Paquet : sniffles (1.0.12b ds-1)

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Autres paquets associés à sniffles

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1 dfsg)

bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C de GNU v3

sug: bwa

dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

Télécharger sniffles

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	703,3 ko	1 100,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	681,9 ko	1 040,0 ko	[liste des fichiers]
armel	674,2 ko	1 027,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	680,5 ko	899,0 ko	[liste des fichiers]
i386	717,0 ko	1 127,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	680,8 ko	1 166,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	682,9 ko	1 147,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	707,2 ko	1 196,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	679,3 ko	1 100,0 ko	[liste des fichiers]