Paquet : theseus (3.3.0-8)
Liens pour theseus
Ressources Debian :
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Télécharger le paquet source theseus :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.theseus3d.org]
Paquets similaires :
superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance
Theseus est un programme qui superpose simultanément plusieurs structures macromoléculaires. Theseus trouve la solution optimale du problème de superposition en utilisant la méthode du maximum de vraisemblance. En abaissant le poids de zones variables de la superposition et en rectifiant pour des corrélations parmi les atomes, la méthode de superposition par maximum de vraisemblance produit des alignements de structures très justes.
Lorsque des macromolécules avec des séquences résiduelles différentes sont superposées, d’autres programmes et algorithmes remplacent ces résidus alignés par des trous. Theseus, cependant, utilise un nouvel algorithme de superposition qui inclut toutes les données.
Autres paquets associés à theseus
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- dep: clustalo
- programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgsl23 (>= 2.5)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libgslcblas0 (>= 2.4)
- GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
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- dep: muscle
- Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
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- sug: clustalw
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
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- sug: dialign
- alignement de plusieurs séquences par segments
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- sug: kalign
- Alignement séquentiel multiple global et progressif
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- sug: mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
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- sug: probcons
- alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
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- sug: t-coffee
- alignement multiple de séquences
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- sug: theseus-examples
- superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance – exemples
Télécharger theseus
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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arm64 | 340,2 ko | 807,0 ko | [liste des fichiers] |