Pakiet: nanook (1.33 dfsg-6)

Odnośniki dla nanook

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego nanook:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [documentation.tgac.ac.uk]

Podobne pakiety:

pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data

NanoOK is a flexible, multi-reference software for pre- and post- alignment analysis of nanopore sequencing data, quality and error profiles.

NanoOK (pronounced na-nook) is a tool for extraction, alignment and analysis of Nanopore reads. NanoOK will extract reads as FASTA or FASTQ files, align them (with a choice of alignment tools), then generate a comprehensive multi-page PDF report containing yield, accuracy and quality analysis. Along the way, it generates plain text files which can be used for further analysis, as well as graphs suitable for inclusion in presentations and papers.

Inne pakiety związane z nanook

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: default-jre-headless

Standardowe lub kompatybilne środowisko uruchomieniowe Javy (typu headless)
dep: hdf5-tools

HDF5 - narzędzia uruchomieniowe
dep: last-align

Porównywanie sekwencji biologicznych w skali genomu
dep: libcommons-io-java

Common useful IO related classes
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridextra

GNU R package with extensions for the grid package
dep: r-cran-reshape

Flexibly reshape data
dep: r-cran-scales

Scale functions for visualization
dep: texlive-latex-base

TeX Live: LaTeX fundamental packages

rec: blasr

mapping single-molecule sequencing reads
rec: bwa

Burrows-Wheeler Aligner

sug: default-jre

Standardowe lub kompatybilne środowisko uruchomieniowe Javy

Pobieranie nanook

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	191,2 KiB	288,0 KiB	[lista plików]