[ Zdroj: prokka ]
Balík: prokka (1.14.6 dfsg-6)
Odkazy pre prokka
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík prokka:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Michael R. Crusoe (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
rapid annotation of prokaryotic genomes
A typical 4 Mbp genome can be fully annotated in less than 10 minutes on a quad-core computer, and scales well to 32 core SMP systems. It produces GFF3, GBK and SQN files that are ready for editing in Sequin and ultimately submitted to Genbank/DDJB/ENA.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom prokka
|
|
|
|
-
- dep: aragorn
- tRNA and tmRNA detection in nucleotide sequences
-
- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
-
- dep: hmmer
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis
-
- dep: infernal
- inference of RNA secondary structural alignments
-
- dep: less
- program na stránkovanie podobný programu more
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl - základné moduly jazyka Perl
-
- dep: libbio-searchio-hmmer-perl
- perl parser for HMMER2 and HMMER3 output (hmmscan, hmmsearch, hmmpfam)
-
- dep: libswiss-perl
- Perl API to the UniProt database
-
- dep: libxml-simple-perl
- modul jazyka Perl na čítanie a zápis XML
-
- dep: ncbi-blast
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: ncbi-tools-bin
- NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)
-
- dep: parallel
- príprava a paralelné spúšťanie príkazových riadkov zo štandardného vstupu
-
- dep: perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
-
- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
Stiahnuť prokka
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| all | 14,855.6 kB | 106,501.0 kB | [zoznam súborov] |