[ Paquet source : resfinder-db ]
Paquet : resfinder-db (0.0 git20200408.0322c0d-1)
Liens pour resfinder-db
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source resfinder-db :
- [resfinder-db_0.0 git20200408.0322c0d-1.dsc]
- [resfinder-db_0.0 git20200408.0322c0d.orig.tar.xz]
- [resfinder-db_0.0 git20200408.0322c0d-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bitbucket.org]
Paquets similaires :
base de données de Resfinder composée d’une base soigneusement choisie de gènes de résistance acquis
ResFinder identifie les gènes acquis de résistance microbienne dans des isolats séquencés, partiels ou totaux, de bactérie.
ResFinder utilise BLAST pour cela dans les données du génome entier. Comme entrée, la méthode peut utiliser des génomes partiels, complets ou pré-assemblés, et des lectures courtes de séquence de quatre plateformes de séquençage différentes. La méthode a été évaluée sur 1862 fichiers de GenBank contenant 1411 gènes différents de résistance, ainsi que sur 23 isolats séquencés de novo.
Ce paquet fournit la base de données nécessaire à resfinder.
Autres paquets associés à resfinder-db
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- rec: resfinder
- identify acquired antimicrobial resistance genes
Télécharger resfinder-db
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 12 626,7 ko | 128 205,0 ko | [liste des fichiers] |