Pakiet: canu (2.0 dfsg-1)

Odnośniki dla canu

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego canu:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [canu.readthedocs.org]

Podobne pakiety:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Inne pakiety związane z canu

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: gnuplot

Interaktywny program do tworzenia wykresów, sterowany z wiersza poleceń
również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C , wersja 3
dep: mhap (>= 2.1.3)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus

Pakiet niedostępny

Pobieranie canu

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 226,6 KiB	9 210,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 100,2 KiB	8 667,0 KiB	[lista plików]
armel	1 075,7 KiB	8 521,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 101,1 KiB	6 673,0 KiB	[lista plików]
i386	1 352,2 KiB	10 418,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 342,8 KiB	12 314,0 KiB	[lista plików]
mipsel	1 386,0 KiB	11 249,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 218,4 KiB	12 366,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 072,7 KiB	9 029,0 KiB	[lista plików]