Paquet : bitseq (0.7.5 dfsg-4)

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Paquets similaires :

inférence bayésienne de transcripts à partir de données de séquençage

BitSeq est une application pour inférer des niveaux d’expression de transcripts individuels depuis des données de séquençage (RNA-Seq) et pour estimer l’expression différentielle (DE) entre des « conditions ». Un avantage de cette approche est la capacité d’expliquer l’incertitude technique et la variance biologique pour éviter de faux appels DE. La contribution technique à l’incertitude vient depuis la profondeur de lecture finie et la correspondance potentiellement ambiguë de lectures depuis plusieurs transcripts.

Autres paquets associés à bitseq

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.23)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:4.2)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C de GNU v3
dep: python

langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Bibliothèque de compression - binaires

sug: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	299,8 ko	1 655,0 ko	[liste des fichiers]