Пакет: grabix (0.1.7-4)

Ссылки для grabix

Ресурсы Debian:

Исходный код grabix:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

wee tool for random access into BGZF files

In biomedical research it is increasing practice to study the genetic basis of disease. This now frequently comprises the sequencing of human sequences. The output of the machine however is redundant, and the real sequence is the best sequence to explain the redundancy. The exchange of data happens only with compressed files - to huge and redundant to perform otherwise. One should avoid uncompression whenever possible.

grabix leverages the fantastic BGZF library of the samtools package to provide random access into text files that have been compressed with bgzip. grabix creates it's own index (.gbi) of the bgzipped file. Once indexed, one can extract arbitrary lines from the file with the grab command. Or choose random lines with the, well, random command.

Другие пакеты, относящиеся к grabix

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C версии 3
dep: tabix

generic indexer for TAB-delimited genome position files
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

библиотека сжатия

Загрузка grabix

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	14,4 Кб	56,0 Кб	[список файлов]
arm64	13,9 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
armel	15,5 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
armhf	14,9 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
i386	15,7 Кб	55,0 Кб	[список файлов]
mips64el	14,8 Кб	93,0 Кб	[список файлов]
mipsel	15,9 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	14,7 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
s390x	13,8 Кб	52,0 Кб	[список файлов]