[ Источник: prokka ]
Пакет: prokka (1.14.6 dfsg-6)
Ссылки для prokka
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код prokka:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
rapid annotation of prokaryotic genomes
A typical 4 Mbp genome can be fully annotated in less than 10 minutes on a quad-core computer, and scales well to 32 core SMP systems. It produces GFF3, GBK and SQN files that are ready for editing in Sequin and ultimately submitted to Genbank/DDJB/ENA.
Другие пакеты, относящиеся к prokka
|
|
|
|
-
- dep: aragorn
- tRNA and tmRNA detection in nucleotide sequences
-
- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
-
- dep: hmmer
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis
-
- dep: infernal
- inference of RNA secondary structural alignments
-
- dep: less
- постраничный вывод текста (аналог more)
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl core perl modules
-
- dep: libbio-searchio-hmmer-perl
- perl parser for HMMER2 and HMMER3 output (hmmscan, hmmsearch, hmmpfam)
-
- dep: libswiss-perl
- Perl API to the UniProt database
-
- dep: libxml-simple-perl
- Perl module for reading and writing XML
-
- dep: ncbi-blast
- поиск первичных биологических последовательностей
-
- dep: ncbi-tools-bin
- NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)
-
- dep: parallel
- параллельное выполнение команд
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
Загрузка prokka
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 14 855,6 Кб | 106 501,0 Кб | [список файлов] |