Package: bowtie (1.3.0 dfsg1-1)

Links for bowtie

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Download Source Package bowtie:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Ognyan Kulev (QA Page)
Stephan Struckmann (QA Page)
Alexandre Mestiashvili (QA Page)

External Resources:

Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]

Similar packages:

초고속 메모리 효율적인 짧은 읽기 정렬기

이 패키지는 최신 (2010) DNA 염기서열 분석 기술의 결과를 해석하기 위해 문제를 해결합니다. 이는 상당히 짧은 범위를 생성하며 작접적으로 해석할 수 없습니다. Bowtie와 같은 도구는 실행당 시퀀싱된 DNA의 짧은 길이에 염색체 위치를 제공하는 것은 어려운 일입니다.

Bowtie는 짧은 DNA 서열 (읽기)을 시간당 2,500만 개 이상의 35bp 시간당 읽기 속도로 인간 게놈에 정렬합니다. Bowtie는 메모리 공간을 작게 유지하기 위해 Burrows-Wheeler 인덱스로 게놈을 인덱스화합니다: 일반적으로 인간 게놈의 경우 2.2GB (페어드 엔드의 경우 2.9GB) 입니다.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c , interface::commandline, Role: Program, Science: science::calculation, scope::utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

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dep: libc6 (>= 2.27)

GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC 기능 지원 라이브러리
dep: libstdc 6 (>= 9)

GNU 표준 C 라이브러리 v3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

압축 라이브러리 - 런타임

sug: bowtie-examples

Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

Download bowtie

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,599.8 kB	6,884.0 kB	[list of files]
arm64	1,232.5 kB	6,048.0 kB	[list of files]
mips64el	1,066.9 kB	7,862.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,392.5 kB	8,020.0 kB	[list of files]
s390x	1,312.7 kB	6,768.0 kB	[list of files]