[ Источник: bitseq ]
Пакет: bitseq (0.7.5 dfsg-6)
Ссылки для bitseq
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код bitseq:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Tim Booth (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data
BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.
Другие пакеты, относящиеся к bitseq
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc 6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C версии 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- библиотека сжатия
-
- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Загрузка bitseq
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| armhf | 286,8 Кб | 1 158,0 Кб | [список файлов] |