Пакет: pbhoney (15.8.24 dfsg-3)

Ссылки для pbhoney

Ресурсы Debian:

Исходный код pbsuite:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [sourceforge.net]

Подобные пакеты:

genomic structural variation discovery

PBHoney is an implementation of two variant-identification approaches designed to exploit the high mappability of long reads (i.e., greater than 10,000 bp). PBHoney considers both intra-read discordance and soft-clipped tails of long reads to identify structural variants.

PBHoney is part of the PBSuite.

Другие пакеты, относящиеся к pbhoney

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: blasr (>= 5.3)

mapping single-molecule sequencing reads
dep: python

интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
dep: python-h5py

general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)
dep: python-intervaltree-bio

Interval tree convenience classes for genomic data -- Python 2 library
dep: python-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks
dep: python-numpy

быстрые методы работы с числовыми массивами – модуль для языка Python
dep: python-pbbanana (= 15.8.24 dfsg-3)

additional utilities for the pbsuite
dep: python-pbsuite-utils (= 15.8.24 dfsg-3)

software for Pacific Biosciences sequencing data -- Python utilities
dep: python-pysam (>= 0.8.0)

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

rec: pbdagcon

sequence consensus using directed acyclic graphs

Загрузка pbhoney

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	1 280,3 Кб	2 356,0 Кб	[список файлов]