Paquets logiciels dans « buster », Sous-section science

3depict (0.0.21-1)

visualisation et analyse pour des données de point à valeurs uniques

abacas (1.3.1-5)

fermeture d'espaces dans des alignements génomiques depuis des lectures courtes

abinit (8.8.4-2)

paquet pour les calculs de structure électronique

abyss (2.1.5-7)

assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes

acedb-other (4.9.39 dfsg.02-4)

Récupération d'ADN ou de séquences de protéines

acedb-other-belvu (4.9.39 dfsg.02-4)

paquet de transition pour belvu

acedb-other-belvu

paquet virtuel fourni par belvu

acedb-other-dotter (4.9.39 dfsg.02-4)

paquet de transition pour dotter

acedb-other-dotter

paquet virtuel fourni par dotter

aces3 (3.0.8-6)

concepts avancés en structure électronique III

aces3-data (3.0.8-6)

concepts avancés en structure électronique III

achilles (2-9)

simulateur de vie artificielle et d'évolution

adapterremoval (2.2.3-1)

découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes

adapterremoval-examples (2.2.3-1)

découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes – données d'exemple

adms (2.3.6-2)

synthétiseur automatique de modèle de périphérique pour Verilog-AMS

adun-core (0.81-13)

simulateur moléculaire

aegean (0.16.0 dfsg-1)

boîte d’amalgame d’outils d'analyse de génome

aeskulap (0.2.2-beta2 git20180219.8787e95-2)

Afficheur d'images médicales et client réseau DICOM

aevol (5.0-2 b1)

modèle numérique de génétique pour lancer des expériences d'évolution in silico

aghermann (1.1.2-2)

gestionnaire d'expérimentation de recherche sur le sommeil

aladin (10.076 dfsg-1)

atlas interactif du ciel pour des images et ensembles de données astronomiques

alfa (1.0-3 b1)

algorithme d'ajustement de ligne automatisé

alien-hunter (1.7-7)

Distribution des motifs d'ordre variable (IVOM) pour identifier l'ADN acquis par transfert horizontal

altree (1.3.1-7 b1)

programme pour faire de l'association basée sur la phylogénétique et l'analyse de localisation

altree-examples (1.3.1-7)

fichiers d'exemple pour ALTree

amap-align (2.2 git20080214.600fc29 dfsg-1)

alignement multiple de séquences protéiques par appariement

ampliconnoise (1.29-8)

suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454

andi (0.12-4)

estimation efficace de distances d'évolution

anfo (0.98-7)

aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG

aoflagger (2.13.0-1 b2)

découverte des RFI dans les observations radioastronomiques

apbs (1.4-1 b1)

Solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

apertium-af-nl (0.2.0~r58256-2)

données Apertium pour les traductions entre l'afrikaans et le néerlandais

apertium-all-dev (3.5.2-1)

métapaquet pour tous les outils requis pour le développement d'Apertium

apertium-apy (0.11.4-2)

service APY d'Apertium

apertium-arg (0.1.2~r65494-2)

données simples Apertium pour l'aragonais

apertium-arg-cat (0.1.0~r64925-2)

données Apertium pour les traductions entre l'aragonais et le catalan

apertium-bel (0.1.0~r81357-2)

données d’Apertium pour uniquement le biélorusse

apertium-bel-rus (0.2.0~r81186-2)

données d’Apertium pour les traductions entre le biélorusse et le russe

apertium-br-fr (0.5.0~r61325-3)

données linguistiques Apertium pour les traductions entre le breton et le français

apertium-ca-it (0.1.1~r57554-2)

données Apertium pour les traductions entre le catalan et l'italien

apertium-cat (2.6.0-1)

données simples Apertium pour le catalan

apertium-cat-srd (1.0.0~r82995-2)

données d'Apertium pour les traductions entre le catalan et le sarde

apertium-crh (0.2.0~r83161-2)

données d’Apertium pour uniquement le tatar de Crimée

apertium-crh-tur (0.3.0~r83159-2)

données Apertium pour les traductions entre le tatar de Crimée et le turc

apertium-cy-en (0.1.1~r57554-4)

données linguistiques Apertium pour les traductions entre le gallois et l'anglais

apertium-dan (0.5.0~r67099-2)

données linguistiques simples Apertium pour le danois

apertium-dan-nor (1.3.0~r67099-2)

données Apertium pour les traductions entre le danois et le norvégien

apertium-dev (3.5.2-1)

outils et bibliothèque de développement pour Apertium

apertium-en-gl (0.5.2~r57551-2)

données Apertium pour les traductions entre l'anglais et le galicien

apertium-eo-en (1.0.0~r63833-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et l'anglais

apertium-eo-fr (0.9.0~r57551-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et le français

apertium-es-ast (1.1.0~r51165-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'asturien

apertium-es-it (0.2.0~r78826-2)

paquet factice de transition pour apertium-spa-ita

apertium-eu-en (0.3.1~r56205-2)

données Apertium pour les traductions entre le basque et l'anglais

apertium-fra (1.5.0-1)

données particulières d’Apertium pour le français

apertium-fra-cat (1.5.0-1)

données Apertium pour les traductions entre le français et le catalan

apertium-hbs (0.5.0~r68212-3)

données simples Apertium pour le serbo-croate

apertium-hbs-eng (0.1.0~r57598-2)

données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et l'anglais

apertium-hbs-mkd (0.1.0~r76450-2.1)

données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le macédonien

apertium-hbs-slv (0.1.0~r59294-2)

données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le slovénien

apertium-hin (0.1.0~r59158-2)

données simples Apertium pour le hindi

apertium-id-ms (0.1.1~r57551-2)

données Apertium pour les traductions entre l'indonésien et le malais

apertium-is-sv (0.1.0~r76450-2)

données Apertium pour les traductions entre l'islandais et le suédois

apertium-isl (0.1.0~r65494-2)

données simples Apertium pour l'islandais

apertium-isl-eng (0.1.0~r66083-2)

données Apertium pour les traductions entre l'islandais et l'anglais

apertium-ita (0.10.0~r82237-2)

données simples Apertium pour l'italien

apertium-kaz (0.1.0~r61338-2)

données simples Apertium pour le kazakh

apertium-kaz-tat (0.2.1~r57554-2)

données Apertium pour les traductions entre le kazakh et le tatar

apertium-lex-tools (0.2.1-1)

module de sélection lexicale basé sur les contraintes

apertium-mk-bg (0.2.0~r49489-2)

données Apertium pour les traductions entre le macédonien et le bulgare

apertium-mk-en (0.1.1~r57554-2)

données Apertium pour les traductions entre le macédonien et l'anglais

apertium-mlt-ara (0.2.0~r62623-2)

données Apertium pour les traductions entre le maltais et l'arabe

apertium-nno (0.9.0~r69513-3)

données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Nynorsk

apertium-nno-nob (1.1.0~r66076-2)

données linguistiques Apertium pour les traductions entre le norvégien Nynorsk et le norvégien Bokmål

apertium-nob (0.9.0~r69513-2)

données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Bokmål

apertium-oci (0.1.0-1)

données particulières d’Apertium pour l’occitan

apertium-pol (0.1.1-1)

données particulières d’Apertium pour le polonais

apertium-rus (0.2.0~r82706-1)

données d’Apertium pour uniquement le russe

apertium-separable (0.3.2-1)

réordonnancement de multimots séparables ou non contigus

apertium-sme-nob (0.6.0~r61921-2)

données Apertium pour les traductions entre le sámi et le bokmål

apertium-spa (1.1.0~r79716-2)

données simples Apertium pour l'espagnol

apertium-spa-arg (0.4.0~r64399-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'aragonais

apertium-spa-cat (2.1.0~r79717-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et le catalan

apertium-spa-ita (0.2.0~r78826-2)

données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'italien

apertium-srd (1.2.0~r82994-2)

données simples Apertium pour le sarde

apertium-srd-ita (0.9.5~r82237-2)

données Apertium pour les traductions entre le sarde et l'italien

apertium-swe (0.7.0~r69513-2)

données linguistiques Apertium pour le suédois uniquement

apertium-swe-dan (0.7.0~r66063-2)

données linguistiques Apertium pour les traductions entre le suédois et le danois

apertium-swe-nor (0.2.0~r69544-2)

données Apertium pour les traductions entre le suédois et le norvégien

apertium-szl (0.1.0-1)

données particulières d’Apertium pour le silésien

apertium-tat (0.1.0~r60887-2)

données simples Apertium pour le tatar

apertium-tur (0.2.0~r83161-2)

données d’Apertium pour uniquement le turc

apertium-ukr (0.1.0~r82563-2)

données d’Apertium pour uniquement l’ukrainien

apertium-urd (0.1.0~r61311-2)

données simples Apertium pour l’ourdou

apertium-urd-hin (0.1.0~r64379-2)

données Apertium pour les traductions entre l'ourdou et le hindi

aragorn (1.2.38-2)

détection ARNt et ARNtm dans les séquences de nucléotides

arb (6.0.6-4) [non-free]

phylogenetic sequence analysis suite - main program

arb-common (6.0.6-4) [non-free]

phylogenetic sequence analysis suite - common files

arden (1.0-4)

contrôle de spécificité pour les alignements de lecture utilisant une référence artificielle

ariba (2.13.3 ds-1)

identification de résistance antibiotique par assemblage

art-nextgen-simulation-tools (20160605 dfsg-3)

outils de simulation pour créer des lectures de séquençage synthétiques de nouvelle génération

art-nextgen-simulation-tools-profiles (20160605 dfsg-3)

profils pour les outils de simulation ART

artemis (17.0.1 dfsg-2)

navigateur de génome et outil d'annotation

artfastqgenerator (0.0.20150519-3)

création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence

artfastqgenerator-examples (0.0.20150519-3)

création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence – exemples

asdftool (2.3.2-2)

outil en ligne de commande pour manipuler les fichiers de données scientifiques ASDF

ase (3.17.0-2)

environnement de simulation atomique

ask (1.1.1-3)

kit d'échantillonage pour grands espaces expérimentaux

assemblytics (1.0 ds-1)

détection et analyse de variantes structurelles à partir d’un assemblage de génome

astro-tasks (2.0)

mélange exclusif Debian Astronomy (tâches de tasksel)

astromatic (1.1)

collection logicielle d'infrastructure astronomique

astrometry-data-2mass (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader

astrometry-data-2mass-00 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (2'-2.8')

astrometry-data-2mass-01 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (2.8'-4')

astrometry-data-2mass-02 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (4'-5.6')

astrometry-data-2mass-03 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (5.6'-8')

astrometry-data-2mass-04 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (8'-11')

astrometry-data-2mass-05 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (11'-16')

astrometry-data-2mass-06 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (16'-22')

astrometry-data-2mass-07 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (22'-30')

astrometry-data-2mass-08-19 (1.1) [contrib]

Astrometry.net 2MASS index files downloader (30'-2000')

astrometry-data-tycho2 (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net

astrometry-data-tycho2-07 (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes

astrometry-data-tycho2-07-bigendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes

astrometry-data-tycho2-07-littleendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes

astrometry-data-tycho2-08 (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes

astrometry-data-tycho2-08-bigendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes

astrometry-data-tycho2-08-littleendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes

astrometry-data-tycho2-09 (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes

astrometry-data-tycho2-09-bigendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes

astrometry-data-tycho2-09-littleendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes

astrometry-data-tycho2-10-19 (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes

astrometry-data-tycho2-10-19-bigendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes

astrometry-data-tycho2-10-19-littleendian (2-4)

fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes

astrometry.net (0.76 dfsg-3)

solveur de plaque photographique astrométrique

astronomical-almanac (5.6-6)

almanach astronomique - calcul de positions d'étoiles et de planètes

astropy-utils (3.1.2-2)

outils en ligne de commande d'astropy

atac (0~20150903 r2013-6)

comparaison de génomes d'assemblage en assemblage

augustus (3.3.2 dfsg-2)

prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes

augustus-data (3.3.2 dfsg-2)

fichiers de données pour AUGUSTUS

autodock (4.2.6-6)

Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

autodock-getdata (4.2.6-6)

instructions pour collecter des données pour getData

autodock-test (4.2.6-6)

fichiers de test pour AutoDock

autodock-vina (1.1.2-5 b1)

chargement de petites molécules jusqu'aux protéines

autogrid (4.2.6-6)

Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

autogrid-test (4.2.6-6)

fichiers de test pour AutoGrid

avce00 (2.0.0-7)

conversion de couverture vectorielle Arcinfo d’ESRI (binaire) au format E00

avogadro (1.2.0-4 b2)

système de modélisation et d'imagerie moléculaire

avogadro-data (1.2.0-4)

système de modélisation et d'imagerie moléculaire –⋅fichiers de données

axe-demultiplexer (0.3.3 dfsg-1)

démultiplexeur de lecture de séquence ADN basé sur les arbres préfixes

bagel (1.2.2-1)

paquet de chimie computationnelle

baitfisher (1.2.7 git20180107.e92dbf2 dfsg-1)

paquet logiciel de conception de sondes d'enrichissement hybrides

bali-phy (3.4 dfsg-1)

inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie

ballview (1.5.0 git20180813.37fc53c-3)

modélisation moléculaire (libre) et outil graphique moléculaire

bamtools (2.5.1 dfsg-3)

boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)

bandage (0.8.1-1)

navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo

barrnap (0.9 dfsg-1)

prédiction ribosomale rapide d'ARN

bart (0.4.04-2)

outils pour l'imagerie par résonance magnétique computationnelle

bart-view (0.1.00-2)

visualisateur de données multidimensionnelles et de valeur complexe

bcbio (1.1.2-3)

boîte à outils d’analyse de données de séquençage à haut débit

bcbio-doc (1.1.2-3)

documentation pour les workflows RNAseq de bcbio(-nextgen)

bcftools (1.9-1)

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

beads (1.1.18 dfsg-3 b1)

détection par électrophorèse bidimensionnelle de tâche d’images de gel

beagle (5.0-180928 dfsg-1 deb10u1)

appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés

beast-mcmc (1.10.4 dfsg-1)

inférence phylogénétique bayésienne MCMC

beast2-mcmc (2.5.1 dfsg-2)

inférence phylogénétique bayésienne MCMC

bedops (2.4.35 dfsg-1)

opérations génomiques à haute performance

bedtools (2.27.1 dfsg-4)

suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes

bedtools-test (2.27.1 dfsg-4)

données de test pour le paquet bedtools

belvu (4.44.1 dfsg-3)

visualisateur d’alignements de séquences multiples et outil phylogénétique

berkeley-express (1.5.2 dfsg-1 b2)

quantification de streaming pour le séquençage à taux élevé

bibus (1.5.2 dfsg-1)

base de données bibliographiques

bio-eagle (2.4.1-1)

phasage d'haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence

bio-eagle-examples (2.4.1-1)

exemples pour bio-eagle

bio-rainbow (2.0.4 dfsg-1)

partitionnement et assemblage de séquences courtes pour la bio-informatique

biogenesis (0.8-3)

programme de vie artificielle pour simuler l’évolution d’organismes

bioperl (1.7.2-3)

outils en Perl pour la bio-informatique

bioperl-run (1.7.2-4)

scripts d'enveloppe BioPerl

biosig-tools (1.9.3-2)

outils de conversion entre différents formats de données médicales

biosquid (1.9g cvs20050121-11)

utilitaire d'analyse de séquences biologiques

biosyntax (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – métapaquet

biosyntax-common (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – fichiers communs

biosyntax-example (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – exemple

biosyntax-gedit (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon gedit

biosyntax-less (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon less

biosyntax-vim (1.0.0b-1)

coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon vim

bist (0.5.2-1.1 b3)

outil de dessin chimique

bitseq (0.7.5 dfsg-4)

inférence bayésienne de transcripts à partir de données de séquençage

bkchem (0.13.0-6)

éditeur de structures chimiques

blasr (5.3.2 dfsg-1.1)

correspondance de lectures de séquençage de molécules simples

blast2 (1:2.8.1-1 deb10u1)

paquet factice de transition vers ncbi-blast -legacy

blimps-utils (3.9 ds-1) [non-free]

blocks database improved searcher

blixem (4.44.1 dfsg-3)

navigateur interactif d’alignements de séquences

bmt (0.6-1)

boîte à outils de mesure de performances d'analyse logicielle

bodr (10-1)

dépôt de données Blue Obelisk

boinc-app-seti (8.00~svn3725-3)

application SETI@home pour le client BOINC

boinc-app-seti-graphics (8.00~svn3725-3)

application SETI@home pour le client BOINC − interface graphique

bolt-lmm (2.3.2 dfsg-3 b1)

test efficace d’association de modèles mixtes bayésiens sur tout le génome de grandes cohortes

bolt-lmm-example (2.3.2 dfsg-3)

exemples pour bolt-lmm

boolector (1.5.118.6b56be4.121013-1 b1)

solveur SMT pour les vecteurs de bits et les tableaux

bowtie (1.2.2 dfsg-4)

aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire

bowtie-examples (1.2.2 dfsg-4)

exemples pour bowtie, l'aligneur de lectures courtes ultra rapide et efficace en mémoire

bowtie2 (2.3.4.3-1)

aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire

bowtie2-examples (2.3.4.3-1)

exemples pour bowtie2

boxshade (3.3.1-12)

Rendu élégant d'alignements multiples de séquences

bppphyview (0.6.1-1)

afficheur phylogénétique pour Bio

bppsuite (2.4.1-1)

suite de programmes Bio

bppsuite-examples (2.4.1-1)

exemples pour la suite de programmes Bio

brig (0.95 dfsg-2)

générateur d'images circulaires BLAST

bwa (0.7.17-3)

dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

cafeobj (1.5.9-1)

langage de spécification et programmation algébrique de nouvelle génération

cafeobj-mode (1.5.9-1)

mode majeur Emacs pour modifier du code source CafeOBJ

caffe-cpu (1.0.0 git20180821.99bd997-2 b1)

cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅méta-paquet

caffe-tools-cpu (1.0.0 git20180821.99bd997-2 b1)

outils pour le cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅CPU_ONLY

caffe-tools-cuda (1.0.0 git20180821.99bd997-2 b1) [contrib]

Tools for fast, open framework for Deep Learning (CUDA)

cain (1.10 dfsg-3)

simulations de réactions chimiques

cain-examples (1.10 dfsg-3)

exemples pour cain

cain-solvers (1.10 dfsg-3)

solveurs pour cain

calculix-ccx (2.11-1 b3)

programme d'éléments finis structurels en trois dimensions

calculix-cgx (2.11 dfsg-1 b1)

pré et postprocesseur tridimensionnel pour les modèles à éléments finis

camitk-actionstatemachine (4.1.2-3)

application pour rejouer les flux d'actions pour la bibliothèque CamiTK

camitk-config (4.1.2-3)

boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – configuration

camitk-imp (4.1.2-3)

banc de test pour la bibliothèque CamiTK

canu (1.8 dfsg-2)

assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes

casacore-data-igrf (12-1)

données de champ de référence géomagnétique international pour casacore

casacore-data-jpl-de200 (2007.07.05 ds.1-0 deb10u1)

éphéméride de développement DE200 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore

casacore-data-jpl-de405 (2007.07.05 ds.1-0 deb10u1)

éphéméride de développement DE405 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore

casacore-data-lines (0 git2016.11.26-2)

table de fréquences de ligne spectrale pour casacore

casacore-data-observatories (0 git2018.12.08-1)

table des coordonnées d'observatoires radio

casacore-data-sources (2-2)

table de coordonnées de sources de référence ICRF2 pour casacore

casacore-data-tai-utc (1.2)

table de différente entre TAI et UTC pour casacore

casacore-tools (3.0.0-4)

outils construits avec CASA

cassbeam (1.1-1 b1)

modélisation des antennes Cassegrain

cassiopee (1.0.9-2)

outil d'indexation et de recherche dans les séquences génomiques

cba (0.3.6-4.1 b2)

analyse de poutres continues

cbflib-bin (0.9.5.18 dfsg1-1 b1)

utilitaires de manipulation de fichiers CBF

cbmc (5.10-5)

vérificateur de modèle borné pour les programmes C et C

cclib (1.6-1)

analyseurs et algorithmes pour la chimie computationnelle

cclib-data (1.1-1) [non-free]

Parsers and algorithms for computational chemistry (data files)

cct (20170919 dfsg-1)

comparaison visuelle de séquences bactériennes, de plasmides, de chloroplastes ou mitochondriales

cct-examples (20170919 dfsg-1)

données d’exemple pour tester le paquet cct

cd-hit (4.6.8-2)

suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences

cdbfasta (0.99-20100722-5)

indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA

centrifuge (1.0.3-2)

système rapide et économe en mémoire de classification de séquences ADN

cernlib (20061220 dfsg3-4.4)

suite d'analyse de données CERNLIB -- méta-packet pour usage général

cernlib-core (20061220 dfsg3-4.4)

suite d'analyse de données CERNLIB — bibliothèques et programmes principaux

cernlib-extras (20061220 dfsg3-4.4)

suite d'analyse de données CERNLIB — programmes supplémentaires

cernlib-montecarlo (20061220 dfsg3-3.1)

bibliothèques Monte Carlo CERNLIB

cg3 (1.1.7-1 b1)

outils pour utiliser la troisième édition de Constraint Grammar (CG-3)

cgns-convert (3.3.0-7~deb10u1)

système de notation générale CFD — outils de conversion

cgview (0.0.20100111-4)

visionneuse de génome circulaire

ch5m3d (1.2.5 dfsg-2)

création et visualisation de dessins en 3D de molécules simples

changeo (0.4.5-1)

boîte à outils d’affectation clonale de répertoire – Python 3

checkit-tiff (0.2.3-2)

vérificateur de conformité pour les images au format TIFF élémentaire

chemical-structures (2.2.dfsg.0-13)

jeu de structures moléculaires dans des formats ouverts

chemps2 (1.8.9-1 b2)

exécutable pour appeler libchemps2-3 depuis la ligne de commande

chemtool (1.6.14-3)

programme de dessin de structures chimiques

chimeraslayer (20101212 dfsg1-2)

détecte les simili-chimères dans les ADN amplifiés via réaction en chaîne par polymérase

chromhmm (1.18 dfsg-1)

découverte et caractérisation d’état de chromatine

chromimpute (1.0.3 dfsg-1)

attribution d’épigénome systématique à grande échelle

circlator (1.5.5-3)

circularisation d'assemblages de génomes

circos (0.69.6 dfsg-2)

outil de dessin pour visualiser des données

circos-tools (0.23-1)

Traceur pour visualisation de données — utilitaires auxiliaires

ckon (0.7.1-3 b5)

outil de compilation automatique pour le logiciel d'analyse de données ROOT

clearcut (1.0.9-3)

reconstruction d'arbre phylogénétique extrêmement efficace

clonalframe (1.2-9)

inférence de microévolution bactérienne en utilisant des données de séquence multilocus

clonalframeml (1.11-3)

inférence efficace de recombinaison de génomes de bactéries entières

clonalorigin (1.0-3)

inférence de recombinaison homologue dans les bactéries grâce à des séquences de génomes entiers

clustalo (1.2.4-2)

programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines

clustalw (2.1 lgpl-6)

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

clustalx (2.1 lgpl-8)

alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique

cluster3 (1.57-1) [non-free]

Reimplementation of the Eisen-clustering software

cmor-tables (3.3-1)

tables MIP pour la bibliothèque de réécriture de sortie de modèle de climat

cmtk (3.3.1p1 dfsg-1)

boîte à outils de morphométrie computationnelle

cnvkit (0.9.5-3)

Copy number variant detection from targeted DNA sequencing

cod-tools (2.3 dfsg-3)

tools for manipulating CIF format files

code-aster-gui (1.13.1-2.1)

interface graphique pour Code_Aster – client

code-aster-run (1.13.1-2.1)

interface graphique pour Code_Aster - serveur

code-saturne (5.3.2 repack-1)

logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD)

code-saturne-bin (5.3.2 repack-1)

logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD) – exécutables

code-saturne-data (5.3.2 repack-1)

logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – données

code-saturne-doc (5.3.2 repack-1)

logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – documentation

code-saturne-include (5.3.2 repack-1)

logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – fichiers d'inclusion

codonw (1.4.4-4)

analyse de correspondance d'utilisation de codon

coinor-cbc (2.9.9 repack1-1)

solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR

coinor-clp (1.16.11 repack1-1)

solveur de programmation linéaire COIN-OR

coinor-csdp (6.1.1-1 b2)

paquet de programmation semi-définie

coinor-libcbc3 (2.9.9 repack1-1)

solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR – bibliothèques partagées

coinor-libcgl1 (0.59.10 repack1-1)

bibliothèque de génération de coupes COIN-OR

coinor-libclp1 (1.16.11 repack1-1)

solveur de programmation linéaire COIN-OR – bibliothèques partagées

coinor-libcoinutils3v5 (2.10.14 repack1-1)

collection de classes utilitaires de COIN-OR – exécutables et bibliothèques

coinor-libosi1v5 (0.107.9 repack1-1)

interface de solveur ouverte COIN-OR

coinor-libsymphony3 (5.6.16 repack1-1.1)

solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes – bibliothèques partagées

coinor-symphony (5.6.16 repack1-1.1)

solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes

colmap (3.5-1 b1)

Structure-from-Motion et Multi-View Stereo

comet-ms (2018012-1)

moteur de recherche de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)

concavity (0.1 dfsg.1-4)

prédicteur de sites de liaisons de ligands de la protéine à partir de la structure et de la conservation

connectome-workbench (1.3.2-1)

outil de visualisation du cerveau, d'analyse et de découverte

conservation-code (20110309.0-7)

outil de notation de la conservation des séquences de protéines

cp2k (6.1-2)

Ab Initio Molecular Dynamics

cp2k-data (6.1-2)

Ab Initio Molecular Dynamics (data files)

cpl-plugin-amber (4.3.8 dfsg-1 b1)

tuyauterie de réduction de données pour l’instrument AMBER de l’ESO

cpl-plugin-amber-calib (4.3.8 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for AMBER

cpl-plugin-fors (5.3.32 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline for the FORS1/2 instruments

cpl-plugin-fors-calib (5.3.32 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for FORS2

cpl-plugin-giraf (2.16.3 dfsg-1 b1)

ESO data reduction pipeline for the GIRAFFE instrument

cpl-plugin-giraf-calib (2.16.3 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for GIRAFFE

cpl-plugin-hawki (2.4.3 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline for the HAWK-I instrument

cpl-plugin-hawki-calib (2.4.3 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for HAWK-I

cpl-plugin-kmos (2.1.0 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline for the KMOS instrument

cpl-plugin-kmos-calib (2.1.0 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for KMOS

cpl-plugin-muse (2.6 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline for the MUSE instrument

cpl-plugin-muse-calib (2.6 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for MUSE

cpl-plugin-naco (4.4.6 dfsg-1)

ESO data reduction pipeline for the NaCo instrument

cpl-plugin-naco-calib (4.4.6 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline NaCo calibration data downloader

cpl-plugin-uves (5.9.1 dfsg-1 b1)

ESO data reduction pipeline for the UVES instrument

cpl-plugin-uves-calib (5.9.1 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for UVES

cpl-plugin-vimos (3.2.3 dfsg-2 b1)

ESO data reduction pipeline for the VIMOS instrument

cpl-plugin-vimos-calib (3.2.3 dfsg-2) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VIMOS

cpl-plugin-visir (4.3.7 dfsg-1 b1)

ESO data reduction pipeline for the VISIR instrument

cpl-plugin-visir-calib (4.3.7 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VISIR

cpl-plugin-xshoo (3.2.0 dfsg-1 b1)

ESO data reduction pipeline for the XSHOOTER instrument

cpl-plugin-xshoo-calib (3.2.0 dfsg-1) [contrib]

ESO data reduction pipeline calibration data downloader for XSHOOTER

cpuinfo (0.0~git20190201.d5e37ad-1)

CPU INFOrmation library (binary utilities)

crac (2.5.0 dfsg-3)

integrated RNA-Seq read analysis

critterding (1.0-beta12.1-1.3 b1)

évolution de la vie artificielle

ctdconverter (2.0-4)

Convert CTD files into Galaxy tool and CWL CommandLineTool files

ctsim (6.0.2-2)

Simulateur de tomographie calculée

ctsim-help (6.0.2-2)

fichier d’aide en ligne pour CTSim

cufflinks (2.2.1 dfsg.1-3 b1) [non-free]

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

cutadapt (1.18-1)

Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads

cwltool (1.0.20181217162649 dfsg-10)

implémentation de la référence du langage Common Workflow

daligner (1.0 git20180524.fd21879-1)

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

dans-gdal-scripts (0.24-3 b1)

outils de contribution à GDAL du Réseau d’information géographique d’Alaska

darknet (0.0.0 git20180914.61c9d02e-1)

réseaux neuronaux au code source ouvert en C

dascrubber (1.1-1)

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

datalad (0.11.2-2)

data files management and distribution platform

datalad-container (0.2.2-2)

DataLad extension for working with containerized environments

dawg (1.2-2)

simulate the evolution of recombinant DNA sequences

dazzdb (1.0 git20180908.0bd5e07-1)

manage nucleotide sequencing read data

dcl-f77 (7.3.3-1)

GFD-DENNOU Club Library (DCL) – version FORTRAN 77

dcm2niix (1.0.20181125-1)

convertisseur de dernière génération DICOM vers NIfTI

dcmtk (3.6.4-2.1 deb10u1) [security]

utilitaires en ligne de commande de la boîte à outils OFFIS DICOM

debian-astro-logo (2.0)

logo du mélange exclusif Debian Astronomie

deepnano (0.0 git20170813.e8a621e-3)

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

deepnano-data (0.0 git20170813.e8a621e-3)

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

delly (0.8.1-2)

découverte de variantes structurelles par analyse des lectures

dh-r (20190121)

outils d’aide de Debian pour empaqueter les bibliothèques R

dialign (2.2.1-10)

alignement de plusieurs séquences par segments

dialign-tx (1.0.2-12)

alignement séquentiel multiple basé sur les segments

dialign-tx-data (1.0.2-12)

alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données

diamond-aligner (0.9.24 dfsg-1)

aligneur de séquence locale accéléré compatible avec BLAST

dicomnifti (2.33.1-1)

Convertit les fichiers DICOM au format NIfTI

dicompyler (0.4.2.0-2)

plate-forme de recherche en radiothérapie

dimbl (0.15-2.1)

apprentissage automatique distribué

dindel (1.01-wu1-3 dfsg-1 b1)

determines indel calls from short-read data

discosnp (2.3.0-2)

détection du polymorphisme d'un seul nucléotide pour des ensembles bruts de lectures

disulfinder (1.2.11-8)

prédiction de pont disulfure et de leur connectivité

disulfinder-data (1.2.11-8)

fichiers de données pour la prédiction de pont disulfure dans les protéines

dlmodelbox (0.1.3-1)

Swiss Army Knife of Deep Learning Models

dnaclust (3-6 b1)

outil de regroupement de millions de séquences courtes d’ADN

doris (5.0.3~beta dfsg-7) [contrib]

Delft object-oriented radar interferometric software

dotter (4.44.1 dfsg-3)

comparaison détaillée de deux séquences génétiques

dozzaqueux (3.51-2)

simulateur pour des mélanges chimiques

dozzaqueux-data (3.51-2)

databases for chemical mixtures

dpuser (3.3 p1 dfsg-2 b1)

Interactive language for handling numbers, strings, and matrices

drawxtl (5.5-3 b3)

visionneur de structures cristallographiques

drslib (0.3.1.p3-1)

Command-line tools for the Data Reference Syntax library

dsdp (5.8-9.4)

logiciel pour la programmation semi-définie positive

dssp (3.0.0-3 b1)

affectation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D

dwgsim (0.1.12-2)

simulateur de lectures courtes de séquençage

dx (1:4.4.4-12)

OpenDX (IBM Visualization Data Explorer) : paquet principal

dxf2gcode (20170925-4)

dessins de pièces pour des machines-outils à commande numérique

dxsamples (4.4.0-4)

Programmes d'exemples pour OpenDX Data Explorer

e-mem (1.0.1-2)

calcul efficace des MEM pour de très grands génomes

e00compr (1.0.1-5)

programme de lecture et écriture de fichiers compressés E00 d’Arcinfo

ea-utils (1.1.2 dfsg-5)

command-line tools for processing biological sequencing data

easychem (0.6-8 b1)

trace des molécules et des formules chimiques 2D de haute qualité

ecaccess (4.0.1-1)

clients pour accéder aux fonctions du CEPMMT

ecflow-client (4.12.0-1)

outils client pour des flux de travaux météorologiques

ecflow-server (4.12.0-1)

contrôleur de flux de travaux météorologiques – serveur

ecopcr (1.0.1 dfsg-1)

estimate PCR barcode primers quality

edfbrowser (1.67 dfsg-1)

visualisateur pour les fichiers de stockage biomédicaux tels que BDF et EDF

edlib-aligner (1.2.4-1)

edlib sequence alignment tool using edit distance

edtsurf (0.2009-6)

surfaces de maillage triangulaire pour les structures de protéines

eigensoft (7.2.1 dfsg-1)

reduction of population bias for genetic analyses

elastix (4.9.0-1)

Boîte à outils pour le recalage rigide et non-rigide d'images

elk-lapw (5.4.24-2)

All-Electron Density-Functional Electronic Structure Code

elki (0.7.1-10.1)

cadriciel de développement pour des algorithmes d’exploration de données

elki-dev (0.7.1-10.1)

Data mining algorithm development framework - development files

elph (1.0.1-2)

DNA/protein sequence motif finder

embassy-domainatrix (0.1.660-3)

commandes supplémentaires EMBOSS pour manipuler un fichier de classification de domaines

embassy-domalign (0.1.660-3)

commandes EMBOSS additionnelles pour l'alignement dans le domaine des protéines

embassy-domsearch (1:0.1.660-3)

commandes supplémentaires EMBOSS pour la recherche dans les domaines de la protéine

embassy-phylip (3.69.660-3) [non-free]

EMBOSS conversions of the programs in the phylip package

emboss (6.6.0 dfsg-7 b1)

ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

emboss-data (6.6.0 dfsg-7)

fichiers de données pour le paquet EMBOSS

emboss-explorer (2.2.0-10)

interface web graphique pour EMBOSS

emboss-lib (6.6.0 dfsg-7 b1)

EMBOSS Libraries

engauge-digitizer (10.10 ds.1-1)

extraction interactive des valeurs depuis des images bitmap ou des cartes

ent (1.2debian-2)

programme de test de séquences de nombres pseudo-aléatoires

epsilon-bin (0.9.2 dfsg-4)

bibliothèque pour la compression par ondelettes – outils

ergo (3.5-1 b1)

Quantum chemistry program for large-scale calculations

eso-midas (19.02pl1.0-1)

ESO-Midas (European Southern Observatory — Munich Image Data Analysis System)

eso-midas-testdata (19.02pl1.0-1)

Test data files for ESO-MIDAS

eso-pipelines (1.2)

ESO VLT Instrument pipeline collection

esorex (3.13.1-1 deb10u1)

outils d’exécution pour des automatismes de l’Observatoire européen austral

estscan (3.0.3-3)

détecteur indépendant du cadre de lecture ouvert pour les séquences codantes d’ADN

esys-particle (2.3.5 dfsg1-2.1)

Software for particle-based numerical modelling. MPI version.

etsf-io (1.0.4-4)

Binary tools to check, merge and read ETSF files

examl (3.0.21-2)

code Exascale Maximum Likelihood (ExaML) pour l’inférence phylogénétique

exonerate (2.4.0-4)

outil générique pour la comparaison de deux séquences

expeyes (4.4.4 dfsg-4)

infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques

expeyes-clib (4.4.4 dfsg-4)

infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques

eye (19.0221.2026~ds-1)

semantic web reasoning engine

eyes17 (4.4.4 dfsg-4)

infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques

fast5 (0.6.5-2)

utilities for manipulating Oxford Nanopore Fast5 files

fasta3 (36.3.8g-1) [non-free]

tools for searching collections of biological sequences

fasta3-doc (36.3.8g-1) [non-free]

user guide for FASTA tools

fastahack (0.0 git20160702.bbc645f dfsg-6)

utility for indexing and sequence extraction from FASTA files

fastaq (3.17.0-2)

outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ

fastdnaml (1.2.2-14)

outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN

fastlink (4.1P-fix100 dfsg-2)

version plus rapide des programmes de généalogie génétique Linkage

fastml (3.1-4)

reconstruction d’ancestrales séquences d’acide aminé par maximum de vraisemblance

fastp (0.19.6 dfsg-1)

Ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor

fastqc (0.11.8 dfsg-2)

contrôle qualité pour les données de séquences à haut débit

fastqtl (2.184 dfsg-6 b1)

mappage de LCQ (locus de caractères quantitatifs) dans cis pour les phénotypes moléculaires

fasttree (2.1.10-2)

arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines

fastx-toolkit (0.0.14-6)

outils de prétraitement des lectures de nucléotides courts aux formats FASTQ/A

fcc (2.8-1 b3)

Script to compile C/C programs and link to Fortran libraries

feedgnuplot (1.51-1)

frontal pour Gnuplot orienté tuyauterie (pipe)

ffindex (0.9.9.9-2)

index/base de données simple pour d'énormes quantités de petits fichiers

figtree (1.4.4-3)

visionneuse d'arbres phylogénétiques sous forme graphique

fitgcp (0.0.20150429-2)

fitting genome coverage distributions with mixture models

fitscut (1.4.4-4 b4)

Extract cutouts from FITS image format files

fitsh (0.9.2-1 b1)

Software package for astronomical image processing

fitspng (1.4-1)

FITS to PNG converter

fitsverify (4.19-1 b1)

outil de vérification de format d’un fichier FITS

fityk (1.3.1-3)

ajustement de courbes et analyse de données non linéaires d’usage général

flexbar (1:3.4.0-2)

code-barres flexible et suppression de l'adaptation pour les plateformes de séquençage

flextra (5.0-12)

modèle de trajectoire pour tracer les phénomènes de transport aérien

fml-asm (0.1-5)

outil pour l’assemblage Illumina de lectures courtes pour de petites régions

foma-bin (0.9.18 r243-1 b3)

Xerox-compatible finite-state compiler - library

form (4.2.1-1)

système de manipulation symbolique

fractalnow (0.8.2-2)

générateur rapide et avancé de fractales

freebayes (1.2.0-2)

détection bayésienne de polymorphismes basée sur les haplotypes et génotypage

freecad (0.18~pre1 dfsg1-5 deb10u1) [security]

programme extensible et au code source ouvert de CFAO

freecad-common (0.18~pre1 dfsg1-5 deb10u1) [security]

Extensible Open Source CAx program - common files

freecad-python2 (0.18~pre1 dfsg1-5 deb10u1) [security]

Extensible Open Source CAx program - Python 2 binaries

freecad-python3 (0.18~pre1 dfsg1-5 deb10u1) [security]

programme extensible et au code source ouvert de CFAO – binaires en Python 3

freecad-runtime (0.18~pre1 dfsg1-5 deb10u1) [security]

Extensible Open Source CAx program - runtime files

freecontact (1.0.21-7 b1)

prédicteur rapide de contact de protéine

freediams (0.9.4-2)

assistant de prescription et gestionnaire d'interactions médicamenteuses

freemedforms-common-resources (0.9.4-2)

données communes pour les applications du projet FreeMedForms

freemedforms-emr (0.9.4-2)

gestionnaire de dossiers patients

freemedforms-emr-resources (0.9.4-2)

données pour FreeMedForms EMR

freemedforms-freedata (0.9.4-2)

données libres du projet FreeMedForms

freemedforms-libs (0.9.4-2)

bibliothèques communes du projet FreeMedForms

freemedforms-project (0.9.4-2)

ensemble d’applications médicales pour les professionnels de la santé

freemedforms-theme (0.9.4-2)

thème pour le projet FreeMedForms

frog (0.15-1)

tagger and parser for natural languages (runtime)

frogdata (0.16-1)

Data files for Frog

fsa (1.15.9 dfsg-4)

Fast Statistical Alignment of protein, RNA or DNA sequences

fsl (5.0.8-6) [non-free]

transitional dummy package

fsl

paquet virtuel fourni par fsl-5.0-core

fsl-5.0-core (5.0.8-6) [non-free]

analysis tools for FMRI, MRI and DTI brain imaging

fsl-core (5.0.8-6) [non-free]

metapackage for the latest version of FSL

fsm-lite (1.0-3)

frequency-based string mining (lite)

ftools-fv (5.5 dfsg-2)

outil pour afficher et éditer des fichiers au format FITS

ftools-pow (5.5 dfsg-2)

outil de tracé de courbe et d’interface d’affichage d’image

funtools (1.4.7-4)

Minimal buy-in FITS utility package

fw4spl (17.2.0-2)

frameWork pour Software Production Line

fxt-tools (0.3.8-2)

bibliothèque de traçage multifil

g3data (1:1.5.3-2.1 b1)

Extrait les données depuis des graphiques numérisés

gabedit (2.4.8-3 b2)

interface utilisateur graphique pour paquets Ab Initio

galileo (0.5.1-6)

utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit avec le service web de Fitbit

galileo-daemon (0.5.1-6)

utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit – démon

gamgi (0.17.3-2)

interface graphique de modélisation atomique générale (GAMGI)

gamgi-data (0.17.3-2)

General Atomistic Modelling Graphic Interface (data)

garli (2.1-3)

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood

garli-examples (2.1-3)

phylogenetic analysis of molecular sequence data (examples)

garli-mpi (2.1-3)

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

garlic (1.6-3)

logiciel de visualisation de biomolécules

gasic (0.0.r19-4)

genome abundance similarity correction

gatb-core (1.4.1 git20181225.44d5a44 dfsg-3)

boite à outils génomique avec le graphe de de Bruijn

gatb-core-testdata (1.4.1 git20181225.44d5a44 dfsg-3)

boite à outils génomique avec le graphe de de Bruijn – données de test

gausssum (3.0.2-1)

analyse et affichage de sorties Gaussian, GAMESS…

gazebo9 (9.6.0-1 b11)

simulateur de robots au source ouvert – exécutables

gazebo9-common (9.6.0-1)

simulateur de robots au source ouvert – fichiers communs

gazebo9-plugin-base (9.6.0-1 b11)

simulateur de robots au source ouvert – greffons de base

gbrowse (2.56 dfsg-4)

navigateur de génome générique GMOD

gbrowse-calign (2.56 dfsg-4 b1)

outil auxiliaire CAlign

gbrowse-data (2.56 dfsg-4)

données d’échantillon pour utiliser GBrowse

gbutils (5.7.1-1)

utilities for command line econometrics

gchempaint (0.14.17-1.1)

éditeur 2D de structures chimiques pour le bureau GNOME2

gcrystal (0.14.17-1.1)

visualiseur léger de structures cristallines

gcu-bin (0.14.17-1.1)

outils GNOME pour la chimie – applications auxiliaires

gcx (1.3-1.1 b2)

application en Gtk de traitement d’images astronomiques et de photométrie

gdal-bin (2.4.0 dfsg-1 deb10u1) [security]

Bibliothèque d'abstraction de données géospatiales - outils

gdal-data (2.4.0 dfsg-1 deb10u1) [security]

Geospatial Data Abstraction Library - Data files

gdis (0.90-5 b1)

visualisateur de modèle de molécule et de cristal

gdis-data (0.90-5)

visualisateur de modèle de molécule et de cristal — fichiers de données

gdl-astrolib (2018.08.10 dfsg-1)

Low-level astronomy software for GDL

gdl-coyote (2019.01.29-1)

GDL library from D. Fannings IDL courses

gdl-mpfit (1.85 2017.01.03-3)

Robust non-linear least squares curve fitting for GDL

gdpc (2.2.5-9)

Visualisateur de simulations de dynamique moléculaire

gdpc-examples (2.2.5-9)

fichiers d’exemples pour le programme gdpc

geant321 (1:3.21.14.dfsg-11)

outil de description et de simulation de détecteur de particules

geant321-data (1:3.21.14.dfsg-11)

données pour le simulateur de détecteur GEANT 3.21

gelemental (1.2.0-12)

visionneuse de tableau périodique des éléments

gemma (0.98.1 dfsg-1)

Genome-wide Efficient Mixed Model Association

gemma-doc (0.98.1 dfsg-1)

Example folder for GEMMA

genometester (4.0 git20180508.a9c14a6 dfsg-1)

boîte à outils pour réaliser des opérations d’ensembles sur des listes de k-mères

genometools (1.5.10 ds-3)

boîte à outils polyvalente d'analyse du génome

genometools-common (1.5.10 ds-3)

shared data files for GenomeTools

gentle (1.9 cvs20100605 dfsg1-7 b1)

ensemble de logiciels pour planifier le clonage génétique

geographiclib-tools (1.49-4)

bibliothèque C pour résoudre des problèmes géodésiques –⋅outils

geotiff-bin (1.4.3-1)

bibliothèque GeoTIFF (geografic enabled TIFF) – outils

gerris (20131206 dfsg-18 b2)

solveur hydrodynamique Gerris

getdata (0.2-3)

management of external databases

gff2aplot (2.0-11)

tracés d'alignements par paires pour les séquences génomiques avec PostScript

gff2ps (0.98l-2)

Produit des graphiques PostScript à partir de fichiers GFF

gfsview (20121130 dfsg-6)

visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris

gfsview-batch (20121130 dfsg-6)

visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris – traitement par lot

ghkl (5.0.0.2456-1)

application de contrôle de calculs de diffractomètre

ghmm (0.9~rc3-2)

General Hidden-Markov-Model library - tools

giella-core (0.1.1~r129227 svn121148-2)

GTCORE files for building Giellatekno language packages

giella-sme (0.0.20150917~r121176-3)

Giellatekno single language data for North Saami

giella-sme-dev (0.0.20150917~r121176-3)

Giellatekno single language data for North Saami (dev extras)

giira (0.0.20140625-2)

RNA-Seq driven gene finding incorporating ambiguous reads

ginga (2.7.2-2)

Astronomical image viewer

ginkgocadx (3.8.8-1)

logiciel d’imagerie médicale et visualisateur DICOM complet

glam2 (1064-5)

motifs de protéines lacunaires de séquences non alignées

gliese (3.0.95-2) [non-free]

stellar data set from the Third Catalogue of Nearby Stars

glueviz (0.14.1 dfsg-1)

visualisation de données liées

gmap (2019-01-24-1) [non-free]

alignement d’épissage et tolérante sur les SNP pour les lectures courtes et mNRA

gmt (5.4.5 dfsg-2)

outils de cartographie générique

gmt-common (5.4.5 dfsg-2)

outils de cartographie générique – fichiers indépendants de l’architecture

gmt-dcw (1.1.4-2)

Digital Chart of the World (DCW) for GMT

gmt-gshhg (2.3.7-4)

Global Self-consistent Hierarchical High-resolution Geography (GSHHG)

gmt-gshhg-full (2.3.7-4)

trait de côte de haute résolution pour GMT (Generic Mapping Tools)

gmt-gshhg-high (2.3.7-4)

traits de côte dans une haute résolution pour GMT (Generic Mapping Tools)

gmt-gshhg-low (2.3.7-4)

traits de côte en basse résolution pour GMT (Generic Mapping Tools)

gnuastro (0.8-1)

GNU Astronomy Utilities programs

gpaw (1.5.1-1)

DFT and beyond within the projector-augmented wave method

gpaw-data (0.9.20000-2)

gpaw datasets/setups

gperiodic (3.0.3-1)

Table périodique des éléments

gpx (2.5.2-3)

post-traitement de conversion gcode vers x3g

gpx2shp (0.71.0-7)

Convertit les fichiers GPS ou GPX en fichiers de formes ESRI

gr-fcdproplus (3.7.25.4b6464b-5 b3)

Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio

grabix (0.1.7-1)

wee tool for random access into BGZF files

graphlan (1.1.3-1)

circular representations of taxonomic and phylogenetic trees

grass (7.6.0-1)

système de gestion et d’analyse de ressources géographiques – SIG GRASS

grass-core (7.6.0-1)

composants centraux du SIG GRASS

grass-gui (7.6.0-1)

interfaces utilisateur graphiques pour le SIG GRASS

gravit (0.5.1 dfsg-3)

simulateur de gravité à couper le souffle

gravit-data (0.5.1 dfsg-3)

fichiers de données pour Gravit

gri (2.12.26-1 b1)

langage pour l'illustration scientifique

grinder (0.5.4-5)

simulateur polyvalent de lecture de séquençage global et d'amplicon omiques

gromacs (2019.1-1)

Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation

gromacs-data (2019.1-1)

simulateur de dynamique moléculaire GROMACS – données et documentation

gromacs-mpich (2019.1-1)

simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec MPICH

gromacs-openmpi (2019.1-1)

simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec OpenMPI

gubbins (2.3.4-1)

phylogenetic analysis of genome sequences

gvb (1.4-1)

visual simulator of 1 and 2-dimensional vibrations

gwama (2.2.2 dfsg-2)

Genome-Wide Association Meta Analysis

gwyddion (2.52-1)

outil d'analyse et de visualisation de données SPM (« Scanning Probe Microscopy »)

gwyddion-common (2.52-1)

fichiers indépendants de l’architecture pour Gwyddion, outil d’analyse SPM

gwyddion-plugins (2.52-1)

greffons pour l’outil d’analyse SPM de Gwyddion

gyoto (1.3.1-1)

intégration et lancer de rayons pour des géodésiques de relativité générale

gyoto-bin (1.3.1-1)

General relativistic ray-tracing command-line interface

h5utils (1.13.1-3 b1)

outils de visualisation de fichiers HDF5

harminv (1.4.1-2)

extraction of complex frequencies and amplitudes from time series

harvest-tools (1.3-4)

archivage et post-traitement d’alignements multiples génomiques « reference-compressed »

hdf-compass (0.6.0-1)

visualisateur pour les formats HDF5 et apparentés

hdf5-helpers (1.10.4 repack-10 deb10u1) [security]

HDF5 (Hierarchical Data Format 5) – assistants

hdf5-tools (1.10.4 repack-10 deb10u1) [security]

Format de données hiérarchique 5 (HDF5) - outils d'exécution

herisvm (0.8.2-1)

outils d’apprentissage automatique pour des algorithmes de classification

hfst (3.15.0-1.1~deb10u1)

technologie des transducteurs finis Helsinki

hfst-ospell (0.5.0-2)

Spell checker library and tool based on HFST

hhsuite (3.0~beta3 dfsg-3)

recherche de séquence de protéines basée sur l’alignement HMM-HMM

hhsuite-data (3.0~beta3 dfsg-3)

recherche de séquence de protéines basée sur l’alignement HMM-HMM – données

hilive (1.1-2)

alignement en temps réel des lectures Illumina

hinge (0.5.0-4)

assembleur de lectures longues de génome basé sur des « pivots »

hisat2 (2.1.0-2)

graph-based alignment of short nucleotide reads to many genomes

hmmer (3.2.1 dfsg-1)

profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

hmmer2 (2.3.2 dfsg-6)

profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

hmmer2-pvm (2.3.2 dfsg-6)

Programmes HMMER avec support PVM (machine virtuelle parallèle)

hodie (1.5.0-1)

affichage de la date en latin

horae (071~svn537-2.1) [contrib]

interactive graphical processing and analysis of EXAFS data

hpcc (1.5.0-1 b1)

mesureur de performance HPC Challenge

htcondor (8.6.8~dfsg.1-2 deb10u1)

système distribué de gestion de charge de travail

hyphy-common (2.3.14 dfsg-1)

test statistique en utilisant des phylogénies – fichiers communs

hyphy-mpi (2.3.14 dfsg-1)

Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)

hyphy-pt (2.3.14 dfsg-1)

Hypothesis testing using Phylogenies (pthreads version)

idba (1.1.3-3)

iterative De Bruijn Graph short read assemblers

ifeffit (2:1.2.11d-10.2 b3) [contrib]

Interactive XAFS analysis program

ifrit (4.1.2-6 b1)

outil puissant pour visualiser des ensembles de données tridimensionnelles

igor (1.3.0 dfsg-1)

infers V(D)J recombination processes from sequencing data

imagej (1.52j-1)

programme de traitement d’image ciblant les images de microscopie

imagevis3d (3.1.0-7 b2)

application de bureau pour le rendu volumique direct de grands volumes de données

imview (1.1.9h-1)

Application de visualisation et d'analyse d'images

indelible (1.03-4)

powerful and flexible simulator of biological evolution

indigo-utils (1.2.3-1)

Organic Chemistry Toolkit Utilities

infernal (1.1.2-2)

inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN

inhomog (0.1.9.2-1)

kinematical backreaction and average scale factor evolution

ipig (0.0.r5-3)

intégration de PSM dans des visualisations de navigateur de génome

iqtree (1.6.9 dfsg-1)

logiciel phylogénétique de maximum de vraisemblance

iraf (2.16.1 2018.11.01-2)

Image Reduction and Analysis Facility

iraf-dev (2.16.1 2018.11.01-2)

Image Reduction and Analysis Facility (development files)

iraf-fitsutil (2018.07.06-3 b1)

FITS utilities for IRAF

iraf-mscred (5.05 2018.07.09-1 b1)

CCD mosaic reduction package for IRAF

iraf-noao (2.16.1 2018.11.01-2)

paquet d’IRAF du NOAO pour la réduction de données

iraf-noao-dev (2.16.1 2018.11.01-2)

IRAF NOAO data reduction package (development files)

iraf-rvsao (2.8.3-1 b1)

IRAF package to obtain radial velocities from spectra

iraf-sptable (1.0~pre20180612-1 b1)

IRAF package for Tabular Spectra

iraf-wcstools (3.9.5-3)

prise en charge du WCS d’une image FITS – paquet pour IRAF

irstlm (6.00.05-2)

boîte à outils de modélisation de langage IRST

ismrmrd-schema (1.4.0-1)

schema for ISMRMRD

ismrmrd-tools (1.4.0-1)

command-line tools for ISMRMRD

itksnap (3.6.0-3)

segmentation semi-automatique de structures pour les images en 3D

iva (1.0.9 ds-6)

assemblage itératif de séquences virales

jaligner (1.0 dfsg-6)

algorithme de Smith-Waterman avec l'amélioration de Gotoh

jblas (1.2.4-2)

bibliothèque rapide d'algèbre linéaire pour Java

jellyfish (2.2.10-2)

count k-mers in DNA sequences

jellyfish-examples (2.2.10-2)

count k-mers in DNA sequences (examples for testing)

jellyfish1 (1.1.11-4)

count k-mers in DNA sequences

jemboss (6.6.0 dfsg-7)

interface graphique pour EMBOSS

jmodeltest (2.1.10 dfsg-7)

sélection par calculs intensifs de modèle de substitution de nucléotide

jmol (14.6.4 2016.11.05 dfsg1-4)

visualisateur moléculaire

jsamp (1.3.5-1)

Java Simple Application Messaging Protocol tool for VO

jube (2.2.2-1)

JUBE Benchmarking Environment

julia (1.0.3 dfsg-4)

langage de programmation haute-performance pour le calcul technique

julia-common (1.0.3 dfsg-4)

langage de programmation haute-performance pour le calcul technique –⋅fichiers communs

jupyter-notebook (5.7.8-1)

notebook interactif de Jupyter

kalign (1:2.03 20110620-5)

Alignement séquentiel multiple global et progressif

kalzium (4:17.08.3-1 b1)

outil de table périodique et de chimie

kalzium-data (4:17.08.3-1)

fichiers de données pour Kalzium

khmer (2.1.2 dfsg-6)

comptage k-mer, filtrage et parcours de graphe de séquences d’ADN en mémoire vive

khmer-common (2.1.2 dfsg-6)

fichiers communs pour les outils du projet khmer

kineticstools (0.6.1 git20180425.27a1878-2)

détection de modification d’ADN

kineticstools-data (0.6.1 git20180425.27a1878-2)

détection de modifications d’ADN – fichiers de données

king-probe (2.16.160404 git20180613.a09b012-1)

évaluation et visualisation de compacité interatomique de protéines

kissplice (2.4.0-p1-4)

détection de diverses sortes de polymorphismes dans les données du séquençage de l'ARN

klustakwik (2.0.1-1 b2)

classement automatique des échantillons (pics) dans des regroupements

kmc (2.3 dfsg-7)

décompte de k-mers dans des séquences de génome

kmer (0~20150903 r2013-6)

suite of tools for DNA sequence analysis

kmer-examples (0~20150903 r2013-6)

sample data for kmer suite of tools for DNA sequence analysis

konclude (0.6.2~dfsg-6)

raisonneur de logique descriptive basé sur les tableaux pour le web sémantique

kraken (1.1-3)

assigning taxonomic labels to short DNA sequences

kst (2.0.8-3 b1)

outil scientifique de tracé de données

kstars (5:3.0.0-1)

planétarium de bureau, planification d’observations et contrôle de télescope

kstars-data (5:3.0.0-1)

fichiers de données pour le planétarium KStars

kstars-data-extra-tycho2 (1.1r1-9.1) [non-free]

Tycho-2 star catalog for KStars

kxterm (20061220 dfsg3-4.4)

Suite d'analyse de données CERNLIB - émulateur de terminal KUIP

lagan (2.0-3)

alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

lamarc (2.1.10.1 dfsg-3)

analyse de vraisemblance avec l’algorythme de Metropolis en utilisant la théorie de la coalescence

lambda-align (1.0.3-5)

aligneur local pour des données biologiques massives

lambda-align2 (2.0.0-6)

Local Aligner for Massive Biological DatA - v2

lammps (0~20181211.gitad1b1897d dfsg1-2)

Molecular Dynamics Simulator

last-align (963-2)

comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome

lbt (1.2.2-6)

Convertit des formules LTL en automates Büchi

leaff (0~20150903 r2013-6)

biological sequence library utilities and applications

lefse (1.0.8-2)

determine features of organisms, clades, taxonomic units, genes

libadios-bin (1.13.1-16)

ADIOS système flexible d'entrées-sorties — exécutables

libadios-examples (1.13.1-16)

exemples pour le système flexible d'entrées-sorties ADIOS

libball1.5-data (1.5.0 git20180813.37fc53c-3)

bibliothèque d'algorithmes de biochimie –⋅fichiers de données

libbio-tools-phylo-paml-perl (1.7.3-2)

Bioperl interface to the PAML suite

libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl (1.7.4-1)

Bioperl interface to Clustal W

libbio-tools-run-alignment-tcoffee-perl (1.7.4-1)

Bioperl interface to T-Coffee

libcg3-1 (1.1.7-1 b1)

Runtime for CG-3

libeccodes-data (2.12.0-1)

GRIB and BUFR enecoding/encoding software library - data

libgeotiff-epsg (1.4.3-1) [non-free]

GeoTIFF library -- EPSG Geodetic Parameter Dataset

libghemical-data (3.0.0-4.2)

Molecular Modelling Library (data files)

libgnuradio-fcdproplus3.7.11 (3.7.25.4b6464b-5 b3)

Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio (runtime)

libgtkdatabox0-glade (1:0.9.3.1-1)

Gtk library to display large amounts of numerical data (glade API)

libgtkdatabox0-libglade (1:0.9.3.1-1)

Gtk library to display large amounts of numerical data (glade lib)

libhdf5-jni (1.10.4 repack-10 deb10u1) [security]

native library used by libhdf5-java

liblas-bin (1.8.1-10)

ASPRS LiDAR data translation toolset

liblemon-utils (1.3.1 dfsg-2)

Library for Efficient Modeling and Optimization in Networks (utilities)

liblinear-tools (2.1.0 dfsg-4)

applications autonomes pour LIBLINEAR

libmstoolkit-tools (82-6)

libraries for manipulating mass spectrometry data - tools

libncarg-bin (6.5.0-2)

NCAR command-language library - development tools

libncarg-data (6.5.0-2)

NCAR command-language library - Data

libngram-tools (1.3.2-3)

OpenGRM n-gram Language Modeling toolkit

libocas-tools (0.97 dfsg-5)

applications autonomes mettant en œuvre le solveur OCAS

libotb (6.6.1 dfsg-1 b1)

ORFEO Toolbox library metapackage

libotb-apps (6.6.1 dfsg-1 b1)

Plugins for ORFEO Toolbox applications

libpluto-jpl-eph-dev (0.0~git20180228-1.1)

development files to interact with JPL ephemeres data

libpluto-lunar-dev (0.0~git20180825.e34c1d1-1)

development files for astronomical Lunar library

libpwiz-tools (3.0.18342-2)

ProteoWizard command line tools

libqgis-customwidgets (2.18.28 dfsg-2)

composants graphiques personnalisés de QGIS pour QT Designer

libsilo-bin (4.10.2.real-5 b1)

Utilities to manipulate libsilo files

libssm-bin (1.4.0-1)

macromolecular superposition library - binaries

libvcflib-tools (1.0.0~rc2 dfsg-2)

C library for parsing and manipulating VCF files (tools)

libxy-bin (1.3-1.1 b1)

xylib – utilitaires

libyade (2019.01a-2)

plateforme pour la méthode des éléments distincts — bibliothèques

liggghts (3.8.0 repack1-4)

Open Source DEM Particle Simulation Software.

limereg (1.4.1-4 b1)

application légère de repérage d’image

linguider (4.1.1-1)

Astronomical autoguiding program for Linux

litl-tools (0.1.9-4)

Lightweight Trace Library - tools

logcentral (2.7-1.1 b2)

service de journalisation pour des applications distribuées

logcentral-tools (2.7-1.1 b2)

service de journalisation pour des applications distribuées

logol (1.7.9-1)

Pattern matching tool using Logol language

logol-bin (1.7.9-1)

outil d'associations de modèles utilisant le langage Logol

loki (2.4.7.4-8)

analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov

looptools (2.8-1 b3)

évaluation d’intégrale de diagramme de Feynman à une boucle

lorene (0.0.0~cvs20161116 dfsg-1)

framework for numerical relativity

lorene-codes-src (0.0.0~cvs20161116 dfsg-1)

source files of LORENE-based codes

ltrsift (1.0.2-8)

post-traitement et classification de rétrotransposons LTR

lttoolbox-dev (3.5.0-3)

Development tools and library for lttoolbox

lucy (1.20-1)

DNA sequence quality and vector trimming tool

lutefisk (1.0.7 dfsg-4 b1)

interprétation de novo d’un spectre de CID de peptide

lxi-tools (1.21-1)

interface logicielle pour LXI (LAN eXtensions for Instrumentation)

macs (2.1.2.1-1)

analyse basée sur modèles de ChIP-Seq venant de séquenceurs de lectures courtes

macsyfinder (1.0.5-2)

detection of macromolecular systems in protein datasets

maffilter (1.3.1 dfsg-1 b1)

process genome alignment in the Multiple Alignment Format

maffilter-examples (1.3.1 dfsg-1)

process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)

mafft (7.407-2)

programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

mapdamage (2.0.9 dfsg-1)

tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences

mapsembler2 (2.2.4 dfsg-3 b1)

bioinformatics targeted assembly software

maq (0.7.1-8)

correspondance de lectures de séquences d'ADN polymorphique de longueur courte à des séquences de référence

maqview (0.2.5-9)

graphical read alignment viewer for short gene sequences

mash (2.1 dfsg-2)

estimation rapide de distance entre génomes et métagénomes utilisant MinHash

matlab-gdf (0.1.2-2.1) [contrib]

IO library for the GDF -- Matlab interface

maude (2.7-2 b2)

cadriciel logique de haute performance

mauve-aligner (2.4.0 4736-1)

multiple genome alignment

mayavi2 (4.5.0-1)

paquet de visualisation scientifique de données 2D ou 3D

mbt (3.4-1)

générateur d’étiquetage basé sur la mémoire et étiqueteur

mbtserver (0.12-1)

extensions de serveur pour l’étiqueteur MBT

meep (1.7.0-3)

paquet logiciel pour la simulation FDTD

meep-lam4 (1.7.0-3)

software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version

meep-mpi-default (1.7.0-3)

software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version

meep-mpich2 (1.7.0-3)

software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version

meep-openmpi (1.7.0-3)

software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version

melting (5.2.0-1)

calcule la température de fusion de duplex d'acide nucléique

merkaartor (0.18.3 ds-5 b1)

éditeur de carte pour OpenStreetMap.org

meryl (0~20150903 r2013-6)

in- and out-of-core kmer counting and utilities

metaphlan2 (2.7.8-1)

Metagenomic Phylogenetic Analysis

metaphlan2-data (2.6.0 ds-4)

paquet de données pour l’analyse phylogénétique métagénomique

metastudent (2.0.1-6)

predictor of Gene Ontology terms from protein sequence

metastudent-data (2.0.1-4)

predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files

metastudent-data-2 (1.0.0-4)

predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data #2

metview (5.3.0-2)

visualisation des données et environnement d’analyse interactifs

metview-data (5.3.0-2)

données nécessaires à l’environnement d’analyse de données, Metview

mgltools-bhtree (1.5.7-3) [non-free]

Bhtree library extension module

mgltools-cadd (1.5.7-4) [non-free]

Computer Aided Drug Discovery (CADD) Pipeline

mgltools-cmolkit (1.5.7~rc1 cvs.20140424-2) [non-free]

Python classes to interpret trajectories of Gromacs

mgltools-dejavu (1.5.7-3) [non-free]

visualization of 3D geometry using the OpenGL with Python

mgltools-geomutils (1.5.7-3) [non-free]

Python library for geometric analyses

mgltools-mglutil (1.5.7-4) [non-free]

Molecular Graphics Laboratory utility collection

mgltools-molkit (1.5.7-3) [non-free]

Python classes to read and manipulate molecules

mgltools-networkeditor (1.5.7-4) [non-free]

Python GUI library for the editing of networks

mgltools-opengltk (1.5.7-3) [non-free]

Opengltk Python extension

mgltools-pyautodock (1.5.7-3) [non-free]

Python implementation of autodock

mgltools-pybabel (1.5.7-3) [non-free]

molecular structure file access and interpretation

mgltools-pyglf (1.5.7-3) [non-free]

GLF library Python extension to write text in OpenGL

mgltools-scenario2 (1.5.7-2) [non-free]

Python-based viewer of molecular structures

mgltools-sff (1.5.6~rc3~cvs.20120206-1) [non-free]

Simple Force Field for Python

mgltools-support (1.5.7-3) [non-free]

Update mechanism of MGLTools

mgltools-symserv (1.5.7-2) [non-free]

Symetry server

mgltools-utpackages (1.5.7-3) [non-free]

UT Austin software Python extensions

mgltools-viewerframework (1.5.7-3) [non-free]

ViewerFramework supports building visualization applications

mgltools-vision (1.5.7 dfsg-2) [non-free]

Python-based Visual Programming Environment

mgltools-visionlibraries (1.5.7-2) [non-free]

Extensions for Python-based Visual Programming Environment

mgltools-volume (1.5.7-3) [non-free]

Volume rendering Python package

mgltools-webservices (1.5.7-3) [non-free]

webservices for components of autodocktools

mhap (2.1.3 dfsg-2)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps

mia-doctools (2.4.6-4)

Helper scripts for run-time document creation

mia-tools (2.4.6-4)

outils en ligne de commande pour le traitement d’images en échelle de gris

mia-viewit (1.0.5-2)

programme de visualisation pour des ensembles de données en 3D créés avec MIA

mialmpick (0.2.14-2)

outils pour le choix de points de repère dans des ensembles de données de volumes en 3D

microbegps (1.0.0-3)

outil d’investigation pour le profilage taxonomique de données métagénomiques

microbiomeutil (20101212 dfsg1-2)

utilitaires d'analyse de microbiome

microbiomeutil-data (20101212 dfsg1-2)

Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools

microhope (4.4.4 dfsg-4)

cadriciel matériel et logiciel pour apprendre les microcontrôleurs

minc-tools (2.3.00 dfsg-3 b1)

Outils pour le format MNI d'imagerie médicale

minia (1.6906-2)

short-read biological sequence assembler

miniasm (0.3 dfsg-1)

assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées

minimac4 (1.0.0-2)

Fast Imputation Based on State Space Reduction HMM

minimap (0.2-4)

correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN

minimap2 (2.15 dfsg-1)

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences

minisat (1:2.2.1-5 b3)

solveur SAT rapide et léger

minisat (1.0-4)

solveur de contraintes pseudo booléennes

minisat2 (1:2.2.1-5 b3)

paquet de transition pour minisat

minisat2

paquet virtuel fourni par minisat

mipe (1.1-7)

Outil de sauvegarde de données dérivées de PCR

mira-assembler (4.9.6-4 b1)

assembleur de séquences génomiques exprimées utilisant la méthode globale

mira-rfam-12s-rrna (4.9.6-4)

extract of RFAM 12 rRNA database

missfits (2.8.0-2)

Basic maintenance and packaging tasks on FITS files

mitools (2.0.3-1)

visualisation, conversion et opérations basiques pour des données d’images médicales

mldemos (0.5.1 git.1.ee5d11f-4)

MLDemos (Machine Learning Demos) avec visualisation

mlpack-bin (3.0.4-1)

intuitive, fast, scalable C machine learning library (binaries)

mlv-smile (1.47-6)

Find statistically significant patterns in sequences

mmass (5.5.0-5)

outil de spectrométrie de masse pour les protéomes

mmass-modules (5.5.0-5)

Mass spectrometry tool for proteomics - extension modules

mobyle (1.5.5 dfsg-6)

portail web fournissant des formulaires web pour des logiciels en ligne de commande

mobyle-programs (5.1.2-3)

descriptions de programmes pour le portail Mobyle

mobyle-tutorials (1.5.0-4)

program tutorials for the mobyle portal

mobyle-utils (1.5.5 dfsg-6)

outils binaires utilisés par Mobyle

mocassin (2.02.73-1 b1)

MOnte CArlo SimulationS of Ionised Nebulae

mocassin-benchmarks (2.02.73-1)

benchmarks for the photoionisation code MOCASSIN

mocassin-data (2.02.73-1)

atomic and optical data for the photoionisation code MOCASSIN

mocassin-examples (2.02.73-1)

Examples for the photoionisation code MOCASSIN

molds (0.3.1-1 b7)

Semi-empirical electronic structure and molecular dynamics

mona (1.4-17-1 b1)

démonstration automatique de théorèmes

montage (6.0 dfsg-6)

Toolkit for assembling FITS images into mosaics

montage-gridtools (6.0 dfsg-6)

Create files to run montage on the grid

montecarlo-base (20061220 dfsg3-3.1)

[Physics] Common files for CERNLIB Monte Carlo libraries

montecarlo-data (20061220 dfsg3-3.1)

[Physics] data for CERNLIB Monte Carlo libraries

mopac7-bin (1.15-6 b3)

bibliothèque de chimie quantique semi-empirique – fichiers binaires

morse-simulator (1.4-5)

Multi-OpenRobot Simulation Engine

morse-simulator-data (1.4-5)

Multi-OpenRobot Simulation Engine

mothur (1.41.21-1)

ensemble pour analyse de séquences pour la recherche sur le microbiome

mpb (1.7.0-5)

Photonic-Bands du MIT

mpb-mpi (1.7.0-5)

programme Photonic-Bands du MIT, version parallèle (mpich)

mpb-scm (1.7.0-5)

programme Photonic-Bands du MIT – fichiers d’initialisation

mpgrafic (0.3.18-1)

MPI version of N-body initial conditions grafic package

mpqc (2.3.1-19)

programme de chimie quantique massivement parallèle

mpqc-support (2.3.1-19)

Massively Parallel Quantum Chemistry – outils d’assistance

mpqc3 (0.0~git20170114-4.1)

Massively Parallel Quantum Chemistry Program

mpqc3-data (0.0~git20170114-4.1)

Massively Parallel Quantum Chemistry Program (data files)

mptp (0.2.4-1)

single-locus species delimitation

mrbayes (3.2.6 dfsg-2 b1)

Bayesian Inference of Phylogeny

mrbayes-mpi (3.2.6 dfsg-2 b1)

inférence bayésienne de phylogenèse – version MPI

mriconvert (1:2.1.0-3)

utilitaire de conversion de fichier d’image médicale

mricron (0.20140804.1~dfsg.1-3)

conversion, visualisation et analyse d’images de résonance magnétique

mricron-data (0.20140804.1~dfsg.1-3)

data files for MRIcron

mrpt-apps (1:1.5.6-1 b1)

boîte à outils pour la programmation robotique - applications graphiques et console

mrpt-common (1:1.5.6-1)

boîte à outils pour la programmation robotique – exemples de fichier et d’ensembles de données

mrs (6.0.5 dfsg-7 b2)

système de recherche d'information pour les banques de données

mrtrix (0.2.13-2)

tractographie de la substance blanche par IRM pondérée en diffusion

mrtrix3 (3.0~rc3 git135-g2b8e7d0c2-3)

tractographie de la substance blanche par IRM pondérée en diffusion

mseed2sac (2.2 ds1-4)

Convert MiniSEED time series data to SAC

mssstest (3.0-7) [non-free]

Normalisation of disease scores for patients with Multiple Sclerosis

mummer (3.23 dfsg-4)

Alignement de séquence efficace de génomes complets

munipack (0.5.11-2)

Astronomical photometry software package

munipack-cli (0.5.11-2)

Command line interface of Munipack

munipack-core (0.5.11-2)

Core routines of Munipack

munipack-gui (0.5.11-2)

interface graphique pour Munipack

murasaki (1.68.6-8 b1)

homology detection tool across multiple large genomes

murasaki-common (1.68.6-8)

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

murasaki-mpi (1.68.6-8 b1)

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

muscle (1:3.8.1551-2)

Programme d'alignements multiples de séquences de protéine

music-bin (1.0.7-4 b1)

coordinateur de multisimulation pour MPI – utilitaires

mustang (3.2.3-3)

alignement structurel multiple de protéines

mustang-testdata (3.2.3-3)

alignements structuraux multiples de protéines – données de test

nanook (1.33 dfsg-1)

pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data

nanopolish (0.11.0-2)

identification de consensus pour les données de séquençage par nanopore

nast-ier (20101212 dfsg1-2)

NAST-based DNA alignment tool

nastran (0.1.95-1 b2) [non-free]

NASA Structural Analysis System

nautic (1.5-4)

calcul de la position de l’observateur en navigation astronomique

ncbi-blast (2.8.1-1 deb10u1)

suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

ncbi-blast -legacy (2.8.1-1 deb10u1)

script d’appel de legacy de BLAST du NCBI

ncbi-entrez-direct (10.9.20190219 ds-1 b10)

NCBI Entrez utilities on the command line

ncbi-epcr (2.3.12-1-7)

outil pour vérifier la présence d'un marqueur dans une séquence d'ADN

ncbi-rrna-data (6.1.20170106 dfsg1-0 deb10u2)

grandes bases de données BLAST d'ARN ribosomique distribuées avec le kit de développement du NCBI

ncbi-seg (0.0.20000620-5)

tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences

ncbi-tools-bin (6.1.20170106 dfsg1-0 deb10u2)

bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires en mode texte

ncbi-tools-x11 (6.1.20170106 dfsg1-0 deb10u2)

bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires⋅X

ncl-ncarg (6.5.0-2)

NCAR Command Language and NCAR graphics

ncl-tools (2.1.21 git20180827.c71b264-2)

outil pour traiter avec les fichiers NEXUS

nco (4.7.9-1)

opérateurs en ligne de commandes pour analyser des fichiers netCDF

ncoils (2002-7)

prédiction de structure secondaire de superhélice

ncview (2.1.8 ds-3 b1)

navigateur graphique X11 pour les fichiers au format NetCDF

neat (2.2-1)

Nebular Empirical Analysis Tool – outil d’analyse empirique de nébuleuse

neobio (0.0.20030929-4)

calcul d'alignements de séquences d'acides aminés et de nucléotides

netcdf-bin (1:4.6.2-1)

Programmes pour lire et écrire des fichiers NetCDF

neurodebian (0.38.3)

neuroscience-oriented distribution - repository configuration

neurodebian-archive-keyring (0.38.3)

distribution orientée neurosciences – clés GnuPG d’archive

neurodebian-desktop (0.38.3)

neuroscience-oriented distribution - desktop integration

neurodebian-dev (0.38.3)

neuroscience-oriented distribution - development tools

neurodebian-freeze (0.38.3)

outil nd_freeze pour geler les sources APT à utiliser dans des instantanés

neurodebian-popularity-contest (0.38.3)

neuroscience-oriented distribution - popcon integration

neuron (7.6.3-1)

environnement de simulation pour des modèles de calcul de neurones

neuron-dev (7.6.3-1)

Neuron simulation environment - Development files

nifti2dicom (0.4.11-1 b4)

convert 3D medical images to DICOM 2D series

nifti2dicom-data (0.4.11-1)

data files for nifti2dicom

njplot (2.4-8)

programme de dessin d’arbre phylogénétique

norsnet (1.0.17-4)

tool to identify unstructured loops in proteins

norsp (1.0.6-4)

predictor of non-regular secondary structure

numdiff (5.9.0-1)

comparaison de fichiers similaires avec des champs numériques

nutsqlite (2.0.6-1)

Dietary nutrition analysis software

nwchem (6.8.1-5)

logiciel de calcul de haute performance pour la chimie numérique

nwchem-data (6.8.1-5)

High-performance computational chemistry software (data files)

oar-common (2.5.8-1 deb10u1)

paquet commun pour l’ordonnanceur OAR

oar-node (2.5.8-1 deb10u1)

paquet d’ordonnanceur OAR de Node

oar-server (2.5.8-1 deb10u1)

OAR batch scheduler server package

oar-server-mysql (2.5.8-1 deb10u1)

paquet de dorsal pour le serveur MySQL d’ordonnancement de tâches

oar-server-pgsql (2.5.8-1 deb10u1)

paquet de dorsal pour le serveur PostgreSQL d’ordonnancement de tâches

oar-user (2.5.8-1 deb10u1)

OAR batch scheduler user package

oar-user-mysql (2.5.8-1 deb10u1)

OAR batch scheduler MySQL user backend package

oar-user-pgsql (2.5.8-1 deb10u1)

OAR batch scheduler PostgreSQL user backend package

oar-web-status (2.5.8-1 deb10u1)

OAR batch scheduler visualization tool package

obdgpslogger (0.16-1.3 b2)

ensemble d’outils pour la journalisation de données OBD-II de GPS

occt-draw (7.3.0 dfsg1-5)

Open CASCADE Technology command interpreter and graphical test system

oce-draw (0.18.2-3)

OpenCASCADE Community Edition CAE platform shared library

octave-bart (0.4.04-2)

liaisons Octave pour BART

octave-biosig (1.9.3-2)

liaisons Octave à la bibliothèque BioSig

octave-gdf (0.1.2-2.1 b3)

bibliothèque IO pour GDF – interface pour Octave

octave-psychtoolbox-3 (3.0.15.20190207.dfsg1-1)

toolbox for vision research -- Octave bindings

octomap-tools (1.8.1 dfsg-1)

Tools for 3D occupancy grid mapping

octovis (1.8.1 dfsg-1)

outil de visualisation pour OctoMap

odil (0.10.0-3)

C 11 library for the DICOM standard (application)

odin (2.0.3-1)

développement, simulation et exécution de séquences de résonance magnétique

ogdi-bin (3.2.1 ds-4)

bibliothèque OGDI ( interface de magasins de données géographiques libre) – utilitaires

openbabel (2.4.1 dfsg-3)

boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande

openbabel-gui (2.4.1 dfsg-3)

boite à outils logicielle dans le domaine de la chimie − interface graphique

opencaster (3.2.2 dfsg-1.1 b1)

MPEG2 transport stream data generator and packet manipulator

openfoam (1812 dfsg1-2)

Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - binaries

openfoam-examples (1812 dfsg1-2)

Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - examples

openms (2.4.0-real-1)

package for LC/MS data management and analysis

openms-common (2.4.0-real-1)

package for LC/MS data management and analysis - shared data

openmx (3.8.5 dfsg1-1)

paquet de simulations nanométriques

openmx-data (3.8.5 dfsg1-1)

package for nano-scale material simulations (data)

openrocket (15.03.5) [contrib]

Model Rocket Simulator

openuniverse (1.0beta3.1 dfsg-6)

simulateur d'univers 3D

openuniverse-common (1.0beta3.1 dfsg-6)

fichiers de données du simulateur en 3D de l’univers

optgeo (2.25-1)

simulateur d'optique géométrique

opticalraytracer (3.2-1.1)

Virtual lens design workshop

origami (1.2.7 really0.7.4-1.1)

command-line management tool for Folding @ Home clients

orthanc (1.5.6 dfsg-1 deb10u1) [security]

Lightweight, RESTful DICOM server for medical imaging

orthanc-dicomweb (0.6 dfsg-1)

greffon d’extension d’Orthanc avec prise en charge de WADO et DICOMweb

orthanc-imagej (1.2 dfsg-1)

ImageJ plugin to import images from Orthanc

orthanc-mysql (2.0-2)

Plugins to use MySQL or MariaDB as a database back-end to Orthanc

orthanc-postgresql (3.2-1)

Plugins to use PostgreSQL as a database back-end to Orthanc

orthanc-webviewer (2.5-1)

Web viewer of medical images for Orthanc

orthanc-wsi (0.6-2)

Whole-slide imaging support for Orthanc (digital pathology)

ossim-core (2.6.2-1)

utilitaires centraux d’OSSIM

otb-bin (6.6.1 dfsg-1 b1)

applications en ligne de commande d’ORFEO Toolbox

otb-bin-qt (6.6.1 dfsg-1 b1)

interface graphique pour les applications d’ORFEO Toolbox

otb-testdriver (6.6.1 dfsg-1 b1)

bibliothèque d’ORFEO Toolbox – OTBTestDriver

otf-trace (1.12.5 dfsg-4)

Open Trace Format support library - development files

p4vasp (0.3.30 dfsg-5)

visualization suite for the Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP)

paje.app (1.98-1 b7)

outil générique de visualisation (diagramme de GANTT et autres)

pal2nal (14.1-2)

converts proteins to genomic DNA alignment

paleomix (1.2.13.3-1)

pipelines and tools for the processing of ancient and modern HTS data

paml (4.9h dfsg-1)

PAML – analyse de phylogenèse par maximum de vraisemblance

paraclu (9-2)

Parametric clustering of genomic and transcriptomic features

parafly (0.0.2013.01.21-4)

parallel command processing using OpenMP

paraview (5.4.1 dfsg4-3.1 b2)

application parallèle de visualisation

parsinsert (1.04-4)

insertion parcimonieuse de séquences non classifiées dans des arbres phylogénétiques

parsinsert-testdata (1.04-4)

données de test pour parsinsert

parsnp (1.2 dfsg-5)

rapid core genome multi-alignment

patman (1.2.2 dfsg-5)

rapid alignment of short sequences to large databases

paw (1:2.14.04.dfsg.2-9.1 b4)

Physics Analysis Workstation (Station d'analyse pour la physique) - programme d'analyse graphique

paw (1:2.14.04.dfsg.2-9.1 b4)

Outils d'analyse physique (version améliorée avec Lesstif)

paw-common (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)

Physics Analysis Workstation (common files)

paw-demos (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)

Exemples et tests pour PAW

pbbamtools (0.19.0 dfsg-4)

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

pbbarcode (0.8.0-5)

annotate PacBio sequencing reads with barcode information

pbdagcon (0.3 git20161121.0000000 ds-1.1)

sequence consensus using directed acyclic graphs

pbgenomicconsensus (2.3.2-5)

Pacific Biosciences variant and consensus caller

pbh5tools (0.8.0 git20170929.58d54ff dfsg-1)

tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

pbhoney (15.8.24 dfsg-3)

recherche de variation structurelle génomique

pbjelly (15.8.24 dfsg-3)

genome assembly upgrading tool

pbsim (1.0.3 git20180330.e014b1d dfsg-1)

simulateur pour les lectures de séquences de PacBio

pdb2pqr (2.1.1 dfsg-5)

Preparation of protein structures for electrostatics calculations

pegasus-wms (4.4.0 dfsg-8)

Scientific workflow management system for HTCondor

perlprimer (1.2.4-1)

Conception graphique d'amorce de PCR

perm (0.4.0-4)

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

pftools (3 dfsg-3)

construction et recherche de profils généralisés de protéine et d’ADN

phast (1.4 dfsg-1)

phylogenetic analysis with space/time models

phipack (0.0.20160614-3)

PHI test and other tests of recombination

phybin (0.3-3)

binning/clustering newick trees by topology

phylip (1:3.697 dfsg-1)

paquet de programmes pour déduire les phylogénies

phyml (3:3.3.20180621-2)

estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale

physamp (1.1.0-1)

sample sequence alignment corresponding to phylogeny

phyutility (2.7.3 dfsg-2)

simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices

phyx (0.999 ds-1)

UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences

picard-tools (2.18.25 dfsg-2)

outils en ligne de commande pour manipuler les fichiers SAM et BAM

picosat (960-1 b2)

solveur SAT avec gestion de démonstrations et « core »

piler (0~20140707-2)

genomic repeat analysis

pilon (1.23 dfsg-1)

automated genome assembly improvement and variant detection tool

pirs (2.0.2 dfsg-8)

Profile based Illumina pair-end Reads Simulator

pirs-examples (2.0.2 dfsg-8)

profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (example data)

pirs-profiles (2.0.2 dfsg-8)

profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)

pkg-r-autopkgtest (20190121)

Script for the automatic testing of R packages

pktools (2.6.7.6 ds-1 b1)

utilitaires complémentaires pour GDAL pour un traitement efficace d'images matricielles

placnet (1.03-3)

Plasmid Constellation Network project

planets (0.1.13-19)

simulation gravitationnelle de corps planétaires

plasmidseeker (1.0 dfsg-1)

identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads

plast (2.3.2 dfsg-1)

Parallel Local Sequence Alignment Search Tool

plast-example (2.3.2 dfsg-1)

Parallel Local Sequence Alignment Search Tool (example data)

plastimatch (1.7.4 dfsg.1-2)

reconstruction d’images médicales et recalage

plink (1.07 dfsg-2)

outils d'analyse d'associations sur le génome entier

plink1.9 (1.90~b6.6-181012-1)

outils d'analyse d'associations sur le génome entier

pluto-jpl-eph (0.0~git20180228-1.1)

command line handling of JPL ephemeres data

pluto-lunar (0.0~git20180825.e34c1d1-1)

routines de prédictions de positions dans le système solaire

pnetcdf-bin (1.10.0-3 b1)

Programs for reading and writing parallel NetCDF files

poa (2.0 20060928-7)

alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences

populations (1.2.33 svn0120106 dfsg-2)

logiciel de génétique de populations

porechop (0.2.4 dfsg-1)

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

poretools (0.6.0 dfsg-3)

toolkit for nanopore nucleotide sequencing data

poretools-data (0.6.0 dfsg-3)

toolkit for nanopore nucleotide sequencing data -- sample datasets

pp-popularity-contest (1.0.6-4 b1)

PredictProtein popularity contest

pprepair (0.0~20170614-dd91a21-3 b1)

outil de réparation de partition planaire

praat (6.0.48-1)

programme pour l'analyse et la synthèse de la parole

prank (0.0.170427 dfsg-2)

Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

predictnls (1.0.20-5)

prédiction et analyse de signaux de localisation nucléaire de protéines

predictprotein (1.1.08-1)

suite of protein sequence analysis tools

prepair (0.7.1-3 b2)

outil de réparation de polygone

prepair-data (0.7.1-3)

outil de réparation de polygone – données d’exemples

prime-phylo (1.0.11-7 b1)

bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

primer3 (2.4.0-2)

outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN

primer3-examples (2.4.0-2)

tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification (examples)

proalign (0.603-4)

logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes

probabel (0.5.0 dfsg-3)

Toolset for Genome-Wide Association Analysis

probabel-examples (0.5.0 dfsg-3)

Example files for ProbABEL

probalign (1.4-8)

alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition

probcons (1.12-12)

alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste

probcons-extra (1.12-12)

Programmes optionnels pour le paquets probcons

proda (1.0-12)

Alignement multiple de séquences protéiques

prodigal (1:2.6.3-4)

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

profbval (1.0.22-6)

prédicteur des résidus de protéine flexibles/rigides à partir d'une séquence

profisis (1.0.11-5)

prédiction des sites d'interaction protéine-protéine à partir d'une séquence

profnet-bval (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour profbval

profnet-chop (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour profchop

profnet-con (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour profcon

profnet-isis (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour profisis

profnet-md (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour le paquet metadisorder

profnet-norsnet (1.0.22-6)

neural network architecture for norsnet

profnet-prof (1.0.22-6)

architecture de réseau neuronal pour profacc

profnet-snapfun (1.0.22-6)

neural network architecture for snapfun

profphd (1.0.42-3)

secondary structure and solvent accessibility predictor

profphd-net (1.0.22-6)

architecture de réseaux de neurones pour le paquet profphd

profphd-utils (1.0.10-5)

utilitaires d’assistance de profphd, convert_seq et filter_hssp

proftmb (1.1.12-8)

per-residue prediction of bacterial transmembrane beta barrels

progressivemauve (1.2.0 4713 dfsg-4)

multiple genome alignment algorithms

proj-bin (5.2.0-1)

bibliothèque de projection cartographique (outils)

proj-rdnap (2008-8) [non-free]

RDNAP grid correction files for PROJ

proteinortho (5.16.b dfsg-1)

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

prottest (3.4.2 dfsg-3)

selection of best-fit models of protein evolution

pscan-chip (1.1-2)

ChIP-based identifcation of TF binding sites

pscan-chip-data (1.1-2)

auxiliary data for PScan-ChIP

pscan-tfbs (1.2.2-3)

search for transcription factor binding sites

psfex (3.17.1 dfsg-5)

Point Spread Function model extractor

psi3 (3.4.0-6 b3)

suite de programme de chimie quantique

psi4 (1:1.2.1-2)

Quantum Chemical Program Suite

psi4-data (1:1.2.1-2)

suite de programmes de chimie quantique – fichiers de données

psortb (3.0.6 dfsg-1 b1)

outil de prédiction de localisation bactérienne

psychtoolbox-3-common (3.0.15.20190207.dfsg1-1)

toolbox for vision research -- arch/interpreter independent part

psychtoolbox-3-lib (3.0.15.20190207.dfsg1-1)

toolbox for vision research -- arch-specific parts

purify (2.0.0-4 b1)

Collection of routines for radio interferometric imaging

pyfai (0.17.0 dfsg1-3)

Fast Azimuthal Integration scripts

pyfr (1.5.0-3)

flux reconstruction in Python

pymca (5.4.3 dfsg-1)

applications et boite à outils pour l’analyse de fluorescence de rayons X – scripts

pymca-data (5.4.3 dfsg-1)

fichiers de données indépendantes de l'architecture pour PyMca

pymoctool (0.5.0-4)

Python Multi-Order Coverage maps tool for Virtual Observatory

pymol (2.2.0 dfsg-4)

système de graphismes moléculaires

pymol-data (2.2.0 dfsg-4)

data files for PyMOL

pysatellites (2.5-1)

simulation de lancement de satellites

python-cyvcf2 (0.10.4-1)

VCF parser based on htslib (Python 2)

python-drizzle-testdata (1.12-2)

Dithered image combination for Python (Test data)

python-pybigwig (0.3.12-1 b1)

Python 2 module for quick access to bigBed and bigWig files

python-pynlpl (1.1.2-1)

PyNLPl is a library for Natural Language Processing (Python 2 version)

python-shogun (3.2.0-5.2)

Large Scale Machine Learning Toolbox

python3-airr (1.2.1-2)

Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences

python3-amp (0.6.1-1)

Atomistic Machine-learning Package (python 3)

python3-bcbio (1.1.2-3)

library for analysing high-throughput sequencing data

python3-cyvcf2 (0.10.4-1)

VCF parser based on htslib (Python 3)

python3-gfapy (1.0.0 dfsg-3)

flexible and extensible software library for handling sequence graphs

python3-gffutils (0.9-1)

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

python3-keras (2.2.4-1)

deep learning framework running on Theano or TensorFlow

python3-pybel (0.12.1-1)

Biological Expression Language

python3-pybigwig (0.3.12-1 b1)

Python 3 module for quick access to bigBed and bigWig files

python3-pynlpl (1.1.2-1)

bibliothèque PyNLPl pour le traitement automatique des langues – Python 3

pyzo (4.4.3-1.2)

interactive editor for scientific Python

qcumber (1.0.14 dfsg-1)

quality control of genomic sequences

qfits-tools (6.2.0-8 b2)

outils pour manipuler des fichiers FITS

qfitsview (3.3 p1 dfsg-2 b1)

visualisateur de fichier FITS basé sur DPUSER

qgis (2.18.28 dfsg-2)

système d'information géographique –⋅SIG

qgis-api-doc (2.18.28 dfsg-2)

documentation de l'API de QGIS

qgis-common (2.18.28 dfsg-2)

QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture

qgis-plugin-grass (2.18.28 dfsg-2)

greffon GRASS pour QGIS

qgis-plugin-grass-common (2.18.28 dfsg-2)

greffon GRASS pour QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture

qgis-provider-grass (2.18.28 dfsg-2)

fournisseur GRASS pour QGIS

qgis-providers (2.18.28 dfsg-2)

fournisseurs de collections de données pour QGIS

qgis-providers-common (2.18.28 dfsg-2)

fournisseur de collections de données pour QGIS –⋅fichiers indépendants de l'architecture

qgis-server (2.18.28 dfsg-2)

serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC

qmapshack (1.12.3-1)

cartographie GPS (GeoTiff et vectorielle) et gestion d’appareils GPS

qmc (0.94-3.1)

Outil de simplification Quine McClusky

qnifti2dicom (0.4.11-1 b4)

conversion d’images médicales 3D en séries 2D DICOM – interface graphique

qrisk2 (0.1.20150729-4)

calculateur de risque de maladies cardiovasculaires

qthid-fcd-controller (4.1-3 b1)

contrôleur pour le dongle de Funcube

qtltools (1.1 dfsg-3 b1)

Tool set for molecular QTL discovery and analysis

quantum-espresso (6.3-4)

suite Electronic-Structure et Ab-Initio Molecular Dynamics

quantum-espresso-data (6.3-4)

Electronic-Structure and Ab-Initio Molecular Dynamics Suite (Documentation)

quorum (1.1.1-2)

QUality Optimized Reads of genomic sequences

qutemol (0.4.1~cvs20081111-12)

visualisation interactive de macromolécules

r-cran-alakazam (0.2.11-1)

lignage clonal d’immunoglobuline et analyse de diversité

r-cran-sdmtools (1.1-221-1)

Species Distribution Modelling Tools

r-cran-shazam (0.1.11-1)

Immunoglobulin Somatic Hypermutation Analysis

r-cran-tigger (0.3.1-1)

Infers new Immunoglobulin alleles from Rep-Seq Data

racon (1.3.2-1 b1)

consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads

radiant (2.7 dfsg-2)

explore hierarchical metagenomic data with zoomable pie charts

rambo-k (1.21 dfsg-2)

Read Assignment Method Based On K-mers

rampler (1.1.0-1)

module for sampling genomic sequences

rapmap (0.12.0 dfsg-3 b1)

rapid sensitive and accurate DNA read mapping via quasi-mapping

rapmap-dev (0.12.0 dfsg-3)

rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping (some headers)

rapmap-example-data (0.12.0 dfsg-3)

example data for rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping

rasmol (2.7.6.0-1)

visualisation de macromolécules biologiques

raster3d (3.0-3-5)

outils pour la génération d'images de protéines ou d'autres molécules

rate4site (3.0.0-6)

detector of conserved amino-acid sites

rawtran (1.1-1)

RAW photo to FITS converter

raxml (8.2.12 dfsg-1)

ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques

ray (2.3.1-6)

de novo genome assemblies of next-gen sequencing data

ray-extra (2.3.1-6)

Scripts and XSL sheets for post-processing for ray

rdkit-data (201809.1 dfsg-6)

Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)

rdp-classifier (2.10.2-4)

extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s

readseq (1-13)

conversion entre formats de séquences

reapr (1.0.18 dfsg-4)

outil universel pour l’évaluation d’assemblage de génomes

refmac-dictionary (5.41-1)

dictionary for macromolecular refinement and model building

relion-bin (1.4 dfsg-4)

toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy

relion-bin gui (1.4 dfsg-4)

parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy

relion-bin mpi (1.4 dfsg-4)

parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy

relion-bin mpi gui (1.4 dfsg-4)

parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy

repeatmasker-recon (1.08-4)

finds repeat families from biological sequences

reprof (1.0.1-6)

prédicteur de structure secondaire de protéines et d'accessibilité

rna-star (2.7.0a dfsg-1)

aligneur universel et ultra-rapide de RNA-seq

rnahybrid (2.1.2-5)

prédiction rapide et efficace des complexes microARN/cible

roary (3.12.0 dfsg-2)

pipeline de pangénome autonome et très rapide

roguenarok (1.0-3)

versatile and scalable algorithm for rogue taxon identification

rsem (1.3.1 dfsg-1)

RNA-Seq by Expectation-Maximization

rtax (0.984-6)

classification de lectures de séquence d’ARN ribosomique 16S

ruby-rgfa (1.3.1 dfsg-1)

parse, edit and write GFA format graphs in Ruby

runcircos-gui (0.0 git20180828.97703b9-1)

outil graphique pour exécuter circos

sac2mseed (1.12 ds1-3)

Convert SAC waveform data to MiniSEED

saga (2.3.1 dfsg-4 b1)

système d’analyses automatisées géoscientifiques

saga-common (2.3.1 dfsg-4)

SAGA GIS architecture independent files

saint (2.5.0 dfsg-3)

Significance Analysis of INTeractome

salmid (0.1.23-1)

rapid Kmer based Salmonella identifier from sequence data

salmon (0.12.0 ds1-1 b1)

wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data

samblaster (0.1.24-2)

marks duplicates, extracts discordant/split reads

samtools (1.9-4)

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

samtools-test (1.9-4)

test files for the samtools package

saods9 (8.0.1 repack-2)

outil d’affichage d’image pour l’astronomie

sasview (4.2.1-1)

Small Angle Scattering Analysis suite

sat4j (2.3.5-0.3)

bibliothèque de solveurs SAT en Java

savi (1.5.1-3)

représentation de constellations satellitaires

sbmltoolbox (4.1.0-4)

libsbml toolbox for octave and matlab

scamp (2.0.4 dfsg-1 b1)

Compute astrometric and photometric solutions

science-astronomy (1.10)

Debian Science pour l'astronomie —⋅paquet de transition

science-astronomy-dev (1.10)

Debian Science pour l'astronomie —⋅paquet de développement de transition

science-biology (1.10)

paquets Debian Science concernant la biologie

science-chemistry (1.10)

paquets pour la chimie de Debian Science

science-config (1.10)

paquet de configuration pour le projet Debian Science

science-dataacquisition (1.10)

paquets d’acquisition de données de Debian Science

science-dataacquisition-dev (1.10)

Debian Science data acquisition development packages

science-distributedcomputing (1.10)

paquets pour le calcul distribué de Debian Science

science-economics (1.10)

Debian Science Economics packages

science-electronics (1.10)

paquet de transition pour l’électronique de Debian Science

science-electrophysiology (1.10)

paquets de Debian Science pour l'électrophysiologie

science-engineering (1.10)

paquets pour l’ingénierie de Debian Science

science-engineering-dev (1.10)

Debian Science Engineering-dev packages

science-financial (1.10)

Debian Science financial engineering and computational finance

science-geography (1.10)

paquets pour la géographie de Debian Science

science-geometry (1.10)

paquets de géométrie de Debian Science

science-highenergy-physics (1.10)

Debian Science High Energy Physics packages

science-highenergy-physics-dev (1.10)

Debian Science High Energy Physics development packages

science-imageanalysis (1.10)

paquets d’analyse d’image de Debian Science

science-linguistics (1.10)

paquets pour la linguistique de Debian Science

science-logic (1.10)

Debian Science Logic packages

science-machine-learning (1.10)

paquets pour l’apprentissage automatique de Debian Science

science-mathematics (1.10)

Paquets Debian pour les Sciences Mathématiques

science-mathematics-dev (1.10)

Debian Science Mathematics-dev packages

science-meteorology (1.10)

paquets pour la météorologie de Debian Science

science-meteorology-dev (1.10)

Debian Science Meteorology-dev packages

science-nanoscale-physics (1.10)

paquets Debian pour les nanosciences

science-nanoscale-physics-dev (1.10)

paquets de développement Debian pour les nanosciences

science-neuroscience-cognitive (1.10)

paquets pour les neurosciences cognitives de Debian Science

science-neuroscience-modeling (1.10)

paquets de Debian Science pour la modélisation de systèmes neuronaux

science-numericalcomputation (1.10)

paquets pour le calcul numérique de Debian Science

science-physics (1.10)

paquet de physique pour Debian Science

science-physics-dev (1.10)

Debian Science Physics-dev packages

science-presentation (1.10)

outils génériques de Debian science pour des présentations

science-psychophysics (1.10)

paquets pour la psychophysique de Debian Science

science-robotics (1.10)

paquets de robotique de Debian

science-robotics-dev (1.10)

Debian Robotics development packages

science-simulations (1.10)

Debian Science Simulation packages

science-statistics (1.10)

paquets pour les statistiques de Debian Science

science-tasks (1.10)

tâches de Debian Science pour tasksel

science-typesetting (1.10)

paquets pour la composition typographique de Debian Science

science-viewing (1.10)

paquets pour la visualisation des données de Debian Science

science-viewing-dev (1.10)

Debian Science development of visualisation applications

scoary (1.6.16-1)

pangenome-wide association studies

scram (0.16.2-1 b1)

outil d’analyse probabiliste de risque

scram-gui (0.16.2-1 b1)

frontal graphique pour SCRAM

scrm (1.7.3-1)

simulator of evolution of genetic sequences

sctk (2.4.10-20151007-1312Z dfsg2-3.1~deb10u1)

boite à outils de notation de reconnaissance automatique de la parole

scythe (0.994 git20141017.20d3cff-1)

élagage bayésien d’adaptateurs pour des lectures de séquence

sdaps (1.2.1-2)

scripts for data acquisition with paper-based surveys

sdrangelove (0.0.1.20150707-2 b6)

radio logicielle d'Osmocom

seaview (1:4.7-1)

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

seer (1.1.4-2 b2)

genomic sequence element (kmer) enrichment analysis

segemehl (0.3.4-1)

short read mapping with gaps

segyio-bin (1.8.3-1)

SEG-Y read/write library for seismic processing (shell utilities)

seq-gen (1.3.4-2) [non-free]

simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences

seqan-apps (2.4.0 dfsg-11)

C library for the analysis of biological sequences

seqmagick (0.7.0-1)

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

seqprep (1.3.2-3)

stripping adaptors and/or merging paired reads of DNA sequences with overlap

seqprep-data (1.3.2-3)

ensemble de données d’exemple pour seqprep – pour tests uniquement

seqsero (1.0.1 dfsg-1)

Salmonella serotyping from genome sequencing data

seqtk (1.3-1)

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

sextractor (2.19.5 dfsg-6)

extracteur de sources dans des images astronomiques

sga (0.10.15-4)

de novo genome assembler that uses string graphs

shelxle (1.0.952-1)

interface graphique pour SHELXL

shogun-cmdline-static (3.2.0-8 b1)

boîte à outils pour apprentissage automatique à large échelle

sibsim4 (0.20-4)

Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN

sickle (1.33 git20150314.f3d6ae3-1)

outil de réduction adaptative à des fenêtres pour des fichiers FASTQ utilisant la qualité

sift (4.0.3b-6) [non-free]

predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect

sigma-align (1.1.3-6)

alignement de multiples séquences d'ADN non codant

sigviewer (0.6.2-2)

visionneur graphique pour biosignaux tels que EEG, EMG et ECG

silx (0.9.0 dfsg-3 deb10u1)

boite à outils pour l’analyse de données de rayons X – exécutables

sim4 (0.0.20121010-5)

Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique

sim4db (0~20150903 r2013-6)

alignement par lot d’épissages de séquences de cDNA pour un génome cible

simgrid-java (3.21 dfsg-4)

Java bindings for the SimGrid Toolkit

siril (0.9.10-2)

outil de traitement d'images astronomiques

skycat (3.1.2 starlink1~b dfsg-5 b1)

Image visualization and access to catalogs and data for astronomy

slang-xfig (0.2.0~.117-2)

tracés et dessins avec fig2dev d’Xfig en utilisant S-lang

sleepyhead (1.0.0-beta-2 dfsg-6)

logiciel de suivi de sommeil avec un focus sur le traitement de surveillance CPAP

smalr (1.1 dfsg-2)

interrogation of the methylation status of nucleotide sequencing reads

smalt (0.7.6-8)

Sequence Mapping and Alignment Tool

smalt-examples (0.7.6-8)

Sequence Mapping and Alignment Tool (examples)

smithwaterman (0.0 git20160702.2610e25-7)

determination de régions similaires entre deux chaines de séquences génomiques

snakemake (5.4.0-1)

pythonic workflow management system

snap (2013-11-29-9)

location of genes from DNA sequence with hidden markov model

snap-aligner (1.0~beta.18 dfsg-3)

Scalable Nucleotide Alignment Program

snaphu (1.4.2-7) [non-free]

Statistical-Cost, Network-Flow Algorithm for 2D Phase Unwrapping

sniffles (1.0.11 ds-1)

structural variation caller using third-generation sequencing

snp-sites (2.4.1-1)

code binaire pour le paquet snp-sites

snpomatic (1.0-4)

logiciel de mappage strict et rapide de « lectures courtes »

soapaligner (2.20-3)

aligner of short reads of next generation sequencers

soapdenovo (1.05-5)

méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire une ébauche d’assemblage de novo

soapdenovo2 (241 dfsg-3)

méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire un assemblage brouillon de novo

soapsnp (1.03-3)

resequencing utility that can assemble consensus sequence of genomes

solvate (1.0-2) [non-free]

arranges water molecules around protein structures

solvate-doc (1.0-2) [non-free]

Documentation for solvate

sortmerna (2.1-3)

tool for filtering, mapping and OTU-picking NGS reads

spaced (1.2.0-201605 dfsg-1)

alignment-free sequence comparison using spaced words

spades (3.13.0 dfsg2-2)

assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »

spatialite-bin (4.3.0-2 b4)

extension géospatiale pour SQLite – outils

spd (1.3.0-1 b4)

Synchrotron image corrections and azimuthal integration

splash (2.8.0-1 b1)

outil de visualisation pour la simulation de l’hydrodynamique des particules lissées

spoa (1.1.5-1)

SIMD partial order alignment tool

sprai (0.9.9.23 dfsg-2)

single-pass sequencing read accuracy improver

spread-phy (1.0.7 dfsg-2)

analyze and visualize phylogeographic reconstructions

squizz (0.99d dfsg-2)

convertisseur pour les séquences génétiques et les alignements

sra-toolkit (2.9.3 dfsg-1 b1)

utilities for the NCBI Sequence Read Archive

srst2 (0.2.0-6)

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

ssake (4.0-2)

application de génomique pour assembler des millions de séquences très courtes d’ADN

ssake-examples (4.0-2)

example data for SSAKE, a genomic assembler of short reads

sspace (2.1.1 dfsg-4)

scaffolding pre-assembled contigs after extension

ssw-align (1.1-2)

aligneur Smith-Waterman basé sur libssw

stacks (2.2 dfsg-1)

pipeline for building loci from short-read DNA sequences

stacks-web (2.2 dfsg-1)

web interface for displaying loci from short-read sequences

staden (2.0.0 b11-4)

DNA sequence assembly (Gap4/Gap5), editing and analysis tools

staden-common (2.0.0 b11-4)

Architecture independent files for Staden

staden-io-lib-examples (1.14.11-6)

programs for manipulating DNA sequencing files (usage examples)

staden-io-lib-utils (1.14.11-6)

programs for manipulating DNA sequencing files

stardata-common (0.8 b1)

cadriciel commun de gestion des paquets pour l’astronomie

starplot (0.95.5-8.3)

Un afficheur de carte stellaire en perspective 3D

starpu-contrib-examples (1.2.6 dfsg-6) [contrib]

Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs

starpu-examples (1.2.6 dfsg-7)

Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs

stellarium (0.18.3-1)

générateur de ciel photo-réaliste en temps réel

stellarium-data (0.18.3-1)

fichiers de données pour stellarium

step (4:18.08.1-1 b1)

simulateur interactif pour la physique de KDE

stiff (2.4.0-3)

conversion d’images scientifiques FITS dans le format TIFF

stilts (3.1.5-1)

Starlink Tables Infrastructure Library Tool Set

stimfit (0.15.8-1 b1)

Programme pour visualiser et analyser des données d’électrophysiologie

subread (1.6.3 dfsg-1)

boite à outils pour le traitement de données de séquençage de nouvelle génération

subread-data (1.6.3 dfsg-1)

data files for subread package

suitename (0.3.070628-2)

categorize each suite in an RNA backbone

sumaclust (1.0.31-2)

fast and exact clustering of genomic sequences

sumatra (1.0.31-2)

fast and exact comparison and clustering of sequences

sumo (1.1.0 dfsg1-1)

Simulation of Urban MObility (SUMO)

surankco (0.0.r5 dfsg-2)

Supervised Ranking of Contigs in de novo Assemblies

survex (1.2.38-1)

logiciel de relevé et de cartographie de grotte

survex-aven (1.2.38-1)

visionneur de levé de grotte sophistiqué pour Survex

swarm (2.2.2 dfsg-2)

méthode de regroupement robuste et rapide pour des études basées sur les amplicons

swarp (2.38.0 dfsg-4)

Resample and co-add together FITS images

swarp

paquet virtuel fourni par suckless-tools

swe-basic-data (1.80.00.0002-1)

basic data files for the libswe package

swe-standard-data (00004-1)

standard data for the Swiss Ephemeris

sweed (3.2.1 dfsg-1)

estimation des SNP pour leur apport évolutionnaire

syrthes (4.3.0-dfsg1-3)

simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide

syrthes-gui (4.3.0-dfsg1-3)

simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – interface graphique

syrthes-tests (4.3.0-dfsg1-3)

cas à tester pour SYRTHES

syrthes-tools (4.3.0-dfsg1-3)

simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – outils

t-coffee (12.00.7fb08c2-4)

alignement multiple de séquences

t-coffee-examples (12.00.7fb08c2-4)

exemples annotés pour l'utilisation de T-Coffee

tabix (1.9-12~deb10u1)

indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations

tandem-mass (1:201702011-1)

logiciel de spectrométrie de masse pour l’identification de protéines

tantan (22-1)

masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences

tcliis (8.0.1 repack-2)

Tcl IIS protocol package

terraintool (1.13-2)

création de modèles de terrain au format survex à partir de données SRTM ou ASTER

therion (5.4.3ds1-6)

levé de cavité souterraine – logiciel de dessin en 2D et 3D

therion-viewer (5.4.3ds1-6)

levé de grotte – visualisateur 3D pour les modèles de Therion

theseus (3.3.0-8)

superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance

theseus-examples (3.3.0-8)

superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance – exemples

tigr-glimmer (3.02b-2)

Détection de gènes dans des archées et des bactéries

timbl (6.4.13-1)

apprentissage automatique – Tilburg Memory Based Learner

timblserver (1.12-1)

extensions de serveur pour TiMBL

tksao (8.0.1 repack-2)

Tk widgets for astronomical imaging and data visualization

tm-align (20170708 dfsg-2)

alignement structurel de protéines

tnseq-transit (2.3.4-1)

statistical calculations of essentiality of genes or genomic regions

topcat (4.6.2-1)

Tool for OPerations on Catalogues And Tables

tophat (2.1.1 dfsg1-2 b1)

fast splice junction mapper for RNA-Seq reads

topp (2.4.0-real-1)

ensemble de programmes implémentant The OpenMS Proteomic Pipeline

toppred (1.10-7)

transmembrane topology prediction

toulbar2 (1.0.0 dfsg3-2)

Exact combinatorial optimization for Graphical Models

toulbar2-doc (1.0.0 dfsg3-2)

Exact combinatorial optimization for Graphical Models - documentation

trace2dbest (3.0.1-1)

bulk submission of chromatogram data to dbEST

trace2dbest-doc (3.0.1-1)

Documentation and sample files for trace2dbest

tracetuner (3.0.6~beta dfsg-1)

interpretation of DNA Sanger sequencing data

transcalc (0.14-6)

calculateur de ligne de transmission RF et micro-ondes

transdecoder (5.0.1-2)

recherche de séquences codantes dans des séquences de transcriptions d’ARN

transrate-tools (1.0.0-2)

assistant pour Transrate

transtermhp (2.09-4)

trouve les terminateurs de transcription dans les génomes bactériens

travis (190101-1)

analyse et visualisation de trajectoires

tree-ppuzzle (5.2-11)

Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum

tree-puzzle (5.2-11)

reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale

treeview (1.1.6.4 dfsg1-4)

réimplémentation en Java de TreeView de Michael Eisen

treeviewx (0.5.1 git20100823.7e4d0e9-1)

affiche et imprime les arbres phylogénétiques

triangle-bin (1.6-2) [non-free]

High-quality 2-D mesh generator binary programs

trimmomatic (0.38 dfsg-1)

outil flexible de découpage de lecture pour les données Illumina NGS

trinityrnaseq (2.6.6 dfsg-6)

assemblage de novo de séquences d’Arn

trinityrnaseq-examples (2.6.6 dfsg-6)

assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple

trnascan-se (2.0.0-3) [non-free]

detection of transfer RNA genes in genomic sequence

trnascan-se-common (2.0.0-3) [non-free]

detection of transfer RNA genes in genomic sequence (common files)

tunnelx (20170928-2)

logiciel pour le levé de caverne

tvc (5.0.3 git20151221.80e144e dfsg-2)

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

twms (0.07z-1)

minuscule service de cartographie web

ubertooth (2018.12.R1-2)

plateforme de développement pour sans fil 2,4 GHz et pour expérimentation Bluetooth

ubertooth-firmware (2018.12.R1-2)

micrologiciels pour Ubertooth

ubertooth-firmware-source (2018.12.R1-2)

code source du micrologiciel d’Ubertooth

uc-echo (1.12-11)

algorithme de correction d'erreurs pour les lectures courtes réalisées à partir de NGS

ucto (0.14-2)

analyseur lexical pour Unicode

uctodata (0.8-2)

fichiers de données pour Ucto

uhd-host (3.13.1.0-3)

pilote matériel universel pour les produits Ettus Research – applications hôtes

unanimity (3.3.0 dfsg-2.1)

generate and process accurate consensus nucleotide sequences

unicycler (0.4.7 dfsg-2)

pipeline d’assemblage hybride pour des génomes bactériens

unicycler-data (0.4.7 dfsg-2)

hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)

units-filter (3.9-1)

analyseur d'expressions concernant des valeurs physiques

varna (3-93 ds-2)

appliquette de visualisation d’ARN

varscan (2.4.3 dfsg-3) [non-free]

variant detection in next-generation sequencing data

vcftools (0.1.16-1)

ensemble d'outils pour travailler avec les fichiers VCF

velvet (1.2.10 dfsg1-5)

assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures

velvet-example (1.2.10 dfsg1-5)

données d’exemples pour l’assembleur génomique Velvet

velvet-long (1.2.10 dfsg1-5)

assembleur de séquences d’acide nucléique pour des très courtes lectures, version longue

velvet-tests (1.2.10 dfsg1-5)

données de test pour l’assembleur de séquences Velvet

velvetoptimiser (2.2.6-2)

optimisation automatique de paramètres pour Velvet, assembleur génomique de type de novo

viewmol (2.4.1-25)

interface graphique pour les programmes de calculs de chimie

visp-images-data (3.2.0-1)

bibliothèque pour asservissement visuel – ensembles de données de référence

vistrails (2.2.4-1)

boîte à outils de visualisation de flux de travail scientifique

vmtk (1.3 dfsg-2.3) [non-free]

the Vascular Modeling Toolkit

voro (0.4.6 dfsg1-3)

library for the computation of the Voronoi diagram

voro -examples (0.4.6 dfsg1-3)

library for the computation of the Voronoi diagram (examples)

voronota (1.19.2352-1)

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

votca-csg (1.5-3)

moteur pour grosses granularités de VOTCA

votca-csg-scripts (1.5-3)

scripts pour grosses granularités de VOTCA

votca-csg-tutorials (1.5-3)

tutoriels pour grosses granularités de VOTCA

voxbo (1.8.5~svn1246-3 b1)

traitement, analyse statistique et affichage de données d’imagerie cérébrale

vsearch (2.10.4-1)

outil pour le traitement de séquences métagénomiques

wcslib-tools (6.2-2)

Command line tools utilizing wcslib

wcstools (3.9.5-3)

gestion du WCS d’une image FITS

weightwatcher (1.12 dfsg-1)

association de cartes et polygones pour le traitement d’images astronomiques

weka (3.6.14-1)

algorithmes d'apprentissage automatique pour l’exploration de données

wigeon (20101212 dfsg1-2)

réimplémentation de l'utilitaire de détection d'anomalies de l'ADN 16S Pintail

wise (2.4.1-21)

comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines

wsclean (2.6-1 b3)

imageur générique rapide à grand champ pour l’interférométrie

wxastrocapture (1.8.1 git20140821 dfsg-2)

Windows linuX Astronomy Capture

x13as (1.1-B39-1) [non-free]

seasonal adjustment software for modeling time series

xbs (0-10 b1)

modèles 3D et animations de molécules

xcas (1.4.9.69 dfsg1-2)

système de calcul formel – calculateur graphique et en console

xdrawchem (1:1.10.2.1-2)

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xflr5 (6.09.06-2 b3)

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xmakemol (5.16-9 b1)

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xmakemol-gl (5.16-9 b1)

programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires – OpenGL

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simulateur extensible multidimensionnel

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xplot (1.19-9 b2)

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résolution de différentes sortes d’équation avec Phase Plane Plus Auto

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Harmonics data for xtide (Canada, Netherlands, Germany and UK)

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gestion graphique OpenGL 3D pour le langage Yorick

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intégration géodésique de la relativité générale pour le langage Yorick

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Interface avec le format de fichiers HDF5 pour le langage Yorick

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