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Paquet : libcassie1v5 (1.0.9-4 et autres) [debports]

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bibliothèque mettant en œuvre des algorithmes de recherche

Cassiopee est une bibliothèque d'indexation et de recherche implémentée en C. Il s'agit d'une réécriture complète de Cassiopee, la gemme en Ruby. Elle scanne une séquence génomique d'entrée (ADN, ARN, protéine) et recherche une sous-séquence avec une correspondance parfaite ou en permettant des substitutions (mesurées avec la distance de Hamming), des insertions ou des suppressions.

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