Пакет: pbbamtools (2.4.0 dfsg-1 и другие)

Ссылки для pbbamtools

Ресурсы Debian:

Исходный код pbbam:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [pbbam.readthedocs.org]

Подобные пакеты:

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Другие пакеты, относящиеся к pbbamtools

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0 dfsg-1 b4)

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0 dfsg)

data structures, algorithms, and utilities for C applications
dep: libstdc 6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C версии 3

rec: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка pbbamtools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
mips64el	2.4.0 dfsg-1 b4	120,7 Кб	702,0 Кб	[список файлов]