Package: r-bioc-annotationhub (3.12.0 dfsg-1)
Links for r-bioc-annotationhub
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-annotationhub:
- [r-bioc-annotationhub_3.12.0 dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-annotationhub_3.12.0 dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-annotationhub_3.12.0 dfsg-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
client GNU R per accedere a risorse AnnotationHug
Questo pacchetto fornisce un client per la risorsa web AnnotationHub per Bioconductor. La risorsa web AnnotationHub fornisce una posizione centralizzata in cui possono essere trovati file genomici (es. VCF, bed, wig) e altre risorse da posizioni standard (es. UCSC, Ensembl). Le risorse includono metadati su ciascuna risorsa, es. una descrizione testuale, etichette e data di modifica. Il client crea e gestisce una cache locale di file recuperati dall'utente, favorendo un accesso veloce e riproducibile.
Other Packages Related to r-bioc-annotationhub
|
|
|
|
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.19
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)
- GNU R Annotation Database Interface per BioConductor
-
- dep: r-bioc-biocfilecache (>= 2.12.0)
- GNU R management of files across sessions
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
- funzioni generiche per Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocversion (>= 3.19.1)
- imposta la versione appropriata dei pacchetti Bioconductor
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
-
- dep: r-cran-biocmanager
- accesso al repository dei pacchetti del progetto Bioconductor
-
- dep: r-cran-curl
- client web moderno e flessibile per GNU R
-
- dep: r-cran-dplyr
- grammatica GNU R di manipolazione dei dati
-
- dep: r-cran-httr
- strumenti GNU R per lavorare con URL e HTTP
-
- dep: r-cran-rappdirs
- directory delle applicazioni per GNU R
-
- dep: r-cran-rsqlite
- driver R per interfaccia a database per SQLite
-
- dep: r-cran-yaml
- metodi per convertire dati R in YAML e viceversa
-
- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
-
- sug: r-bioc-ensembldb (>= 2.28.0)
- utilità per GNU R per creare e usare un database di annotazioni basato su Ensembl
-
- sug: r-bioc-experimenthub (>= 2.12.0)
- BioConductor client to access ExperimentHub resources
-
- sug: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)
- utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi
-
- sug: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)
- rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor
-
- sug: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)
- contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
-
- sug: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)
- allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
-
- sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)
- interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione
-
- sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)
- contenitore per saggi BioConductor
-
- sug: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0)
- annotazione di varianti genetiche per BioConductor
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
-
- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- sug: r-cran-runit
- pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità
Download r-bioc-annotationhub
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 434.7 kB | 723.0 kB | [list of files] |