套件：bowtie（1.3.1-3 以及其他的）

bowtie 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 bowtie：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [bowtie-bio.sourceforge.net]

相似套件：

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

標籤: 領域: 生物學, 生物資訊學, 實做語言: implemented-in::c , interface::commandline, 角色: 程式, 科學: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

其他與 bowtie 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, hppa, sh4, x32]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
dep: libgcc1 [x32]

套件暫時不可用

dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1) [sh4]
dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

套件暫時不可用
dep: libstdc 6 [x32]

GNU Standard C Library v3

dep: libstdc 6 (>= 13.1) [除 arm64, hppa, sh4, x32]

dep: libstdc 6 (>= 14) [arm64]

dep: libstdc 6 (>= 4.4.0) [hppa, sh4]
dep: python3 [除 hppa, sh4, x32]

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [除 hppa, sh4, x32]

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

sug: bowtie-examples

Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

下載 bowtie

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	1.3.1-3	1，333。8 kB	8，673。0 kB	[檔案列表]
amd64	1.3.1-3	1，588。9 kB	6，845。0 kB	[檔案列表]
arm64	1.3.1-3 b1	1，305。9 kB	6，738。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	1.0.0-6	894。0 kB	3，548。0 kB	[檔案列表]
mips64el	1.3.1-3	1，050。6 kB	8，129。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.3.1-3	1，328。0 kB	8，145。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	1.3.1-3	1，370。8 kB	7，889。0 kB	[檔案列表]
riscv64	1.3.1-3	1，510。0 kB	5，365。0 kB	[檔案列表]
s390x	1.3.1-3	1，530。6 kB	6，969。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	1.0.0-6	860。1 kB	3，077。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.3.1-3	1，149。4 kB	14，721。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	1.0.1-2	878。8 kB	3，264。0 kB	[檔案列表]