Paquet : dascrubber (1.1-4 et autres)

Liens pour dascrubber

Ressources Debian :

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Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [dazzlerblog.wordpress.com]

Paquets similaires :

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

sug: daligner

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

Télécharger dascrubber

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	1.1-4 b1	155,0 ko	1 534,0 ko	[liste des fichiers]