Balík: clustalw (2.1 lgpl-7)

Odkazy pre clustalw

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík clustalw:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.clustal.org]

Podobné balíky:

globálne viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo peptidov

Tento program vykonáva viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleotidov alebo aminokyselín. Rozpoznáva formát vstupných sekvencií a či sú to nukleové kyseliny alebo (DNA/RNA) alebo aminokyseliny (bielkoviny). Môžete si vybrať z viacerých formátov viacnásobného zarovnania ako sú Phylip alebo FASTA. Clustal W je veľmi uznávaný.

Výstup programu Clustal W je možné ručne upravovať pomocou editora zarovnania ako je SeaView alebo jeho sprievodný program Clustal X. Pro zostavovaní modelu z vášho zarovnania je možné ho použiť na vylepšené vyhľadávanie v databáze. Balík Debianu hmmer vytvára takúto formu HMM.

Značky: Biológia: Clustal/ALN, Proteins, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: implemented-in::c , interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Porovnávanie, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Ostatné balíky súvisiace s balíkom clustalw

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

štandardná knižnica C GNU v3

sug: clustalx

balík na viacnásobné zarovnávanie sekvencií nukleových kyselín a bielkovín - grafické rozhranie
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

enh: bioperl-run

BioPerl wrappers: scripts
enh: emboss

európsky balík otvoreného softvéru pre molekulárnu biológiu
enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť clustalw

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
s390x	247.5 kB	794.0 kB	[zoznam súborov]