[ Paquet source : bio-tradis ]
Paquet : bio-tradis (1.4.5 dfsg2-2)
Liens pour bio-tradis
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bio-tradis :
- [bio-tradis_1.4.5 dfsg2-2.dsc]
- [bio-tradis_1.4.5 dfsg2.orig.tar.xz]
- [bio-tradis_1.4.5 dfsg2-2.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
analyse des sorties d'analyses TraDIS de séquences de génomes
Bio-Tradis fournit un ensemble d'outils pour analyser la sortie des analyses TraDIS.
La chaîne d'analyse Bio-Tradis est implémentée sous la forme d'une bibliothèque Perl extensible qui peut être utilisée telle quelle ou comme base de développement d'outils d'analyse plus évolués.
Note : il est nécessaire d’installer manuellement BioConductor Edger qui ne peut être distribué dans Debian dans une version récente car il utilise le code locfit qui n’est pas distribuable.
Autres paquets associés à bio-tradis
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- dep: libbio-perl-perl
- modules Perl principaux de BioPerl
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- dep: libexception-class-perl
- module that allows you to declare real exception classes in Perl
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- dep: libmoose-perl
- modern Perl object system framework
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- dep: libtext-csv-perl
- comma-separated values manipulator (using XS or PurePerl)
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- dep: libtry-tiny-perl
- module fournissant un bloc try/catch minimaliste
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- dep: r-base-core
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- dep: r-cran-getopt
- GNU R package providing command-line parsing functionality
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- dep: r-cran-mass
- paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- dep: smalt
- Sequence Mapping and Alignment Tool
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- dep: tabix
- indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations
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- rec: artemis
- navigateur de génome et outil d'annotation
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- rec: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
Télécharger bio-tradis
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 78,5 ko | 244,0 ko | [liste des fichiers] |