Пакет: sibsim4 (0.20-4)

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::TODO, use::comparing, Поиск, Поддерживаемые форматы: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Работает с: Требуется дополнительный тег

Эта страница также доступна на следующих языках (Как установить язык по умолчанию):