Pakiet: pycoqc (2.5.2 dfsg-3)

Odnośniki dla pycoqc

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego pycoqc:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

computes metrics and generates Interactive QC plots

PycoQC computes metrics and generates interactive QC plots for Oxford Nanopore technologies sequencing data

PycoQC relies on the sequencing_summary.txt file generated by Albacore and Guppy, but if needed it can also generates a summary file from basecalled fast5 files. The package supports 1D and 1D2 runs generated with Minion, Gridion and Promethion devices and basecalled with Albacore 1.2.1 or Guppy 2.1.3

Inne pakiety związane z pycoqc

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-h5py

general-purpose Python interface to hdf5
dep: python3-h5py-serial

general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)
dep: python3-jinja2

small but fast and easy to use stand-alone template engine
dep: python3-numpy

Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)
dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data
dep: python3-plotly (>= 4.1.0)

Python 3 plotting library for publication-quality graphs
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
dep: python3-scipy

Narzędzia naukowe dla Pythona 3
dep: python3-tqdm

fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

Pobieranie pycoqc

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	35,4 KiB	194,0 KiB	[lista plików]