manners	Howard Gordon	2 lutego 1996	31 lipca 1997
W Waszyngtonie zostaje zabity model z Wydziału Sztuk Pięknych. Zabójcą jest John Mostov, więc Mulder i Scully zamykają go. Wkrótce giną kolejni mężczyźni. Mulder musi współpracować z dawnym nauczycielem, Billem Patersonem.
64	15	Piper Maru (Part 1)	Piper Maru (część 1)	Rob Bowman	Frank Spotnitz, Chris Carter	9 lutego 1996	16 czerwca 1997
Francuscy nurkowie odnajdują wrak samolotu z drugiej wojny światowej. Jeden z nich odkrywa, że w kadłubie samolotu nadal znajduje się żywy pilot, w jego oczach znajduje się dziwna czarna substancja, określana jako „Czarny Rak”. Po wyciągnięciu nurka na powierzchnię, teraz w jego oczach pojawiła się ta sama substancja. Wszyscy, prócz niego, zapadli na chorobę popromienną. Scully spotyka się ze starym przyjacielem ojca, który miał podobne przeżycia, podczas misji wykonywanej w trakcie drugiej wojny światowej. Francuski nurek wraca do swojego domu, i zaraża swoją partnerkę. Teraz to ona staje się nosicielem nieznanej substancji. Mulder prowadząc śledztwo wyrusza do Hongkongu, a jego tropem podąża zainfekowana kobieta. W Hongkongu Mulder spotyka Kryceka. Skinner zostaje ostrzeżony, aby dla swojego dobra porzucił sprawę morderstwa siostry Scully. Niedługo potem Skinner zostaje postrzelony. Mulderowi udaje się złapać Kryceka. Próbuje odzyskać od niego taśmę z tajnymi rządowymi dokumentami, jednak Krycek twierdzi, że ukrył ją w skrytce, w Waszyngtonie. Do toalety, do której udał się Krycek wchodzi zainfekowana kobieta i zaraża go.
65	16	Apocrypha (Part 2)	Apokryf (część 2) (DVD) Apokryfy (część 2) (Fox Polska)	Kim Manners	Frank Spotnitz, Chris Carter	16 lutego 1996	26 czerwca 1997
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder i Krycek wracają do Waszyngtonu po kasety z rządowymi dokumentami. Scully odwiedza rannego Skinnera w szpitalu. Okazuje się, że zamachowcem jest ten sam człowiek, który uczestniczył w zabiciu jej siostry. Mulder spotyka się z członkiem Syndykatu. Wychodzi na jaw, że oni także szukają Kryceka. Mulder dowiaduje się, że w czasie drugiej wojny światowej, zostało zestrzelone UFO, którego wrak leżał na dnie morza, przez dziesięciolecia. Palacz bez zgody Syndykatu, przenosi wrak UFO w inne miejsce. Krycek kontaktuje się z Palaczem, oddaje mu kasetę z danymi, w zamian otrzymuje informacje o lokalizacji statku. Mulder i Scully udają się do opuszczonej bazy wojskowej. Palacz przeszkadza agentom w złapaniu Kryceka. Czarny Rak manipulując ciałem Kryceka, wykorzystał go, aby powrócić do swojego statku.
66	17	Pusher	Popychacz (DVD) Nagabywacz (Fox Polska)	Rob Bowman	Vince Gilligan	23 lutego 1996	7 sierpnia 1997
W Wirginii, mężczyzna pod pseudonimem Nagabywacz, potrafi siłą woli zmusić kogoś do samobójstwa. Za każdym razem potrafi się wymknąć policji, bo na nich też wpływa.
67	18	Teso Dos Bichos	Teso Dos Bichos (DVD) Cmentarzysko zwierząt (Fox Polska)	Kim Manners	John Shiban	8 marca 1996	14 sierpnia 1997
Ekspedycja dr Roosevelta w Ekwadorze odnajduje szczątki Amaru – indiańskiej szamanki. Zabierają je stamtąd, pomimo że grozi to klątwą. Wkrótce pojawiają się pierwsze ofiary...
68	19	Hell Money	Piekielne pieniądze	Tucker Gates	Jeff Vlaming	29 marca 1996	21 sierpnia 1997
W chińskiej dzielnicy San Francisco zostaje spalony imigrant z Chin (nie pierwszy w tym roku). Okazuje się, że byli oni członkami gry, w której sprzedawali swoje narządy.
69	20	Jose Chung's 'From Outer Space'	Jose Chung „Z Kosmosu”	Rob Bowman	Darin Morgan	12 kwietnia 1996	28 sierpnia 1997
Dwoje nastolatków jadąc samochodem doznaje przeskoku w czasie. Po jakimś czasie, dziewczyna odnajduje się i ma obrażenia jak po zgwałceniu. Następnie odnajduje się i chłopak, którego policja oskarża o gwałt. Oboje jednak twierdzą, że zostali porwani przez kosmitów.
70	21	Avatar	Awatar	James Charleston	Howard Gordon, David Duchovny	26 kwietnia 1996	4 września 1997
Zastępca Dyrektora Walter Skinner jest w trakcie rozwodu. Z tego powodu jest w depresji i idzie, z poznaną w barze dziewczyną, do hotelu. Następnego dnia, dziewczyna leży obok niego, ze skręconym karkiem. Mulder i Scully starają się pomóc Skinnerowi.
71	22	Quagmire	Grzęzawisko	Kim Manners	Kim Newton	3 maja 1996	11 września 1997
W Georgii ginie w tajemniczych okolicznościach dr Bailey. Wcześniej zaginął również zastępowy harcerzy. Niektórzy miejscowi mieszkańcy są przekonani, że zjadł go potwór z pobliskiego bagna.
72	23	Wetwired	Pranie mózgu	Rob Bowman	Mat Beck	10 maja 1996	18 września 1997
W Maryland dochodzi do serii tajemniczych zabójstw. Okazuje się, że jeden z ich sprawców, we wszystkich swoich ofiarach, widział twarz bośniackiego zbrodniarza wojennego. Wszystko wskazuje na to, że te przywidzenia, to efekt oglądania telewizji.
73	24	Talitha Cumi (Part 1)	Powiadam ci, wstań (część 1) (DVD) Powiadam ci, wstań... (część 1) (Fox Polska)	R.W. Goodwin	Chris Carter, David Duchovny	17 maja 1996	25 września 1997
Pewien mężczyzna w barze mówi przypadkowym gościom o swoich niepowodzeniach. Nagle, w akcie rozpaczy, zaczyna do nich strzelać. Świadek tego zdarzenia, Jeremiah Smith, cudownie uzdrawia postrzelonych. Tymczasem Palacz spotyka się z matką Muldera. Wkrótce potem pani Mulder doznaje rozległego udaru.

Seria 4 (1996–1997)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
74	1	Herrenvolk (Part 2)	Lepsza rasa (część 2)	R.W. Goodwin	Chris Carter	4 października 1996	2 października 1997
Kontynuacja ostatniego odcinka trzeciej serii. Mulder i Jeremiah Smith uciekają przed mordercą i trafiają do wioski, w której pracują klony porwanych dzieci, również Samanthy. Scully odkrywa informacje nt. katalogowania ludzi, za pomocą Programu ds. Walki z Ospą. Informator Muldera – X – zostaje zamordowany. Palacz zleca uzdrowienie pani Mulder. Nową informatorką Muldera zostaje Marita Covarrubias.
75	2	Home	Dom	Kim Manners	Glen Morgan, James Wong	11 października 1996	16 października 1997
Agenci zajmują się sprawą znalezionego noworodka z wieloma deformacjami genetycznymi. W trakcie śledztwa, wychodzi na jaw, że w sąsiedztwie mieszka rodzina Peacocków, którzy od pokoleń płodzą dzieci tylko pomiędzy sobą.
76	3	Teliko	Teliko	Jim Charleston	Howard Gordon	18 października 1996	23 października 1997
Teliko to afrykańskie duchy powietrza. Następuje seria tajemniczych zgonów czarnoskórych mężczyzn, których skóra została pozbawiona barwnika.
77	4	Unruhe	Niepokój	Rob Bowman	Vince Gilligan	27 października 1996	9 października 1997
Pewna młoda kobieta robi zdjęcie do paszportu. Fotograf, który wywołał to zdjęcie zauważa, że na kliszy, twarz kobiety jest mocno zniekształcona. Te informacje prowadzą agentów FBI do człowieka o nienaturalnie długich nogach.
78	5	The Field Where I Died	Pole, na którym poległem	Rob Bowman	Glen Morgan, James Wong	3 listopada 1996	30 października 1997
FBI dokonuje nalotu na sektę Efezjan, w poszukiwaniu arsenału broni. Podczas nalotu Mulder doznaje osobliwego wrażenia, jakby kiedyś już był w tym miejscu. Agenci przesłuchują kobiety z otoczenia guru sekty. Podczas przesłuchania jedna z żon guru, Melissa, doznaje rozszczepienia osobowości. Scully wierzy, że jest to tylko zaburzenie psychicznie, jednak Mulder podejrzewa, że w kobiecie uaktywniło się jej poprzednie wcielenie. Podczas ponownego pobytu na farmie, kobieta przypomina sobie wydarzenia z poprzedniego życia. Opowiada o bitwie z okresu wojny secesyjnej, twierdząc że w poprzednim wcieleniu Mulder brał udział w tej bitwie.
79	6	Sanguinarium	Sanguinarium	Kim Manners	Valerie Mayhew, Vivian Mayhew	10 listopada 1996	6 listopada 1997
Mulder i Scully badają sprawę kliniki chirurgii plastycznej, gdzie kilku lekarzy, nieświadomie, zabiło pacjentów podczas operacji. Okazuje się, że rozwiązanie ma związek z datami urodzin i sabatem czarownic.
80	7	Musings of a Cigarette Smoking Man	Wspomnienia Palacza	James Wong	Glen Morgan	17 listopada 1996	13 listopada 1997
Odcinek poświęcony Palaczowi. Opowiada historię jego życia – o tym jak uczestniczył on w zamachu na prezydenta Kennedy’ego i Martina Luthera Kinga. Ujawnia również, że Palacz, pomimo wielu wad, ma talent literacki.
81	8	Tunguska (Part 1)	Tunguska (część 1) (DVD) Meteoryt (część 1) (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	24 listopada 1996	27 listopada 1997
Agenci Mulder i Scully rozbijają grupę terrorystyczną. Okazuje się, że Krycek jest członkiem tej grupy. Agenci dostają od niego cynk, o tajnej przesyłce dyplomatycznej, którą ma przywieźć rosyjski kurier. Okazuje się ona być skałą pozaziemską i pochodzi z meteoru tunguskiego, który spadł na Ziemię w 1908 roku. Podczas badania w laboratorium wychodzi na jaw, że w skale znajdują się mikroby Czarnego Raka. Naukowiec badający meteoryt ulega zakażeniu. Krycek idzie na współpracę z agentami, żądając w zamian ochrony. Początkowo Mulder umieszcza Kryceka w swoim mieszkaniu, a wkrótce potem udają się do Rosji. Odkrywają gułag i kopalnie, w której wydobywa się fragmenty meteorytu tunguskiego. Od jednego z więźniów Mulder dowiaduje się, że w obozie przeprowadzane są nielegalne eksperymenty na ludziach. Celem badań jest opracowanie szczepionki przeciwko Czarnemu Rakowi. Krycek dogaduje się z władzami gułagu. Tymczasem Mulder zostaje zainfekowany Czarnym Rakiem.
82	9	Terma (Part 2)	Terma (część 2) (DVD) Termy (część 2) (Fox Polska)	Jim Gross	Chris Carter, Frank Spotnitz	1 grudnia 1996	4 grudnia 1997
Kontynuacja poprzedniego odcinka. W Rosji zostaje wydane polecenie, aby były członek KGB zabił wszystkich którzy mieli kontakt ze skałą w USA. Mulder i Krycek usiłują uciec z obozu pracy na Syberii. Ulegają oni jednak wypadkowi: Mulder znajduje schronienie u tubylców, natomiast Krycek, aby przeżyć, musi dać sobie odciąć rękę.
83	10	Paper Hearts	Papierowe serca	Rob Bowman	Vince Gilligan	15 grudnia 1996	20 listopada 1997
Seryjny morderca, odsiadujący dożywocie twierdzi, że to on zamordował Samanthę. Mulder, aby odkryć prawdę, daje sobą pogrywać.
84	11	El Mundo Gira	Świat się kręci	Tucker Gates	John Shiban	12 stycznia 1997	11 grudnia 1997
W Puerto Rico grasuje obcy, zwany przez mieszkańców El Chupacabra. Jest on podejrzany o morderstwo młodej dziewczyny.
85	12	Leonard Betts	Leonard Betts	Kim Manners	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	26 stycznia 1997	8 stycznia 1998
Pracownik karetki pogotowia, świetnie znający się na medycynie, „zabiera” komórki nowotworowe ludziom chorym na raka, aby sam mógł przeżyć.
86	13	Never Again	Nigdy więcej	Rob Bowman	Glen Morgan, James Wong	2 lutego 1997	15 stycznia 1998
Pewien mężczyzna, który jest świeżo po rozwodzie, upija się w pubie i potem robi sobie tatuaż z napisem „never again” (nigdy więcej). Wkrótce zaczyna słyszeć głosy. Podejrzewa, że to właśnie tatuaż do niego mówi.
87	14	Memento Mori	Memento Mori (DVD) Pamiętaj o śmierci (Fox Polska)	Rob Bowman	Chris Carter, Frank Spotnitz, John Shiban, Vince Gilligan	9 lutego 1997	22 stycznia 1998
Scully dowiaduje się, że ma raka nosogardła. Okazuje się, że choroba może być wynikiem uprowadzenia. Kontaktuje się ona z kobietą, która także była uprowadzona i też ma raka. Mulder jest gotów poprosić o pomoc Palacza.
88	15	Kaddish	Kaddish (DVD) Modlitwa za zmarłych (Fox Polska)	Kim Manners	Howard Gordon	16 lutego 1997	18 grudnia 1997
Zostaje zabity młody Żyd, właściciel sklepu. W czasie, gdy jego rodzina opłakuje śmierć, ktoś zaczyna zabijać sprawców tej zbrodni. Ślady wskazują właśnie na zabitego Żyda.
89	16	Unrequited	Bez wzajemności (DVD) Zawiedziony (Fox Polska)	Michael Lange	Howard Gordon, Chris Carter	23 lutego 1997	19 lutego 1998
Weteran wojny w Wietnamie, posiadający niezwykłą zdolność do ukrywania się przed ludzkim wzrokiem, zabija generałów, którzy odpowiadają za pozostawienie go na pewną śmierć w czasie wojny.
90	17	Tempus Fugit (Part 1)	Tempus Fugit (DVD) Czas ucieka (część 1) (Fox Polska)	Rob Bowman	Chris Carter, Frank Spotnitz	16 marca 1997	29 stycznia 1998
Rozbija się pasażerski samolot. Mulder i Scully prowadzą w tej sprawie śledztwo. Okazuje się, że jednym z pasażerów, był stary znajomy agentów – Max Fening. Odkrywają oni, że samolot został zestrzelony wraz z UFO.
91	18	Max (Part 2)	Max (część 2)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	23 marca 1997	5 lutego 1998
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder zostaje aresztowany, za utrudnianie śledztwa. Wojsko zaciera ślady po rozbiciu się UFO, usuwając wrak z jeziora. Wychodzi na jaw, że Obcy interesowali się właśnie Maxem.
92	19	Synchrony	Synchronizacja (DVD) Synchronia (Fox Polska)	Jim Charleston	Howard Gordon, David Greenwalt	13 kwietnia 1997	12 lutego 1998
Młody naukowiec zostaje ostrzeżony przez starszego mężczyznę, że za chwilę potrąci go autobus. Tak się rzeczywiście dzieje. Okazuje się, że ów starszy człowiek przybył z przyszłości aby zapobiec wynalezieniu śmiertelnej broni.
93	20	Small Potatoes	Kicha (DVD) Nic ważnego (Fox Polska)	Cliff Bole	Vince Gilligan	20 kwietnia 1997	26 lutego 1998
Mulder i Scully zajmują się sprawą mężczyzny, który jest w stanie zmienić się w dowolnego człowieka. Jego znakiem rozpoznawczym jest jednak ogon, z którym się urodził.
94	21	Zero Sum	Zero Sum (DVD) Suma zerowa (Fox Polska)	Kim Manners	Howard Gordon, Frank Spotnitz	27 kwietnia 1997	5 marca 1998
W Wirginii, pracownica poczty zostaje zabita w toalecie. FBI wszczyna śledztwo w tej sprawie. Tymczasem Skinner zaciera ślady i pali zwłoki. Mulder sam prowadzi dochodzenie, gdyż Scully jest w szpitalu – lekarze podejrzewają przerzuty. Skinner próbuje uzyskać lekarstwo dla Scully, w tym celu musi wykonywać polecania Palacza. Mulder odkrywa, że pszczoły które zabiły pracownice poczty przenoszą zmutowany wirus ospy. Syndykat przeprowadza pierwszą próbę ataku na ludziach z użyciem pszczół. Za cel wybierają przedszkole.
95	22	Elegy	Elegia	Jim Charleston	John Shiban	4 maja 1997	12 marca 1998
W Waszyngtonie właściciel kręgielni widzi zjawę. Po chwili znajduje trupa dziewczyny, która mu się objawiła. Mulder i Scully prowadzą śledztwo w tej sprawie. Dowody doprowadzają ich do, chorego na autyzm, Harolda.
96	23	Demons	Demony	Kim Manners	R.W. Goodwin	11 maja 1997	19 marca 1998
Mulder budzi się w hotelu, w Rhode Island i nie pamięta niczego z ostatnich dwóch dni. Kiedy przyjeżdża Scully, trafiają do domku letniskowego państwa Cassandra i znajdują tam trupy właścicieli. Mulder nie dość, że zostaje aresztowany, to jeszcze oskarża swoją matkę o romans z Palaczem.
97	24	Gethsemane	Gethsemane (DVD) Getsemani (Fox Polska)	R.W. Goodwin	Chris Carter	18 maja 1997	1 września 1998
W Kanadzie grupa naukowców odnajduje zamarznięte zwłoki Obcego. Mulder wraz z towarzyszami sprowadza ciało do USA i przeprowadza amatorską sekcję. Tymczasem Scully aresztuje Michaela Kritschgau, który twierdzi, że ciało Obcego zostało spreparowane przez ludzi, którzy wstrzyknęli jej komórki rakowe. Scully identyfikuje zwłoki Muldera.

Seria 5 (1997–1998)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
98	1	Redux (Part 1)	Zmartwychwstanie (część 1)	R.W. Goodwin	Chris Carter	2 listopada 1997	8 września 1998
Akcja odcinka rozpoczyna się bezpośrednio po wydarzeniach z finału czwartej serii. Okazuje się, że Mulder sfingował swoją własną śmierć, aby odkryć prawdę o Obcych. Michael Kritschgau zachwiał bowiem jego dotychczasową wiarą. Scully brnie w kłamstwa przed komisją, aby umożliwić Mulderowi działanie. Fox próbuje również znaleźć lekarstwo dla Dany.
99	2	Redux II (Part 2)	Zmartwychwstanie (część 2)	Kim Manners	Chris Carter	9 listopada 1997	15 września 1998
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Stan Scully znacznie się pogarsza i ląduje ona w szpitalu. Palacz naprowadza Muldera, jak zdobyć lekarstwo dla Scully. Przyprowadza do niego również Samanthę i obiecuje ujawnienie prawdy o Obcych. Chce jednak, by Mulder odszedł z FBI i pracował dla niego. Nowotwór Scully ulega remisji.
100	3	Unusual Suspects	Wyjątkowi podejrzani (DVD) Nietypowi podejrzani (Fox Polska)	Kim Manners	Vince Gilligan	16 listopada 1997	22 września 1998
Odcinek poświęcony Samotnym Strzelcom. Historia zaczyna się w roku 1989, kiedy to Byers, Frohike i Langly poznają się, przy okazji pomocy w ucieczce pięknej kobiecie, Susanne Modeski, która okazuje się być groźną przestępczynią. Ściga ją Fox Mulder.
101	4	Detour	Objazd	Brett Dowler	Frank Spotnitz	23 listopada 1997	29 września 1998
Na Florydzie, w lesie dochodzi do zaginięcia trzech mężczyzn. Wszystko wskazuje na to, że porwał ich niewidzialny drapieżnik.
102	5	The Post-Modern Prometheus	Postmodernistyczny Prometeusz	Chris Carter	Chris Carter	30 listopada 1997	6 października 1998
Mulder dostaje list od kobiety z Indiany, która twierdzi, że 18 lat temu została zapłodniona w bardzo dziwnych okolicznościach. Teraz jest ponownie w ciąży i znów twierdzi, że zapłodnił ją potwór – Wielki Mutato.
103	6	Christmas Carol (Part 1)	Kolęda (część 1)	Peter Markle	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	7 grudnia 1997	13 października 1998
Scully spędza święta Bożego Narodzenia wraz z matką, z bratem i jego żoną. W pewnym momencie dostaje dziwny telefon, w którym słyszy wołanie o pomoc, swojej nieżyjącej siostry. Prosi ona by zajęła się ona sprawą Emily Sin. Dana podejrzewa, że biologiczną matką dziewczynki jest właśnie Melissa.
104	7	Emily (Part 2)	Emily (część 2)	Kim Manners	Frank Spotnitz, Vince Gilligan, John Shiban	14 grudnia 1997	20 października 1998
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Okazuje się, że to Dana jest matką Emily. Scully stara się o adopcję dziewczynki. Niestety, Emily ma wysoką gorączkę i jej stan znacznie się pogarsza. Mulder usiłuje znaleźć informację nt. jej wcześniejszego leczenia. Jest już jednak za późno – dziewczynka zapada w śpiączkę i umiera na rzadki rodzaj anemii.
105	8	Kitsunegari	Polowanie na lisa	Daniel Sackheim	Vince Gilligan, Tim Minear	4 stycznia 1998	27 października 1998
Z więziennego szpitala ucieka Robert Modell – Nagabywacz, który został wcześniej aresztowany przez Muldera. Ma on zdolność do narzucania swojej woli innym. Modell rozpoczyna Kitsunegari – polowanie na lisa (Fox = lis).
106	9	Schizogeny	Osobowość schizoidalna	Ralph Hemecker	Jessica Scott, Mike Wollaeger	11 stycznia 1998	3 listopada 1998
W Michigan pewien nastolatek jest podejrzany o zabicie swojego ojczyma. W szkole jest uważany za ofermę i Mulder nie wierzy w jego winę. Kilka dni później ojciec jego przyjaciółki, Lisy również ginie w tajemniczych okolicznościach.
107	10	Chinga	Chinga	Kim Manners	Chris Carter, Stephen King	8 lutego 1998	10 listopada 1998
Scully przebywa na wakacjach w Maine, gdzie jest świadkiem dziwnego zdarzenia w hipermarkecie. Wszyscy w środku doznają ataku szału i zaczynają wydrapywać sobie oczy. Trop prowadzi do Melissy Turner, która uważna jest za wiedźmę, i jej córki.
108	11	Kill Switch	Egzekutor	Rob Bowman	William Gibson, Tom Maddox	15 lutego 1998	17 listopada 1998
W Waszyngtonie, w barze spotykają się handlarze narkotyków, by zabić człowieka, który jest im winny pieniądze. Po chwili wpada tam policja i rozpętuje się strzelanina. Mulder i Scully znajdują tam komputer pewnego informatycznego geniusza i sądzą, że jego obecność tam nie była przypadkowa.
109	12	Bad Blood	Zła krew	Cliff Bole	Vince Gilligan	22 lutego 1998	24 listopada 1998
W Teksasie, Mulder zabija człowieka, który udawał wampira. Wraz ze Scully, mają stanąć przed Skinnerem żeby przedstawić mu raport. Starają się więc wiernie odtworzyć przebieg wydarzeń. Cały odcinek zabarwiony jest lekką nutką humoru.
110	13	Patient X (Part 1)	Pacjent X (część 1) (DVD) Pacjentka X (część 1) (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	1 marca 1998	1 grudnia 1998
W Kazachstanie dwóch chłopców widzi jak coś spada z nieba. Chwilę potem wszystko staje w płomieniach. Następnego dnia Marita Covarrubias widzi tam Kryceka. Tymczasem Scully poznaje Cassandrę Spender – kobietę wielokrotnie porywaną przez kosmitów, a także jej syna Jeffreya – agenta FBI.
111	14	The Red and the Black (Part 2)	Czerwony i czarny (DVD) Czerwone i czarne (część 2) (Fox Polska)	Chris Carter	Chris Carter, Frank Spotnitz	8 marca 1998	8 grudnia 1998
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Scully budzi się z lekkimi oparzeniami, jednak wielu ludzi na moście zostało spalonych, a Cassandra Spender zaginęła. Dana postanawia się więc poddać hipnozie, aby przywrócić wspomnienia. Członkowie Syndykatu odkrywają, że podpalaczami byli kosmici-rebelianci bez twarzy.
112	15	Travelers	Podróżnicy	Bill Graham	John Shiban, Frank Spotnitz	29 marca 1998	15 grudnia 1998
Akcja dzieje się w roku 1990. W tym właśnie czasie młody agent FBI, Fox Mulder, zaczyna się interesować jedną z pierwszych spraw Archiwum X z 1952 roku, w którą może być zamieszany jego ojciec.
113	16	Mind's Eye	Oko umysłu (DVD) Oczyma duszy (Fox Polska)	Kim Manners	Tim Minnear	19 kwietnia 1998	22 grudnia 1998
Mulder i Scully prowadzą sprawę morderstwa w stanie Delaware. Wszystkie dowody wskazują na to, że podejrzaną jest niewidoma kobieta. Mulder jednak nie wierzy w jej winę.
114	17	All Souls	Wszystkie dusze	Rob Bowman	Frank Spotnitz, John Shiban	26 kwietnia 1998	29 grudnia 1998
Pewnej nocy, szesnastoletnia, upośledzona umysłowo i fizycznie, dziewczyna wychodzi o własnych siłach na ulicę. Jej przybrany ojciec widzi jak klęka przed Czarną Figurą, później rozbłyskuje silne światło i dziewczyna pada martwa. O pomoc w rozwiązaniu tej zagadki prosi Scully znajomy ksiądz – ojciec McCue.
115	18	The Pine Bluff Variant	Odmiana z Pine Bluff (DVD) Wariant z Pine Bluff (Fox Polska)	Rob Bowman	Frank Spotnitz, John Shiban	3 maja 1998	5 stycznia 1999
Dwunastu agentów FBI obserwuje w parku podejrzanego o rozprzestrzenianie broni biologicznej. W pewnym momencie podejrzany ucieka. Scully podejrzewa, że Mulder pozwolił mu uciec. Okazuje się, że bierze on udział w ściśle tajnej operacji i jest podwójnym agentem.
116	19	Folie a Deux	Szaleństwo dzielone we dwoje Folie a Deux (DVD) Paranoja Indukowana (Fox Polska)	Rob Bowman	Vince Gilligan	10 maja 1998	12 stycznia 1999
W Illinois Gary Lambert widzi jak jego szef zamienia ludzi w zombie. Sfrustrowany tym faktem, bierze zakładników, w tym przybyłego na miejsce Muldera. W czasie akcji FBI, napastnik ginie, lecz Mulder również zaczyna widzieć ludzi jako zombie.
117	20	The End	Koniec	R.W. Goodwin	Chris Carter	17 maja 1998	19 stycznia 1999
Agenci zajmują się sprawa morderstwa rosyjskiego mistrza w czasie meczu szachowego. Rozgrywał on mecz z pewnym genialnym dwunastolatkiem, Gibsonem Praisem. Mulder, Scully i Diana Fowley prowadzą śledztwo w tej sprawie i okazuje się, że to chłopiec był celem zamachu. Tymczasem Krycek, na polecenie Syndykatu, sprowadza do kraju Palacza. Ten mówi Spenderowi, że jest jego ojcem.

Z archiwum X: Pokonać przyszłość (1998)

Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera	Premiera w Polsce
F1	The X-Files: Fight the Future	Z Archiwum X: Pokonać przyszłość	Rob Bowman	Chris Carter, Frank Spotnitz	19 czerwca 1998	25 września 1998

Seria 6 (1998−1999)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
118	1	The Beginning	Początek	Kim Manners	Chris Carter	8 listopada 1998	2 września 1999
Akcja dzieje się bezpośrednio po wydarzeniach z filmu pełnometrażowego. W Phoenix ginie człowiek którego ciało zostało rozerwane. Palacz wie, że to robota Obcego i szuka go z pomocą Gibsona Praisa. Tymczasem Mulder stara się odzyskać akta Archiwum X, które spłonęły w pożarze, jednak do pracy tam zostają skierowani Diana Fowley i Jeffrey Spender.
119	2	Drive	Przejażdżka	Rob Bowman	Vince Gilligan	15 listopada 1998	9 września 1999
W Nevadzie pan Crump wiezie swoją żonę z szaleńczą prędkością. Kiedy zatrzymuje ich policja, żona Crumpa umiera na skutek rozerwania głowy. Samemu Crumpowi też to grozi, więc porywa Muldera i każe mu jechać na zachód. Jedyne co może go uratować, to przekłucie ucha środkowego.
120	3	Triangle	Trójkąt	Chris Carter	Chris Carter	22 listopada 1998	16 września 1999
Mulder trafia na statek „Królowa Anna”, który zaginął w czasie drugiej wojny światowej na obszarze Trójkąta Bermudzkiego. Jednak czas na tym okręcie się zatrzymał i wciąż jest tam wrzesień 1939 roku.
121	4	Dreamland (Part 1)	Kraina snów (część 1)	Kim Manners	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	29 listopada 1998	23 września 1999
Mulder i Scully jadą do Nevady w celu spotkania się z informatorem, który ma im przekazać informacje nt. Strefy 51. W drodze jednak, zostają zatrzymani przez Morrisa Fletchera, z organizacji Majestic. W trakcie spotkania dochodzi do przelotu UFO, skutkiem czego, Mulder i Fletcher zamieniają się ciałami.
122	5	Dreamland II (Part 2)	Kraina snów (część 2)	Kim Manners	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	6 grudnia 1998	30 września 1999
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder zostaje aresztowany. Scully w pewnym momencie orientuje się kim jest jej partner. Stara się pomóc Mulderowi, za co zostaje dyscyplinarnie zwolniona z FBI. Tymczasem przybywa ofiar tych zamian. Scully zauważa również, że to zjawisko zaczyna się cofać.
123	6	How The Ghosts Stole Christmas	O duchu, który ukradł święta (DVD) O duchu, który skradł Boże Narodzenie (Fox Polska)	Chris Carter	Chris Carter	13 grudnia 1998	23 grudnia 1999
W Wigilię, Mulder zabiera Scully do Maryland, do domu, w którym straszy. Dokonano w nim kiedyś podwójnego morderstwa – kochankowie zabili się nawzajem. Para agentów znajduje pod podłogą dwa trupy. Były one ubrane tak samo jak oni.
124	7	Terms of Endearment	Czułe słówka	Rob Bowman	David Amann	3 stycznia 1999	7 października 1999
Młoda matka zostaje oskarżona o morderstwo swojego nowo narodzonego dziecka. Jednak ona twierdzi, że przyśniło jej się jak demon porywa noworodka.
125	8	The Rain King	Król deszczu	Kim Manners	Jeffrey Bell	10 stycznia 1999	14 października 1999
W małym miasteczku, w Kansas, Mulder i Scully prowadzą śledztwo w zagadkowej sprawie. Otóż pewien człowiek jest tam uważany za zaklinacza deszczu. Wszystkiemu zaś towarzyszą perturbacje uczuciowe bohaterów.
126	9	S.R. 819	Ustawa senatu nr 819	Daniel Sackheim	John Shiban	17 stycznia 1999	28 października 1999
Do szpitala zostaje przyjęty dyrektor Skinner, z ciężkimi objawami – we wszystkich jego żyłach są zakrzepy, które grożą zawałem. Scully stara się mu pomóc i czuwa przy jego łóżku. Mulder za to stara się wyjaśnić co spowodowało u przełożonego taki stan. Okazuje się, że ma to związek z ustawą 819, dotyczącą nanotechnologii.
127	10	Tithonus	Tithonus (DVD) Titonos (Fox Polska)	Michael Watkins	Vince Gilligan	24 stycznia 1999	21 października 1999
Scully dostaje od Kersha ostatnią szansę i zostaje przydzielona do agenta Paytona Rittera. Ma mu pomóc w rozpracowaniu sprawy fotografa, który, dziwnym zbiegiem okoliczności, zawsze jest pierwszy na miejscu zbrodni. W tajemnicy przed innymi, w sprawie pomaga jej również Mulder.
128	11	Two Fathers (Part 1)	Dwóch ojców (część 1)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz, Jeffrey Bell	7 lutego 1999	4 listopada 1999
FBI odnajduje Cassandrę Spender, która była operowana przez lekarzy, którzy spłonęli. Ona koniecznie chce się widzieć z Mulderem. Mówi jemu i Scully, że jest pierwszą hybrydą człowieka z Obcym. Palacz spotyka się z członkami Syndykatu i mówi o zbliżającej się inwazji. Jeffrey Spender dostaje kolejne polecenie od ojca i doprowadza do zwolnienia Muldera i Scully. Palacz prosi o pomoc Dianę Fowley, natomiast Cassandra twierdzi, że Mulder musi ją zabić by uratować świat.
129	12	One Son (Part 2)	Jeden syn (część 2)	Rob Bowman	Chris Carter, Frank Spotnitz	14 lutego 1999	18 listopada 1999
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder nie mógł zabić Cassandry. W chwili gdy chciał to zrobić, Diana Fowley poddała jego, ją i Scully, kwarantannie i przewiozła do ośrodka. Mulder spotkał tam Maritę Covarrubias. Wkrótce potem, Palacz wyjawia mu prawdę o Obcych i o kolonizacji. Jednak zamiast Obcych, pojawiają się Rebelianci i zabijają wszystkich członków Syndykatu i ich rodziny, a także Cassandrę. Jedynie Palacz przeżył i udał się do Jeffreya by go zabić.
130	13	Agua Mala	Zła woda	Rob Bowman	David Amann	21 lutego 1999	2 grudnia 1999
Na Florydzie szaleje huragan. W małym miasteczku zostaje zamordowane kilka osób. Ich ciała zostały wessane do kanalizacji przez nieznanego pasożyta. Gdy Mulder i Scully przybywają, huragan przybiera na sile i drogi stają się nieprzejezdne. Agenci zostają uwięzieni.
131	14	Monday	Poniedziałek	Kim Manners	John Shiban, Vince Gilligane	28 lutego 1999	9 grudnia 1999
W tym odcinku świat wpada w pętlę czasową i ten sam dzień (poniedziałek) powtarza się cały czas. Tego dnia Mulder i Scully idą do banku, by zrealizować czek. Bank zostaje opanowany przez terrorystę, który wszystkich zabija. Tylko jedna kobieta widzi powtarzające się wydarzenia i próbuje je powstrzymać.
132	15	Arcadia	Arkadia	Michael Watkins	Daniel Arkin	7 marca 1999	25 listopada 1999
W Kalifornii, na pewnym idyllicznym osiedlu dochodzi do serii zaginięć. Mulder i Scully mają za zadanie zinfiltrować mieszkańców podając się za nowożeńców – Roba i Laurę Petrie.
133	16	Alpha	Alfa	Peter Markle	Jeffrey Bell	28 marca 1999	16 grudnia 1999
Azjatycki pies, Wanshong Dhale, który był uważany za gatunek wymarły, zabija kilku ludzi. Mulder i Scully starają się złapać bardzo niebezpieczne zwierzę z miejscowym szeryfem i ekscentrycznym łowcą.
134	17	Trevor	Trevor	Rob Bowman	Ken Hawryliw, Jim Guttridge	11 kwietnia 1999	30 grudnia 1999
W więzieniu, w czasie tornada, groźny przestępca – Pinker – zabija strażnika i ucieka. Okazuje się, że może on przenikać przez ściany, a teraz szuka swojej byłej dziewczyny, która urodziła jego dziecko.
135	18	Milagro	Cud	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz, John Shiban	18 kwietnia 1999	13 stycznia 2000
Następuje seria morderstw, w których ofiary mają usuwane serca. Okazuje się, że sąsiad Muldera jest pisarzem, który opisuje właśnie te morderstwa. Scully jest nim zafascynowana.
136	19	The Unnatural	Nienaturalny	David Duchovny	David Duchovny	25 kwietnia 1999	27 stycznia 2000
Mulder interesuje się sprawą z 1947 roku, kiedy to młody oficer, Arthur Dales, zostaje zobligowany do ochrony czarnoskórego baseballisty. Gracz ten jest wielką nadzieją Czarnych na grę w zawodowej lidze, lecz polują na niego członkowie Ku Klux Klanu.
137	20	Three of a Kind	Trójka (DVD) Spiskowa trójca (Fox Polska)	Bryan Spicer	Vince Gilligan, John Shiban	2 maja 1999	20 stycznia 2000
Drugi odcinek poświęcony Samotnym Strzelcom. Kontynuacja wątków przedstawionych w odcinku 100. Po dziesięciu latach od konferencji w Baltimore, gdzie się poznali, przyjeżdżają na kolejną konferencję do Las Vegas, w poszukiwaniu Susanne Modeski – miłości Byersa. Kiedy ją tam znajdują, Byers zaczyna podejrzewać, że poddano ją praniu mózgu.
138	21	Field Trip	Praca w terenie (DVD) Wyjazd w teren (Fox Polska)	Kim Manners	Vince Gilligan, John Shiban	9 maja 1999	3 lutego 2000
W Karolinie Północnej Mulder i Scully znajdują szkielety małżeństwa. Wszystko wskazuje na to, że zostali strawieni przez organiczną substancję, o składzie podobnym do soków trawiennych. Oboje agentów ma jednak potem dziwne halucynacje.
139	22	Biogenesis (Part 1)	Biogeneza (część 1)	Rob Bowman	Chris Carter, Frank Spotnitz	16 maja 1999	10 lutego 2000
W Wybrzeżu Kości Słoniowej znalezione zostają starożytne artefakty, zawierające litery w zaszyfrowanym języku. Badający to doktorzy zostają zabici, więc w sprawę angażują się Mulder i Scully. Okazuje się, że tajemnicze znaki są w języku Indian Navajo, więc agenci zwracają się o pomoc do Alberta Hosteena, który jest jednak ciężko chory na raka. Mulder cierpi na straszliwe bóle głowy z powodu tych tabliczek i ląduje w szpitalu psychiatrycznym.

Seria 7 (1999–2000)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
140	1	The Sixth Extinction (Part 2)	Szósta zagłada (część 2)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	7 listopada 1999	2 listopada 2000
Kontynuacja ostatniego odcinka szóstej serii. Stan Muldera znacznie się pogarsza. Czuwa przy nim Skinner. Z niespodziewaną pomocą przychodzi Michael Kritschgau. We wszystko miesza się Diana Fowley, która gra na dwa fronty. Scully, po badaniach nad artefaktem, wraca do USA by pomóc Mulderowi odzyskać siły.
141	2	The Sixth Extinction II: Amor Fati (Part 3)	Szósta zagłada: Poddany miłości (część 3)	Michael Watkins	David Duchovny, Chris Carter	14 listopada 1999	9 listopada 2000
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Do Muldera przychodzi jego matka. Wkrótce potem odwiedza go również Palacz i mówi mu, że jest jego ojcem. Zabiera go do innego szpitala i chce zamienić jego materiał genetyczny ze swoim, by móc stać się hybrydą. Skinner jest szantażowany przez Kryceka. Diana pomaga Scully znaleźć Muldera. Kiedy Mulder wraca do zdrowia dowiaduje się, że Fowley i pan Hosteen nie żyją.
142	3	Hungry	Głodny	Kim Manners	Vince Gilligan	21 listopada 1999	16 listopada 2000
W bagażniku porzuconego samochodu zostają znalezione zwłoki mężczyzny pozbawionego mózgu. Plakietka leżąca obok ciała naprowadza agentów na trop miejscowego fast-foodu o nazwie „Lucky Boy”. Podejrzenia padają na jednego z pracowników, który ma za sobą wyrok, jednak Mulder sądzi, że sprawcą jest mutant odczuwający niepohamowany apetyt na mięso.
143	4	Millennium	Millennium	Tom Wright	Vince Gilligan, Frank Spotnitz	28 listopada 1999	23 listopada 2000
Odcinek nawiązujący do innego serialu ze stajni Chrisa Cartera – „Millennium”. Pojawia się w nim Frank Black, do którego Scully i Mulder zwracają się o pomoc w rozpracowaniu kilku przypadków zbezczeszczenia grobów byłych agentów FBI, którzy popełnili samobójstwo. Ślady magicznych obrzędów w pobliżu grobów wskazują, iż grupa Millenium nie zaprzestała dążenia do wywołania Armageddonu wraz z nastaniem 2000 roku i że ktoś pragnie powołać z martwych Czterech Jeźdźców Apokalipsy, którzy poprowadzą powstanie innych umarłych w Dzień Sądu.
144	5	Rush	Pęd	Rob Lieberman	David Amann	5 grudnia 1999	30 listopada 2000
Na obrzeżach spokojnego miasteczka znajdują się zapadłe jaskinie i ukryte rozpadliny, które są, jak się wydaje, siedliskiem potężnej elektromagnetycznej siły. Korzystanie z niej daje umiejętności znacznie przekraczające te normalnie posiadane przez ludzkie ciało. Umiejętności te przejmuje kilkoro nastolatków, jednak niektórzy z nich nie chcą ich wykorzystać we właściwy sposób.
145	6	The Goldberg Variation	Wariacja Goldbergowska	Thomas J. Wright	Jeffrey Bell	12 grudnia 1999	7 grudnia 2000
Trwa rozgrywka pokerowa w luksusowej siedzibie mafijnego bossa, niejakiego Cutrona. Niepozorny i nieco zdenerwowany mężczyzna, Henry, który – jak się wydaje – gra po raz pierwszy, zbiera w ręku małego pokera i wygrywa sto tysięcy dolarów. Mafia w przekonaniu, iż Henry ją wykiwał, wyrzuca nieszczęśnika z okna na trzydziestym piętrze. Dziwnym trafem jednak mężczyzna wychodzi z upadku bez szwanku. Mulder podejrzewa, że mężczyzna ma nieustające szczęście.
146	7	Orison	Orison	Rob Bowman	Chip Johannessen	9 stycznia 2000	14 grudnia 2000
Kontynuacja wątku z odcinka „Irresistible” z drugiego sezonu Archiwum. Skazany na dożywocie seryjny morderca i nekrofil, Donnie Pfaster, z którego rąk niegdyś Scully ledwie co uszła z życiem, ucieka z więzienia za sprawą hipnotycznych właściwości więziennego kapelana. Jest udręczony długim postem i chce jak najszybciej zaspokoić swoją żądzę zabijania, a przede wszystkim – dokończyć to, czego nie pozwolono mu zrobić przed laty. Prześladowana przez piosenkę „Don't look any further” Scully ponownie ma wrażenie, że w jej życiu ścierają się siły dobra i zła.
147	8	The Amazing Maleeni	Niesamowity Maleeni	Thomas J. Wright	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	16 stycznia 2000	21 grudnia 2000
Magik o pseudonimie Niesamowity Maleeni daje pokaz, w którym głównym punktem programu jest obrót głowy o 360 stopni. Jednak zaraz potem zostaje znaleziony martwy w swoim samochodzie, z głową oddzieloną od tułowia. Okazuje się, że niefortunny iluzjonista miał brata – bliźniaka, który jednak miał wypadek, w którym stracił nogi. Mulder podejrzewa, że w całej sprawie, chodzi o długi karciane.
148	9	Signs and Wonders	Znaki i cuda	Kim Manners	Jeffrey Bell	23 stycznia 2000	18 stycznia 2001
Młody członek lokalnej społeczności, niewielkiej i zgromadzonej wokół miejscowej parafii, ginie od ukąszeń grzechotników. Okazuje się, że wraz ze swoją spodziewającą się dziecka dziewczyną odszedł niedawno ze zgromadzenia Kościoła Bożego Znaków i Cudów, gdzie elementem liturgii jest taniec z jadowitymi wężami. Jednak ci, którzy wydają się najbardziej oczywistymi podejrzanymi, nie muszą być faktycznie winni.
149	10	Sein und Zeit (Part 1)	Bycie i czas (część 1)	Michael Watkins	Chris Carter, Frank Spotnitz	6 lutego 2000	28 grudnia 2000
Rodzice małej Amber Lynn LaPiere odchodzą od zmysłów, gdy ich córka znika nagle z sypialni. W sprawie jest sporo dziwnych elementów – ojciec ma wizję, w której widzi Amber martwą, a matka w swoistym transie pisze list, rzekomo od porywacza. Sprawa okazuje się być dla Muldera ciężką próbą, gdyż przypomina mu casus zniknięcia jego siostry, Samanthy. Na domiar złego, matka Foxa popełnia samobójstwo. Ten i następny odcinek są hołdem dla rodzin uprowadzanych i zamordowanych dzieci. Przywołują przykłady porwań: Amber Hagerman, (jej porwanie spowodowało wprowadzenie AMBER Alert – natychmiastowego informowania mediów o każdym podejrzanym zniknięciu dziecka), Polly Klaas oraz JonBenét Ramsey.
150	11	Closure (Part 2)	Zamknięcie (część 2)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	13 lutego 2000	4 stycznia 2001
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Mulder zmaga się z bolesną świadomością, iż samobójcza śmierć matki nie pozwoliła im wyjaśnić sobie wielu rzeczy i że wiedziała ona więcej o porwaniu Samanthy, niż mu kiedykolwiek zdradziła. Z pomocą jasnowidza, którego zdolności przebudziły się po osobistej tragedii – gdy bez śladu zniknął jego synek – Mulder odbudowuje krok po kroku zdarzenia sprzed lat. Okazuje się, że Samantha była przetrzymywana w ośrodku rządowym, z którego uciekła i wkrótce potem zmarła. Kiedy Mulder się o tym dowiaduje, odnajduje wreszcie spokój, którego tak długo szukał.
151	12	X-Cops	Z archiwum policji (DVD) Jak w serialu (Fox Polska)	Michael Watkins	Vince Gilligan	20 lutego 2000	11 stycznia 2001
Pomysłowy odcinek zrealizowany na wzór serialu dokumentalnego „Cops”, w którym kamera towarzyszy na żywo poczynaniom amerykańskich policjantów w czasie służby. Obiektem śledztwa jest niezidentyfikowane stworzenie, grasujące w czasie pełni, które potrafi przyjąć dowolną, najbardziej w danym momencie przerażającą dla ofiary formę. Strach jest tak rzeczywisty, że potrafi zabić.
152	13	First Person Shooter	FPS (DVD) Strzelanka (Fox Polska)	Chris Carter	William Gibson, Tom Maddox	27 lutego 2000	25 stycznia 2001
W testowaną tuż przed wypuszczeniem na rynek grę komputerową wkrada się niepokojący błąd. Nagle w grze pojawia się urodziwa i niezniszczalna superkobieta, która bez wahania wykańcza przeciwników. Problem jednak, że nie umierają jedynie w świecie wirtualnym, a ich doznane w grze obrażenia są prawdziwe. Samotni Strzelcy, którzy brali udział w pracach nad projektem, zwracają się o pomoc do Komórki X. Kiedy Mulder zostaje uwięziony w wirtualnym świecie, Scully wypowiada wojnę niebezpiecznej wersji Lary Croft.
153	14	Theef	Złodziej	Kim Manners	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	12 marca 2000	1 lutego 2001
Za pomocą ludowej magii pewien mężczyzna mści się na lekarzu, którego uważa za sprawcę śmierci swojej córki. Chce go ukarać, ściągając na rodzinę obiektu swojej nienawiści rzadko spotykane i trudne do wyleczenia choroby.
154	15	En Ami	Przyjaciel	Rob Bowman	William B. Davis	19 marca 2000	8 lutego 2001
Scully jest zaintrygowana cudownym ozdrowieniem chłopca chorego na raka, którego rodzice nie wierzyli w terapie medyczne, gdyż są one wbrew woli Boga. Wkrótce odkrywa, że jego wyzdrowienie nie jest cudowne i można je wyjaśnić naukowo. Chętna, ale ostrożna, aby odkryć skrywane przez niego sekrety, Scully zgadza się na podróż z Palaczem, aby pokonać wszystkie choroby ludzkości.
155	16	Chimera	Chimera	Cliff Bole	David Amann	2 kwietnia 2000	1 marca 2001
W tym odcinku agenci rozdzielają się, prowadząc osobne śledztwa. Scully spędza czas na nudnych obserwacjach w nieogrzewanym budynku, marząc o solidnej kąpieli i ciepłym łóżku, Mulder zaś bada sprawę brutalnych morderstw, które poprzedza pojawienie się kruka. Kluczem do rozwiązania zagadki mogą być prywatne tajemnice miejscowego szeryfa.
156	17	All Things	Wszystkie rzeczy (DVD) Wszystkie sprawy (Fox Polska)	Gillian Anderson	Gillian Anderson	9 kwietnia 2000	22 marca 2001
Refleksyjny odcinek, którego główną bohaterką jest Scully. Przypadkowe spotkanie z mężczyzną, który był jej wykładowcą, z którym łączyło ją wielkie uczucie i od którego uciekając zrezygnowała z praktyki medycznej na rzecz FBI, staje się dla agentki przyczynkiem do rozważań nad zasadnością jej życiowych wyborów i słusznością ścieżki, którą ostatecznie wybrała. Odcinek w reżyserii Gillian Anderson.
157	18	Brand X	Marka X	Kim Manners	Steven Maeda, Greg Walker	16 kwietnia 2000	5 kwietnia 2001
Były pracownik koncernu tytoniowego Morley umiera dramatyczną śmiercią tuż przed złożeniem obciążających firmę zeznań. Początkowe podejrzenia, iż został zamordowany, okazują się być bezpodstawne, gdy pojawiają się kolejne ofiary. Przyczyną może być genetycznie zmutowany owad, żerujący na tytoniu – świdrzyk tytoniowec, którego larwy przedostają się do układu oddechowego wraz z dymem papierosowym. Wśród śmiertelnie zagrożonych niespodziewanie znajduje się także Mulder. Przełamanie zmowy milczenia w koncernie Morleya to jedyny sposób, by go ocalić.
158	19	Hollywood A.D.	Hollywood A.D. (DVD) Hollywood naszej ery (Fox Polska)	David Duchovny	David Duchovny	30 kwietnia 2000	29 marca 2001
Oddelegowani do zbadania sprawy dewastacji i podłożenia ładunku wybuchowego w podziemiach kościoła, znajdującego się we władaniu jednego z najbardziej wpływowych kardynałów, Mulder i Scully znoszą przy sobie irytującą obecność scenarzysty z Hollywood. Scenarzysta, kolega Skinnera z jednego roku, planuje nakręcić film o FBI. Bohaterami stają się agenci Archiwum X, jednak mają problem z rozpoznaniem siebie w postaciach z ekranu. Filmową Scully zagrała Téa Leoni – prywatnie żona Davida Duchovnego, który wyreżyserował ten odcinek.
159	20	Fight Club	Klub walki	Paul Shapiro	Chris Carter	7 maja 2000	12 kwietnia 2001
Dwie identycznie wyglądające kobiety zdają się być połączone dziwnym polem siłowym. Jeśli znajdą się w swoim sąsiedztwie, wokół wybucha prawdziwe pandemonium: bójki, wybuchy i wypadki. Prawdziwy problem pojawi się jednak, kiedy obie pokochają tego samego mężczyznę.
160	21	Je Souhaite	Życzę sobie	Vince Gilligan	Vince Gilligan	14 maja 2000	26 kwietnia 2001
W opuszczonym magazynie spoczywa wiekowy dywan, a w nim zawinięty jest najprawdziwszy dżin. Dżin ten – a właściwie ta, bo to kobieta – ma zdolność spełniania wszelkiego rodzaju życzeń osoby, która ją odwinie z dywanu. Lata obcowania z ludzką chciwością i egoizmem pozbawiły jednak dżina wszelkich złudzeń co do natury człowieka.
161	22	Requiem	Requiem	Kim Manners	Chris Carter	21 maja 2000	10 maja 2001
W Oregonie, gdzie miało miejsce pierwsze śledztwo Archiwum X, dochodzi do tajemniczego zniknięcia posterunkowego. Mulder i Scully podejrzewają, że rozbił się tam statek kosmiczny. Tymczasem umierający Palacz, na nowo współpracuje z Maritą Covarrubias i Alexem Krycekiem. Agenci FBI dowiadują się, że, za zniknięcia, odpowiadają Łowcy. Mulder znika, dobrowolnie wchodząc na pokład statku kosmicznego, czego świadkiem jest Skinner. Scully odkrywa, że – wbrew wszelkim prawom logiki – jest w ciąży. Krycek zabija Palacza, spychając jego wózek inwalidzki ze schodów.

Seria 8 (2000–2001)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (TVP2)
162	1	Within (Part 1)	Wewnątrz (część 1) (DVD) Z (część 1) (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter	5 listopada 2000	6 marca 2004
FBI wszczyna poszukiwania Muldera. Szefem grupy dochodzeniowej zostaje agent specjalny John Doggett. Scully pozostaje wobec niego bardzo nieufna, więc decyduje się na szukanie zaginionego partnera wraz z Walterem Skinnerem. Tymczasem w FBI znikają tajne dokumenty dotyczące Gibsona Praisa. Agenci postanawiają jak najszybciej odnaleźć chłopca.
163	2	Without (Part 2)	Z zewnątrz (część 2) (DVD) Bez (część 2) (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter	12 listopada 2000	13 marca 2004
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Scully i Skinner odnajdują Gibsona Praisa. Chłopiec nie wie komu ufać, ponieważ boi się porwania przez Łowców. Agenci ukrywają chłopca na pustyni, tuż pod statkiem kosmicznym, na którym przebywa Mulder. Tymczasem Łowcy są coraz bliżej złapania Gibsona, gdyż mogą upodobnić się do dowolnej osoby. Gdy chłopiec jest już bezpieczny w szpitalu, Scully zabija Łowcę. Doggett zostaje oficjalnie przydzielony do Archiwum X.
164	3	Patience	Cierpliwość	Chris Carter	Chris Carter	19 listopada 2000	20 marca 2004
Scully i Doggett prowadzą śledztwo w sprawie ataków dokonywanych przez stworzenie podobne do wielkiego nietoperza, które najprawdopodobniej przez kilkadziesiąt lat spoczywało w uśpieniu. Scully czuje, iż jej lojalność wobec Muldera wymaga także odrzucenia naukowych ograniczeń i otwarcia umysłu na to, co wydaje się niemożliwe. Rolę sceptyka przyjmuje natomiast Doggett, chociaż perspektywa zmienia mu się nieco w momencie, gdy sam zostaje zaatakowany.
165	4	Roadrunners	Komiwojażer (DVD) Pędziwiatry (Fox Polska)	Rod Hardy	Vince Gilligan	26 listopada 2000	27 marca 2004
Scully zostaje pojmana przez małomiasteczkową sektę, która otacza kultem stworzenie podobne do ślimaka. Paraślimak potrzebuje żywiciela, a aktualnie zarażony nim mężczyzna jest najwyraźniej na skraju zapaści. Scully ma zająć jego miejsce. Szczęśliwie Doggettowi udaje się zlokalizować partnerkę w samą porę. To doświadczenie jest dla Scully ważną lekcją – uświadamia sobie, że musi się nauczyć ufać Doggettowi.
166	5	Invocation	Inwokacja (DVD) Wezwanie (Fox Polska)	Richard Compton	David Amann	3 grudnia 2000	3 kwietnia 2004
Chłopiec, który zniknął w tajemniczych okolicznościach dziesięć lat wcześniej, pojawia się znikąd żywy i zdrowy, chociaż ani o jeden dzień starszy. Doggett ma nadzieję zlokalizować porywacza, jednak kolejne wydarzenia każą mu wątpić w tożsamość chłopca. Ponadto okoliczności sprawy boleśnie przypominają mu jego własną rodzinną tragedię.
167	6	Redrum	Morderstwo	Peter Markle	Steve Maeda, Daniel Arkin	10 grudnia 2000	15 kwietnia 2004
Przyjaciel Doggetta, prokurator Martin Wells, jest oskarżony o zabicie swojej małżonki. Przedstawia jednak niesamowitą historię: twierdzi, iż czas biegnie dla niego w przeciwnym kierunku i dostał tę szansę, by naprawić popełnione błędy. Nie jest mu jednak łatwo przekonać Scully i Doggetta do swojej wersji. Ma z nimi kłopot za każdym razem.
168	7	Via Negativa	Via Negativa (DVD) Droga ciemności (Fox Polska)	Tony Wharmby	Frank Spotnitz	17 grudnia 2000	22 kwietnia 2004
Scully ma kłopoty ze zdrowiem i trafia do szpitala na obserwację. Pozostawiony sam sobie Doggett angażuje się w śledztwo w sprawie śmierci dwudziestu członków sekty i dwóch agentów FBI. Wygląda na to, iż guru sekty opanował umiejętność oddziaływania na ludzkie umysły skoncentrowaną energią tak zwanego trzeciego oka.
169	8	Surekill	Pewna śmierć	Terrance O’Hara	Greg Walker	7 stycznia 2001	29 kwietnia 2004
Ginie człowiek – zabójca trafił idealnie, chociaż nie mógł widzieć swojej ofiary. Z uwagi na techniczne okoliczności sprawy Scully dochodzi do wniosku, iż sprawca zabójstwa potrafi przenikać wzrokiem ściany. Podejrzenia Doggetta koncentrują się na dwóch braciach prowadzących wspólnie firmę deratyzacyjną.
170	9	Salvage	Złom (DVD) Ocalenie (Fox Polska)	Rod Hardy	Jeffrey Bell	14 stycznia 2001	6 kwietnia 2004
Weteran wojny w Zatoce, Ray Pearce umiera. Jego żona twierdzi, że śmierć nastąpiła z powodu zespołu stresu pourazowego. Kiedy jednak ginie również przyjaciel Pearce’a, Scully i Doggett zaczynają wątpić, czy Ray faktycznie nie żyje. Śledztwo doprowadza ich do firmy Chambers Technologies, gdzie są prowadzone badania nad inteligentnym metalem. Okazuje się, że mężczyźni poddali się eksperymentowi, który miał uczynić z nich niezniszczalnych ludzi.
171	10	Badlaa	Zemsta	Tony Wharmby	John Shiban	21 stycznia 2001	13 maja 2004
W pokoju hotelowym umiera mężczyzna, który dopiero co wrócił z podróży do Indii. Sekcja zwłok dowodzi istnienia rozległych obrażeń w ciele ofiary, a na dodatek stopień stężenia pośmiertnego sugeruje czas śmierci wcześniejszy, niż by to wynikało z relacji świadków. Scully wysnuwa teorię, że ktoś (lub coś) ukrył się we wnętrzu mężczyzny i potem wydostał na wolność. Kluczem do zagadki wydaje się być 11-letni chłopiec z ubogiej hinduskiej kasty, jeżdżący na wózku inwalidzkim.
172	11	The Gift	Dar	Kim Manners	Frank Spotnitz	4 lutego 2001	20 maja 2004
Doggett bada okoliczności wyprawy, którą Mulder podjął niedługo przed swoim zniknięciem. Wygląda na to, iż szukał dla siebie pomocy u legendarnego stworzenia, które ma moc leczenia wszelkich chorób. Jednak kontakt z tą istotą uświadomił Mulderowi, iż każde wyleczone schorzenie uzdrowiciel przejmuje na siebie i przez to jego życie jest jednym wielkim cierpieniem. Postanowił zabić tę istotę, by jej ulżyć. Doggett podejmuje działania bardziej zgodne z formalną procedurą, lecz przypłaca to jednak życiem. Niespodziewanie właśnie uzdrowiciel przychodzi mu z pomocą.
173	12	Medusa	Meduza	Richard Compton	Frank Spotnitz	11 lutego 2001	27 maja 2004
Policjant patrolujący peron metra zostaje zaatakowany i ginie gwałtowną śmiercią. Na jego ciele widać ślady żrącej substancji. Naczelnik policji jest bardzo niechętny zarządzonemu przez FBI wstrzymaniu kursowania pociągów. Doggett bada podziemia metra i odnajduje kolejne zwłoki, a Scully na zmianę walczy z upartym naczelnikiem i szuka możliwego wyjaśnienia tajemniczych zgonów.
174	13	Per Manum	Per Manum (DVD) Poprzez (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	18 lutego 2001	3 czerwca 2004
Z Dogettem i Scully kontaktuje się mężczyzna, który twierdzi, iż jego żona została zamordowana wkrótce po tym, gdy urodziła dziecko. Tyle, że nie on był jego ojcem, lecz kosmita. Okazuje się, że nie był to jedyny tego rodzaju przypadek. Sama Scully zaczyna się zastanawiać, czy zajście przez nią samą w ciążę nie miało podobnego początku.
175	14	This Is Not Happening (Part 1)	To się nie dzieje (część 1)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	25 lutego 2001	17 czerwca 2004
W Montanie znaleziono Teresę Hoese, uprowadzoną przez Obcych krótko przed Mulderem. Scully, Doggett i Skinner odwiedzają ją w szpitalu. Kobieta jest ciężko ranna w wyniku obrażeń odniesionych podczas badań na statku kosmitów. Teresę odnajduje też dawny znajomy agentów, Jeremiah Smith. W Montanie pojawiło się ostatnio mnóstwo doniesień o przybyszach z kosmosu. Scully i Skinner docierają na miejsce, gdzie znaleziono Teresę. Czeka na nich również Monica Reyes, agentka FBI z Nowego Orleanu, która specjalizuje się w sprawach morderstw rytualnych. Doggett znajduje zwłoki Muldera.
176	15	DeadAlive (Part 2)	Martwy-żywy (część 2) (DVD) Żyjący umarli (część 2) (Fox Polska)	Tony Wharmby	Chris Carter, Frank Spotnitz	1 kwietnia 2001	24 czerwca 2004
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Na pogrzebie Muldera spotkali się Doggett, Skinner oraz Scully. Szczególnie dla Scully jest to bolesne przeżycie, ponieważ Kersh chce na zawsze zamknąć Archiwum X. Rybacy u wybrzeży Karoliny Północnej złowili w sieci ciało. W kostnicy topielec ożywa. Okazuje się, że jest to Billy Miles, porwany przez Obcych razem z Mulderem. Skinner i Doggett zabierają zwłoki Muldera do szpitala wojskowego. Okazuje się, że ciało agenta żyje, ale jego mózg znajduje się w stanie rozkładu. Krycek proponuje Skinnerowi szczepionkę dla Muldera, lecz w zamian chce, by Scully nie urodziła dziecka.
177	16	Three Words	Trzy słowa	Rod Hardy	Chris Carter, Frank Spotnitz	8 kwietnia 2001	8 lipca 2004
Mężczyzna ginie od postrzału na trawniku przed Białym Domem. Przed śmiercią udaje mu się przekazać jednemu z agentów ochrony płytę z napisem: „Fight The Future”. W tym czasie Mulder szybko powraca do zdrowia, ale wciąż pamięta koszmarne doświadczenia, które Obcy przeprowadzali na nim. Scully zabiera go do siebie. Obawia się mu wyznać, że ma już nowego partnera w FBI. Mulder nie będzie zachwycony, gdy odkryje, że ktoś zajął jego miejsce w Archiwum X i nie kryje, że jest wściekły na Doggetta. Tymczasem Absalom ucieka z więzienia.
178	17	Empedocles	Empedokles	Barry Thomas	Greg Walker	22 kwietnia 2001	15 lipca 2004
W Nowym Orleanie doszło do strzelaniny. Na miejscu zbrodni zjawia się agent specjalny Monica Reyes, gdyż prowadzący sprawę policjant uważa, że morderstwo ma coś wspólnego z okultyzmem. Reyes nie widzi w zabójstwie niczego diabolicznego do czasu, gdy spostrzega, że ciało jednej z ofiar zamienia się w proch. Scully z powodu problemów zdrowotnych trafia do szpitala. Reyes prosi Muldera o pomoc, gdyż sądzi, że sprawa może mieć związek z zabójstwem syna Doggetta. Sprawca strzelaniny jest coraz bardziej zdesperowany – wydaje mu się, że cała jego twarz płonie.
179	18	Vienen	Nadchodzą	Tony Wharmby	Steven Maeda	29 kwietnia 2001	22 lipca 2004
Na platformie wiertniczej w Zatoce Meksykańskiej dzieją się dziwne rzeczy. Mulder zakrada się do Archiwum X, by przejrzeć akta podobnych spraw. Doggett oficjalnie rozpoczyna śledztwo w tej sprawie i odkrywa, że Mulder zjawił się przed nim na platformie, gdzie doszło do tajemniczego zgonu. Mężczyźni zaczynają ze sobą współpracować. Zdaniem Foxa na dnie morza znajduje się wirus obcych – czarna ropa. Jeśli zostanie wydobyty, zainfekuje miliony ludzi. Doggett nie wierzy w tę hipotezę, ale zachowanie świadka dramatycznych wydarzeń wydaje mu się podejrzane.
180	19	Alone	Samotnie (DVD) Sam (Fox Polska)	Frank Spotnitz	Frank Spotnitz	6 maja 2001	29 lipca 2004
Scully odchodzi na urlop macierzyński, a w jej zastępstwie Doggettowi zostaje przydzielona tymczasowa partnerka, Leyla Harrison. Wraz z Doggettem badają sprawę zgonów, w których znaczącą rolę zdaje się odgrywać jad jaszczurki. Wkrótce potem oboje znikają. Mulder włącza się w sprawę i odnajduje parę pechowych agentów uwięzionych w jaskini i oślepionych przez jad. W pobliżu zaś krąży zmutowany człowiek-jaszczur, który jest najwyraźniej głodny.
181	20	Essence (Part 1)	Sedno (część 1) (DVD) Istota rzeczy (część 1) (Fox Polska)	Kim Manners	Chris Carter	13 maja 2001	5 sierpnia 2004
Zbliża się termin porodu Scully i w związku z tym wprowadza się do niej pielęgniarka Lizzy, która wkrótce potem zostaje przyłapana, gdy podrzuca agentce nieznane leki. Przesłuchiwana przez Muldera i Doggetta kobieta przyznaje, że pracuje w laboratorium Haskela, które od lat zajmuje się klonowaniem ludzi. Działalność tej instytucji była opłacana przez organizację, która starała się zapobiec inwazji przybyszów z kosmosu, ale prawie wszyscy jej członkowie zostali zamordowani przez obcych.
182	21	Existence (Part 2)	Istnienie (część 2)	Chris Carter	Chris Carter	20 maja 2001	12 sierpnia 2004
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Wraz z narodzinami dziecka agentki Scully wszystkie najważniejsze tajemnice Archiwum X zostaną odsłonięte. Szczątki Billy’ego Milesa, który ją ścigał, trafiają do kostnicy w Waszyngtonie, gdzie on niedługo potem w zawrotnym tempie odtwarza ludzką powłokę i rusza do siedziby FBI. Mulder, Doggett i Skinner dowiadują się, że jest on super-żołnierzem i jest praktycznie niezniszczalny. Agentka Reyes wywozi Scully w bezpieczne miejsce w Georgii. Po przywiezieniu kobieta zaczyna rodzić. Jej prześladowca i inni odnaleźli ją. Gdy Scully rodzi chłopca, super-żołnierze odchodzą, nie zabierając dziecka.

Seria 9 (2001–2002)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (Tele5)
183	1	Nothing Important Happened Today (Part 1)	Nic ważnego się dziś nie wydarzyło (część 1)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	11 listopada 2001	6 maja 2013
John Doggett prowadzi wewnętrzne dochodzenie odnośnie do dyrektora Alvina Kersha. Okazuje się, że wszystkie dowody zostały zatuszowane. Doggett próbuje skontaktować się z Mulderem, lecz nie potrafi go znaleźć. Skinner prosi Doggetta, aby zaprzestał dochodzenia, bo doprowadzi to do czyjejś śmierci. Pewna kobieta systematycznie topi mężczyzn. Sprawę przejmuje Archiwum X. Scully obawia się, że z Williamem jest coś nie tak.
184	2	Nothing Important Happened Today II (Part 2)	Nic ważnego się dziś nie wydarzyło (część 2)	Tony Wharmby	Chris Carter, Frank Spotnitz	18 listopada 2001	7 maja 2013
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Wewnątrz FBI rozpoczyna się śledztwo dotyczące nadużywania władzy przez agentów z Archiwum X. Shannon McMahon, która służyła niegdyś z Doggettem, wyjawia mu, że jest prototypem super-żołnierza. Prosi go, aby ujawnił śmierć mężczyzn, których zabiła oraz to, czym się zajmowali. Wszystko prowadzi do laboratorium znajdującego się na pokładzie statku marynarki wojennej.
185	3	Daemonicus	Demoniczny (DVD) Demon (Fox Polska)	Frank Spotnitz	Chris Carter, Frank Spotnitz	2 grudnia 2001	8 maja 2013
Seria rytualnych zabójstw wydaje się być związana z kultem satanistycznym, podejrzenia Doggetta kierują się jednak w stronę charyzmatycznego profesora, osadzonego w zakładzie dla psychicznie chorych. Wiele wskazuje na to, iż posiadł on zdolność manipulowania umysłami na odległość i materializacji ektoplazmy. Reyes sugeruje, iż może to być przypadek opętania przez czyste zło.
186	4	4-D	Czwarty wymiar	Tony Wharmby	Steven Maeda	9 grudnia 2001	9 maja 2013
Monica Reyes nie żyje, Doggett postrzelony walczy ze śmiercią. Tak naprawdę jednak wszystko dzieje się w alternatywnej rzeczywistości. Podczas gdy Doggett ledwo żywy egzystuje pod aparaturą, Monica wpada na pomysł, iż mogło dojść do przecięcia się rzeczywistości faktycznej z alternatywną i przypuszczalny zabójca posiadł zdolność przemieszczania się między jednym wymiarem czasowym a drugim.
187	5	Lord of the Flies	Władca much	Kim Manners	Thomas Schnauz	16 grudnia 2001	10 maja 2013
Pewien chłopiec zdaje się kontrolować zachowanie much i poddawać je swojej woli. Z tego powodu ginie kilkoro nastolatków. Doggett i Reyes usiłują dojść, na ile jego działania są świadome. Okazuje się, że nie tylko on posiada takie zdolności.
188	6	Trust No 1	Nie ufaj nikomu	Tony Wharmby	Chris Carter, Frank Spotnitz	6 stycznia 2002	13 maja 2013
Scully ma nadzieję na ponowne spotkanie z Mulderem, kiedy pojawia się nieznajomy – Człowiek-Cień, który oferuje nowe informacje dotyczące tego, co skłoniło Muldera do ukrywania się. Jednakże jej zaufanie do obcego może doprowadzić do tego, że Mulder znajdzie się w jeszcze większym niebezpieczeństwie. Slogan epizodu brzmi: „Oni obserwują”.
189	7	John Doe	N/N (DVD) Tożsamość nieznana (Fox Polska)	Michelle Maclaren	Vince Gilligan	13 stycznia 2002	14 maja 2013
Agent Doggett budzi się w małym miasteczku w Meksyku, nie pamiętając kompletnie kim jest i skąd się tam wziął. W przebłyskach powraca do niego wizja małego chłopca – to jego zamordowany syn, Luke. John zmuszony jest pracować dla kartelu narkotykowego. Kluczem do zagadki okazuje się być szef kartelu, potrafiący kraść wspomnienia.
190	8	Hellbound	Granice piekła (DVD) Skazani na piekło (Fox Polska)	Kim Manners	David Amman	27 stycznia 2002	15 maja 2013
Reyes bada sprawę zabójstw, których ofiary są żywcem obdzierane ze skóry. Podobne przypadki miały miejsce w latach sześćdziesiątych, a także w poprzednim stuleciu. Obecne ofiary zdają się być reinkarnacją ówczesnych zabójców. Monica jest szczególnie zainteresowana tą sprawą, gdyż sądzi, że sama może być taką reinkarnacją.
191	9	Provenance (Part 1)	Pochodzenie (część 1)	Kim Manners	Chris Carter, Frank Spotnitz	3 marca 2002	16 maja 2013
W Dakocie Północnej motocyklista próbuje nielegalnie przekroczyć granicę między Kanadą i USA, lecz ulega wypadkowi. Okazuje się, że przewoził ze sobą kopie hieroglifów z poszycia statku kosmicznego pozaziemskiej cywilizacji, takie jak te, które zostały 2 lata wcześniej znalezione na statku odkrytym przez rybaka na wybrzeżu w Afryce. FBI prowadzi własne dochodzenie ukrywając je przed agentami z Archiwum X. Tymczasem Scully jest zmuszona do podjęcia drastycznych środków, kiedy odkrywa, że coś grozi Williamowi.
192	10	Providence (Part 2)	Opatrzność (część 2)	Chris Carter	Chris Carter, Frank Spotnitz	10 marca 2002	17 maja 2013
Kontynuacja poprzedniego odcinka. Ciężko ranny Doggett leży w szpitalu. Nieufna w stosunku do Skinnera i Follmera, Scully omija dochodzenie FBI w sprawie porwania Williama i przeprowadza własne, wspomagana przez Monicę Reyes i Samotnych Strzelców. Okazuje się, że dziecko porwał lider sekty uważającej, że tylko syn Dany, może uchronić ludzkość przed Obcymi. W sprawę angażuje się członek Nowego Syndykatu – Człowiek z wykałaczką.
193	11	Audrey Pauley	Audrey Pauley	Steve Maeda	Kim Manners	17 marca 2002	20 maja 2013
Monica Reyes po wypadku samochodowym przebywa w stanie śpiączki. Podczas gdy Doggett zamartwia się u jej wezgłowia, ona przebudza się w opuszczonym budynku o wyglądzie szpitala. Z dwóch innych obecnych tam pacjentów jeden wkrótce umiera. Tylko posługaczka pracująca na oddziale intensywnej terapii ma dostęp do świata, w którym przebywają dusze ludzi na granicy życia i śmierci i tylko ona może przekazać Doggettowi wiadomość, iż ktoś bezprawnie eksperymentuje na chorych.
194	12	Underneath	Pod spodem (DVD) Pod powierzchnią (FOX Polska)	John Shiban	John Shiban	31 marca 2002	21 maja 2013
Na wolność wychodzi aresztowany przed trzynastoma laty seryjny morderca. Analiza DNA wykazała bowiem, iż jest niewinny. Doggett, który osobiście schwytał maniaka, ma jednak wątpliwości co do wyniku tych badań. Wygląda na to, iż zabójca potrafi w zależności od potrzeb przyjąć postać dwóch różnych mężczyzn, zapewniając sobie tym samym żelazne alibi.
195	13	Improbable	Nieprawdopodobny	Chris Carter	Chris Carter	7 kwietnia 2002	22 maja 2013
Śledztwo wspólnie prowadzone przez Reyes i Scully. Monica sugeruje, iż kluczem do rozwiązania sprawy seryjnych śmierci jest numerologia. Dana odkrywa, iż na ciele każdej ofiary widnieje znak 666. Sytuacja robi się krytyczna, gdy obie agentki zostają uwięzione na ogromnym podziemnym parkingu, gdzie ukrył się również psychopatyczny morderca. Gościnny występ Burta Reynoldsa i rozrywkowa muzyka zabarwiają odcinek nutką humoru.
196	14	Scary Monsters	Straszne potwory (DVD) Przerażające potwory (Fox Polska)	Tom Schnauz	Tom Schnauz	14 kwietnia 2002	23 maja 2013
Pewien mały chłopiec, trzymany w izolacji i zamknięciu przez swojego ojca, opowiada z przekonaniem, że jego matka padła ofiarą ataku przerażających potworów. Wszyscy uznają to za przejaw wybujałej wyobraźni dziecka. I faktycznie jest wybujała, ale w trochę inny sposób niż mogłoby się wydawać. Twory wyobraźni chłopca stają się prawdziwe, kiedy tylko je narysuje.
197	15	Jump the Shark	Skok przez rekina (DVD) Przeskoczenie rekina (Fox Polska)	Cliff Bole	Vince Gilligan, John Shiban, Frank Spotnitz	21 kwietnia 2002	24 maja 2013
Tytuł odcinka nawiązuje do serialu Happy Days, w którym jeden z bohaterów wykonuje przysłowiowy skok przez rekina. Morris Fletcher zwraca się do agentów Reyes i Doggetta prosząc o ochronę. Przez przypadek wspomina o Super Żołnierzach. Pada nazwisko tajemniczej Yves Adele Harlow. Do akcji wkraczają Samotni Strzelcy – mają za zadanie ją wytropić. Okazuje się, że jest ona wplątana w wątek bioterrorystyczny. Odcinek kończy wątek, który został rozpoczęty w ostatnim odcinku innego serialu ze stajni Chrisa Cartera – „Samotni Strzelcy”, który to zakończył się cliffhangerem.
198	16	William	William	David Duchovny	David Duchovny, Frank Spotnitz, Chris Carter	28 kwietnia 2002	27 maja 2013
Doggett zostaje napadnięty w biurze Archiwum X przez dziwnie zniekształconego mężczyznę. Twierdzi, że zna Muldera i przyszedł szukać dowodów na to, co mu zrobiono. Scully zabiera go do Quantico, aby dokładnie przebadać. Badania jego DNA ujawniają, że jest to były agent FBI – Jeffrey Spender, syn Palacza. Chce się on zemścić na swoim ojcu. Ponadto chodzi mu również o Williama.
199	17	Release	Wyzwolenie (DVD) Uwolnienie (Fox Polska)	Kim Manners	John Shiban, David Amann	5 maja 2002	28 maja 2013
Odcinek w którym Doggett wreszcie dowiaduje się prawdy o okolicznościach śmierci syna i zaznaje ostatecznego spokoju. Pracuje on nad sprawą morderstwa, która z początku nie wydaje się być niezwykła. Jednak pewien kadet FBI twierdzi, że zbrodnia ma ścisły związek ze śmiercią Luke’a Doggetta. John rozpaczliwie usiłuje dotrzeć do prawdy i wymierzyć sprawiedliwość sprawcy.
200	18	Sunshine Days	Słoneczne dni	Vince Gilligan	Vince Gilligan	12 maja 2002	29 maja 2013
Doggett i Reyes badają sprawę dziwnych zgonów. Ofiary dosłownie wyleciały z domu, w którym widzieli rodzinę Bradych, z serialu „Grunt to rodzinka”. Okazuje się, że mieszkaniec domu posiada zdolności telekinetyczne i zgadza się by go przebadać w Waszyngtonie. Jednak za każdym razem gdy ich użyje, jego stan zdrowia ulega pogorszeniu. W obawie o jego życie agenci Archiwum X odstępuje od przeprowadzania dalszych testów.
201 202	19 20	The Truth (Part 1-2)	Prawda (część 1-2)	Kim Manners	Chris Carter	19 maja 2002	30 maja 2013 31 maja 2013
Mulder, który znika na początku dziewiątego sezonu, by swoją osobą nie zagrażać Scully i dziecku, zdobywa informacje o dacie planowanej kolonizacji – 22 grudnia 2012. W Bluemont w Virginii, chyłkiem przemyka się do rządowego budynku i rozpoczyna inspekcję. W pewnej chwili atakuje go jednak Knowle Rohrer – super-żołnierz i członek Nowego Syndykatu, praktycznie niezniszczalny. W walce z Rohrerem pomaga Mulderowi duch Kryceka. Zrzucony na kable elektryczne Rohrer wydaje się być martwy, więc Mulder zostaje natychmiast aresztowany pod zarzutem morderstwa. Mulder prosi Skinnera, by go bronił. Proces, który potem następuje, zamienia się w farsę, pomimo zeznań Marity Covarrubias, Jeffreya Spendera i Gibsona Praise'a. Mulder zostaje skazany na śmierć, lecz z pomocą przyjaciół ucieka z celi śmierci. Wraz ze Scully, odwiedza również Palacza. Zostają wtedy zaatakowani przez Rohrera i innych. Palacz ginie, a para agentów ucieka w nieznanym kierunku.

Z Archiwum X: Chcę wierzyć (2008)

Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera	Premiera w Polsce
F2	The X-Files: I Want to Believe	Z Archiwum X: Chcę wierzyć	Chris Carter	Chris Carter, Frank Spotnitz	24 lipca 2008	25 lipca 2008

Seria 10 (2016)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (Fox Polska)
203	1	My Struggle	Moje zmagania	Chris Carter	Chris Carter	24 stycznia 2016	25 stycznia 2016
Ze Scully kontaktuje się Skinner. Dziennikarz śledczy; Tad O’Malley, wpadł na trop globalnego spisku i pragnie rozmawiać z Mulderem. Byli agenci spotykają się z młodą kobietą utrzymującą, że wielokrotnie była uprowadzana przez kosmitów.
204	2	Founder's Mutation	Mutacja	James Wong	James Wong	25 stycznia 2016	26 stycznia 2016
Scully i Mulder zajmują się zagadką samobójczej śmierci pewnego naukowca i natrafiają na sprawę eksperymentów genetycznych przeprowadzanych na dzieciach.
205	3	Mulder and Scully Meet the Were-Monster	Potwór	Darin Morgan	Darin Morgan	1 lutego 2016	2 lutego 2016
W lesie zostają znalezione zwłoki. Agenci poszukują sprawcy, nie mając przy tym pewności, czy jest nim człowiek, czy zagadkowa istota, o której opowiadają mało wiarygodni świadkowie.
206	4	Home Again	Z powrotem w domu	Glen Morgan	Glen Morgan	8 lutego 2016	9 lutego 2016
Mulder i Scully poszukują zabójcy urzędnika miejskiego, zajmującego się przesiedlaniem bezdomnych. Tymczasem giną kolejne osoby zajmujące się tym tematem.
207	5	Babylon	Babilon	Chris Carter	Chris Carter	15 lutego 2016	16 lutego 2016
Ze Scully i Mulderem kontaktuje się para młodych agentów. Proszą o pomoc w rozbiciu siatki islamskich radykałów, przygotowujących zamachy samobójcze. Jeden z nich, w stanie krytycznym, znajduje się w szpitalu. Agenci, każdy na swój sposób, próbują się z nim skomunikować i nakłonić do złożenia zeznań.
208	6	My Struggle II (Part 2)	Moje zmagania, część 2	Chris Carter	Chris Carter, Margaret Fearon, Anne Simon	22 lutego 2016	23 lutego 2016
W mieście coraz więcej osób zapada na groźną chorobę. Scully odkrywa, że może ona być konsekwencją prowadzonych od lat eksperymentów rządowych.

Seria 11 (2018)

№	Nr	Tytuł	Tytuł polski	Reżyseria	Scenariusz	Premiera (FOX)	Premiera w Polsce (Fox Polska)
209	1	My Struggle III (Part 3)	Moje zmagania III (Część 3)	Chris Carter	Chris Carter	3 stycznia 2018	4 stycznia 2018
210	2	This	To	Glen Morgan	Glen Morgan	10 stycznia 2018	11 stycznia 2018
211	3	Plus One	Plus jeden	Kevin Hooks	Chris Carter	17 stycznia 2018	18 stycznia 2018
212	4	The Lost Art of Forehead Sweat	Efekt Mandeli	Darin Morgan	Darin Morgan	24 stycznia 2018	25 stycznia 2018
213	5	Ghouli	Ghule	James Wong	James Wong	31 stycznia 2018	1 lutego 2018
214	6	Kitten	Kociak	Carol Banker	Gabe Rotter	7 lutego 2018	8 lutego 2018
215	7	Rm9sbG93ZXJz	Zabójcza gra	Glen Morgan	Shannon Hamblin, Kristen Cloke	28 lutego 2018	1 marca 2018
216	8	Familiar	Atak w Connecticut	Holly Dale	Benjamin Van Allen	7 marca 2018	8 marca 2018
217	9	Nothing Lasts Forever	Nic nie trwa wiecznie	James Wong	Karen Nielsen	14 marca 2018	15 marca 2018
218	10	My Struggle IV	Moje zmagania IV (Część 4)	Chris Carter	Chris Carter	21 marca 2018	22 marca 2018

Odcinki specjalne

N/o	Tytuł	Reżyseria	Scenariusz	Premiera	Premiera w Polsce
S1	Secrets of the X Files, Part 1 (część 1)	–	Chris Carter, Bart Montgomery, Ron Scalera	19 maja 1995	nieemitowany
Specjalny odcinek dokumentalny przypominający najważniejsze momenty dwóch pierwszych serii. Zawiera również opinie twórców i aktorów w nim występujących.
S2	Secrets of the X Files, Part 2 (część 2)	Glen Kasper	Chris Carter	10 maja 1996	nieemitowany
Specjalny odcinek dokumentalny przedstawiający zarys głównych wątków z pierwszych trzech sezonów serialu, a także wywiady z obsadą i ekipą realizacyjną.
S3	Uwikłani w archiwum X (Inside the X Files)	Glen Kasper	Chris Carter, Frank Spotnitz, John Shiban	1 lutego 1998	3 września 2010 (SciFi Universal)
Specjalny odcinek dokumentalny przedstawiający kulisy powstania serialu, wywiady z twórcą oraz obsadą, nieemitowane wcześniej sceny, zabawne momenty, a także zwiastuny i ujęcia z filmu (ówcześnie nadchodzącego) Z Archiwum X: Pokonać przyszłość.
S4	The X-Files: Re-Opened	–	–	28 grudnia 2015	nieemitowany
Specjalny odcinek pokazujący zarys głównych wątków dziesiątego sezonu, przedstawia nowe postacie, wypowiedzi aktorów kreujących zarówno stare jak i nowe role, a także twórcy serialu.