パッケージ: melting (5.2.0-2)

compute the melting temperature of nucleic acid duplex

This program computes, for a nucleic acid duplex, the enthalpy, the entropy and the melting temperature of the helix-coil transitions. Three types of hybridisation are possible: DNA/DNA, DNA/RNA, and RNA/RNA. The program first computes the hybridisation enthalpy and entropy from the elementary parameters of each Crick's pair by the nearest-neighbor method. Then the melting temperature is computed. The set of thermodynamic parameters can be easily changed, for instance following an experimental breakthrough.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, field::biology:molecular, implemented-in::c, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, scope::utility, アプリケーションスイート: GNU, 目的: use::analysing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

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