Пакунок: gmap (2021-12-17 ds-3)

Links for gmap

Debian Resources:

Download Source Package gmap:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Shaun Jackman (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Alexandre Mestiashvili (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [research-pub.gene.com]

Similar packages:

spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads

This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of

 * known splice sites and identify novel splice sites.
 * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).

GSNAP can align bisulfite-treated DNA.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Інші пакунки пов'язані з gmap

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.34)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити gmap

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	11,077.9 kB	89,482.0 kB	[список файлів]
arm64	6,950.3 kB	58,950.0 kB	[список файлів]
armel	5,407.5 kB	44,524.0 kB	[список файлів]
armhf	5,788.3 kB	42,476.0 kB	[список файлів]
i386	6,086.9 kB	43,904.0 kB	[список файлів]
mips64el	5,331.8 kB	55,440.0 kB	[список файлів]
mipsel	5,324.2 kB	46,108.0 kB	[список файлів]
ppc64el	7,299.8 kB	60,998.0 kB	[список файлів]