Пакет: r-cran-spp (1.16.0-2) [debports]
Ссылки для r-cran-spp
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [cran.r-project.org]
Подобные пакеты:
GNU R ChIP-seq processing pipeline
R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data
* Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate quality of tag alignment. * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags. * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them in WIG files for viewing in other browsers. * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of significant enrichment/depletion. * Determine statistically significant point binding positions * Assess whether the set of point binding positions detected at a current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not, estimate what sequencing depth would be required to do so.
Другие пакеты, относящиеся к r-cran-spp
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc 6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C версии 3
-
- dep: libunwind8
- библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
-
- dep: r-api-4.0
- виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.2-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-bioc-rsamtools
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- dep: r-cran-bh (>= 1.66)
- (Virtual) GNU R package to provide BH
-
- dep: r-cran-catools
- GNU R package providing various utility functions
-
- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C Integration
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
Загрузка r-cran-spp
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
ia64 (неофициальный перенос) | 332,4 Кб | 597,0 Кб | [список файлов] |