Pakiet: macs (3.0.2-1 i inne)

Odnośniki dla macs

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego macs:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Inne pakiety związane z macs

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

dep: python3 (<< 3.14)

dep: python3 (>= 3.12~)
dep: python3-cykhash

cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique
dep: python3-hmmlearn

unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models
dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)
dep: python3-numpy-abi9

pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy
dep: python3-scipy

Narzędzia naukowe dla Pythona 3
dep: python3-sklearn

Python modules for machine learning and data mining - Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie macs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	3.0.2-1 b1	3 884,0 KiB	15 915,0 KiB	[lista plików]