Package: fastqtl (2.184 v7 dfsg-4 and others) [debports]

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mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari

L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

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dep: libblas3

implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

or libblas.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

libreria Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

libreria per opzioni di programma per C
dep: libc6.1 (>= 2.37)

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

libreria di supporto a GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
dep: libstdc 6 (>= 13.1)

libreria GNU Standard C , versione 3
dep: libunwind8

libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-mathlib (>= 4.3.3)

libreria matematica autonoma di GNU R

rec: r-cran-argparser

analizzatore degli argomenti della riga di comando per GNU R
rec: r-cran-qvalue

Package not available
rec: r-cran-tools

Package not available

sug: fastqtl-doc

mappatore QTL in cis per fenotipi molecolari - documentazione

Download fastqtl

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	2.184 v7 dfsg-4 b2	252.5 kB	1,260.0 kB	[list of files]