パッケージ: canu (2.0 dfsg-1)

canu に関するリンク

Canu は Celera Assembler のフォークで、（PacBio RS II や Oxford Nanopore MinION などの) 高ノイズ一分子シークエンシング向けに設計されています。

Canu は4つのステップで走る階層的アセンブリパイプラインです:

 * MHAP を用いた高ノイズシークエンスにおける重なり検知
 * 訂正一致シークエンスの生成
 * 訂正シークエンスのトリム
 * トリム済み訂正シークエンスのアセンブル

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, i386, mipsel 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

GNU 標準 C ライブラリ v3
dep: mhap (>= 2.1.3)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,226.6 kB	9,210.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1,100.2 kB	8,667.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1,075.7 kB	8,521.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1,101.1 kB	6,673.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1,352.2 kB	10,418.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1,342.8 kB	12,314.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1,386.0 kB	11,249.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1,218.4 kB	12,366.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1,072.7 kB	9,029.0 kB	[ファイル一覧]