Paquet : r-bioc-biomart (2.60.1 dfsg-1)
Liens pour r-bioc-biomart
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-biomart :
- [r-bioc-biomart_2.60.1 dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-biomart_2.60.1 dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-biomart_2.60.1 dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
Depuis ces dernières années, une foule de données biologiques sont devenues disponibles dans des dépôts publics de données. Un accès aisé à ces ressources précieuses de données et une incorporation solide avec l’analyse des données est nécessaire pour une analyse intégrale des données de bioinformatique. biomaRt fournit une interface à une collection croissante de bases de données mettant en œuvre la suite logicielle BioMart (http://www.biomart.org). Ce paquet permet de récupérer de grandes quantités de données de manière uniforme sans avoir besoin de comprendre les schémas sous-jacents de base de données ou d’écrire des requêtes SQL complexes. Des exemples de bases de données BioMart sont Ensembl, COSMIC, Uniprot, HGNC, Gramene, Wormbase et dbSNP mappé à Ensembl. Ces bases de données majeures procurent aux utilisateurs de biomaRt un accès direct à divers ensembles de données et permettent une large variété de requêtes en ligne puissantes, de l’annotation de gène à l’exploration de données.
Autres paquets associés à r-bioc-biomart
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.19
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0)
- GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor
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- dep: r-bioc-biocfilecache (>= 2.12.0)
- gestion par GNU R de fichiers entre les sessions
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- dep: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
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- dep: r-cran-httr2
- requêtes HTTP et traitement des réponses dans GNU R
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- dep: r-cran-progress
- barres de progression pour terminaux pour GNU R
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- dep: r-cran-rappdirs
- répertoires des applications de GNU R
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- dep: r-cran-stringr
- Make it easier to work with strings
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- dep: r-cran-xml2
- analyseur XML pour GNU R
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- sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-cran-httptest2
- Test Helpers for 'httr2'
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-mockery
- mocking library for GNU R
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- sug: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
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- sug: r-cran-testthat
- GNU R testsuite
Télécharger r-bioc-biomart
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 441,3 ko | 632,0 ko | [liste des fichiers] |