[ Source: bioperl-run ]
Package: bioperl-run (1.7.2-4)
Links for bioperl-run
Debian Resources:
Download Source Package bioperl-run:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [metacpan.org]
Similar packages:
wrapper BioPerl: script
Contiene script dal pacchetto BioPerl-Run. Questo pacchetto installa anche tutte le applicazioni pacchettizzate in Debian per cui possono essere creati wrapper; quelle che non sono Libere sono "Consigliate" da questo pacchetto.
Other Packages Related to bioperl-run
|
|
|
|
-
- dep: bioperl
- strumenti Perl per biologia molecolare computazionale
-
- dep: libbio-perl-run-perl (= 1.7.2-4)
- wrapper per BioPerl: moduli
-
- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
-
- rec: amap-align
- allineamenti multipli di proteine con appaiamento di sequenze
-
- rec: bedtools
- suite di utilità per confrontare tratti genomici
-
- rec: blast2
- pacchetto fittizio di transizione per ncbi-blast -legacy
-
- rec: bowtie
- allineatore di letture brevi ultraveloce ed efficiente in termini di memoria
-
- rec: bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
-
- rec: clustalw
- allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi
-
- rec: emboss
- suite software open source europea per la biologia molecolare
-
- rec: exonerate
- strumento generico per il confronto di sequenze di coppie
-
- rec: hmmer
- profilamento di modelli di Markov nascosti per analisi di sequenze proteiche
-
- rec: hyphy-mpi
- test di ipotesi usando filogenesi (versione MPI)
-
- rec: infernal
- inferenza degli allineamenti strutturali secondari dell'RNA
-
- rec: kalign
- allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi
-
- rec: mafft
- programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
-
- rec: maq
- mappatura di corte sequenze di lunghezza fissa di DNA polimorfo su sequenze di riferimento
-
- rec: muscle
- programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche
-
- rec: ncoils
- predizione della struttura secondaria di una spirale superavvolta
-
- rec: phylip
- pacchetto di programmi per inferire alberi filogenetici
-
- rec: phyml
- stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza
-
- rec: primer3
- strumento per progettare oligonucleotidi fiancheggianti per amplificazione di DNA
-
- rec: probalign
- allineamento di sequenze multiple usando le probabilità a posteriori della funzione di ripartizione
-
- rec: probcons
- allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza
-
- rec: raxml
- RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) di alberi filogenetici
-
- rec: samtools
- elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM
-
- rec: sim4
- strumento per allineare cDNA e DNA genomico
-
- rec: t-coffee
- allineamento di sequenze multiple
-
- rec: tigr-glimmer
- rilevamento di geni in archibatteri e batteri
-
- rec: wise
- confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche
Download bioperl-run
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 44.2 kB | 104.0 kB | [list of files] |