Pakiet: bowtie (1.3.0 dfsg1-1)

Odnośniki dla bowtie

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bowtie:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [bowtie-bio.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c , interface::commandline, Rola: Program, Nauka: science::calculation, scope::utility, Przeznaczenie: Analizowanie, use::comparing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bowtie

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.27)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc 6 (>= 9)

Standardowa biblioteka GNU C , wersja 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: bowtie-examples

Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

Pobieranie bowtie

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 599,8 KiB	6 884,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 232,5 KiB	6 048,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 066,9 KiB	7 862,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 392,5 KiB	8 020,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 312,7 KiB	6 768,0 KiB	[lista plików]