Пакунок: boxshade (3.3.1-14)

Links for boxshade

Debian Resources:

Download Source Package boxshade:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ch.embnet.org]

Similar packages:

Красиві роздруківки декількох угрупувань послідовностей

Boxshade — це програма для створення „гарненьких“ роздруківок множинного вирівнювання послідовностей білка чи ДНК. Програма не виконує вирівнювання самостійно, а вимагає, щоб вхідний файл створювався програмою множинного вирівнювання або був відредагований вручну відповідними інструментами.

Boxshade читає багато разів вирівняні послідовності з файлів у форматах PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED та ESEE (максимум 150 послідовностей до 10000 елементів кожна). Для виділення ідентичних/подібних залишків можна використовувати різні види затінення. Результат виводиться на екран або у файл в наступних форматах: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-друкарка, ASCII, xFIG, PICT, HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Інші пакунки пов'язані з boxshade

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

sug: kalign

Global and progressive multiple sequence alignment

or clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

or mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

or hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

Facility for Interactive Generation of figures under X11

Завантажити boxshade

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	54.5 kB	161.0 kB	[список файлів]
arm64	53.1 kB	160.0 kB	[список файлів]
armel	54.6 kB	163.0 kB	[список файлів]
armhf	52.9 kB	135.0 kB	[список файлів]
i386	56.0 kB	176.0 kB	[список файлів]
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[список файлів]
mipsel	52.9 kB	173.0 kB	[список файлів]
ppc64el	56.4 kB	193.0 kB	[список файлів]
s390x	52.9 kB	168.0 kB	[список файлів]