Paquet : r-cran-bio3d (2.4-4-1)
Liens pour r-cran-bio3d
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
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Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [cran.r-project.org]
Paquets similaires :
paquet GNU R pour l'analyse de structures biologiques
Le paquet bio3d contient des outils pour traiter, organiser et explorer les données de structure, de séquence et de dynamique des protéines. Ils peuvent lire et écrire ces données, effectuer des sélections d'atomes, des ré-orientations, des superpositions, de l'identification de régions rigides (« rigid core identification »), de l'agglomération (« clustering »), de l'analyse de torsion, de l'analyse matricielle de distances, de l'analyse de structure et de conservation de séquence et l'analyse du composant principal (PCA : principal component analysis). En plus de cela, des fonctions utilitaires sont fournies pour permettre à la puissance graphique de l'environnement R de travailler avec des données de séquencement et de structuration biologiques.
Autres paquets associés à r-cran-bio3d
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc 6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C de GNU v3
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-base-core (>= 4.2.1-3)
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C Integration
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: clustalo
- programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
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- rec: dssp
- assignation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D
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- rec: muscle
- programme d'alignements multiples de séquences de protéine
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- rec: mustang
- alignement structurel multiple de protéines
-
- rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)
- GNU R testsuite
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- sug: r-bioc-biostrings
- GNU R string objects representing biological sequences
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- sug: r-cran-bigmemory
- Paquet indisponible
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- sug: r-cran-httr
- GNU R tools for working with URLs and HTTP
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- sug: r-cran-igraph
- analyse et visualisation de réseau avec GNU R
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-lattice
- paquet GNU R pour les graphes « Trellis »
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- sug: r-cran-ncdf4
- GNU R interface to Unidata netCDF format data files
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- sug: r-cran-rcurl
- GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
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- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
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- sug: r-cran-xml
- paquet de GNU R pour la génération et analyse d’XML
Télécharger r-cran-bio3d
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| armel | 2 866,9 ko | 3 910,0 ko | [liste des fichiers] |