Paquet : r-bioc-tcgabiolinks (2.32.0 dfsg-2)

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Paquets similaires :

paquet de GNU R/Bioconductor pour l’analyse intégrative avec des données du GDC

The aim of TCGAbiolinks is:

 1) facilitate the GDC open-access data retrieval,
 2) prepare the data using the appropriate pre-processing strategies,
 3) provide the means to carry out different standard analyses and
 4) to easily reproduce earlier research results.

In more detail, the package provides multiple methods for analysis (e.g., differential expression analysis, identifying differentially methylated regions) and methods for visualization (e.g., survival plots, volcano plots, starburst plots) in order to easily develop complete analysis pipelines.

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dep: r-cran-httr (>= 1.2.1)

GNU R tools for working with URLs and HTTP
dep: r-cran-jsonlite (>= 1.0.0)

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
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tools for splitting, applying and combining data
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