Paket: bedtools (2.30.0 dfsg-1)

Länkar för bedtools

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet bedtools:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Charles Plessy (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c , interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med bedtools

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbz2-1.0

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha 20120614)

XZ-format compression library
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

GNU standardbibliotek v3 för C
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta bedtools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	647,5 kbyte	2.060,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	565,4 kbyte	1.864,0 kbyte	[filförteckning]
armel	535,4 kbyte	1.759,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	559,3 kbyte	1.275,0 kbyte	[filförteckning]
i386	708,4 kbyte	2.275,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	585,1 kbyte	2.591,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	603,6 kbyte	2.459,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	663,0 kbyte	2.520,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	567,1 kbyte	2.100,0 kbyte	[filförteckning]