Package: mash (2.2.2 dfsg-2)
Links for mash
Debian Resources:
Download Source Package mash:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [mash.readthedocs.io]
Similar packages:
veloce stima di distanze in genoma e metagenoma usando MinHash
Mash usa gli hash MinHash sensibili localmente per ridurre grandi biosequenze in sketch rappresentativi e stimare rapidamente le distanze di coppia tra genomi o metagenomi. I database di sketch di Mash delineano in maniera efficace i confini conosciuti tra le specie, permettono la costruzione di filogenie approssimate e possono essere cercati in secondi usando genomi assemblati o risultati grezzi di sequenziamento da Illumina, Pacific Biosciences e Oxford Nanopore. Per la metagenomica, Mash scala fino a migliaia di campioni e può replicare i risultati dello Human Microbiome Project e del Global Ocean Survey in una frazione del tempo.
Other Packages Related to mash
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libcapnp-0.7.0
- libreria C Cap'n Proto
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
-
- dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)
- Portable MurmurHash Implementation
-
- dep: libstdc 6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C , versione 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download mash
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 149.5 kB | 443.0 kB | [list of files] |
arm64 | 130.6 kB | 383.0 kB | [list of files] |
mips64el | 132.1 kB | 482.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 148.6 kB | 487.0 kB | [list of files] |
s390x | 129.0 kB | 431.0 kB | [list of files] |