Balík: circlator (1.5.6-5)

Odkazy pre circlator

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík circlator:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [sanger-pathogens.github.io]

Podobné balíky:

circularize genome assemblies

Circlator is a tool to automate assembly circularization for bacterial and small eukaryotic genomes and produce accurate linear representations of circular sequences.

Značky: Biológia: Nucleic Acids, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Role: Program, Veda: science::calculation, works-with::biological-sequence, Works with: Súbory

Ostatné balíky súvisiace s balíkom circlator

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: bwa (>= 0.7.12)

Burrows-Wheeler Aligner
dep: canu

single molecule sequence assembler for genomes
dep: fastaq (>= 3.12.1)

FASTA and FASTQ file manipulation tools
dep: mummer

Efficient sequence alignment of full genomes
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-openpyxl

modul jazyka Python 3 na čítanie/zápis súborov OpenXML xlsx/xlsm
dep: python3-pymummer

Python 3 interface to MUMmer
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: spades

genome assembler for single-cell and isolates data sets

Stiahnuť circlator

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	4,369.4 kB	10,531.0 kB	[zoznam súborov]