[ Paquet source : pigx-rnaseq ]
Paquet : pigx-rnaseq (0.0.10 ds-2)
Liens pour pigx-rnaseq
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source pigx-rnaseq :
- [pigx-rnaseq_0.0.10 ds-2.dsc]
- [pigx-rnaseq_0.0.10 ds.orig.tar.xz]
- [pigx-rnaseq_0.0.10 ds-2.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
pipeline pour des analyses de séquençage d’ARN distribuées et avec des points de contrôle
Ce paquet fournit un déroulement automatique pour l’analyse automatisée d’expérimentations de séquençage d’ARN. Une série d’outils bien adaptés sont connectés dans des scripts de Python et contrôlés à travers snakemake. Ce paquet gère l’exécution parallèle de flux de travaux et fournit des points de contrôle de telle façon que les flux interrompus puissent continuer à être exécutés.
Autres paquets associés à pigx-rnaseq
|
|
|
|
-
- dep: fastqc
- contrôle qualité pour les données de séquences à haut débit
-
- dep: libjs-jquery-datatables
- jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources
-
- dep: libjs-jquery-tablesorter
- jQuery flexible client-side table sorting plugin
-
- dep: multiqc
- output integration for RNA sequencing across tools and samples
-
- dep: pandoc-citeproc
- Pandoc support for Citation Style Language - tools
-
- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
-
- dep: python3-deeptools
- platform for exploring biological deep-sequencing data
-
- dep: python3-htseq
- Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
-
- dep: r-bioc-deseq2
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
-
- dep: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor assay container
-
- dep: r-bioc-tximport
- estimations au niveau transcription de séquences biologiques
-
- dep: r-cran-corrplot
- visualisation d’une matrice de corrélation
-
- dep: r-cran-crosstalk
- GNU R inter-widget interactivity for HTML widgets
-
- dep: r-cran-data.table
- GNU R extension of Data.frame
-
- dep: r-cran-dt (>= 0.15 dfsg-2)
- GNU R wrapper of the JavaScript library 'DataTables'
-
- dep: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-ggrepel
- auto-position non-overlapping text labels in plots
-
- dep: r-cran-gprofiler
- Interface to the 'g:Profiler' Toolkit
-
- dep: r-cran-pheatmap
- GNU R package to create pretty heatmaps
-
- dep: r-cran-plotly
- create interactive web graphics via 'plotly.js' in GNU R
-
- dep: r-cran-reshape2
- Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package
-
- dep: r-cran-rjson
- GNU R package for converting between R and JSON objects
-
- dep: r-cran-rlang
- Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features
-
- dep: r-cran-rmarkdown
- convert R markdown documents into a variety of formats
-
- dep: r-cran-scales
- Scale functions for visualization
-
- dep: rna-star
- aligneur universel et ultra-rapide de RNA-seq
-
- dep: salmon
- wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
-
- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
-
- dep: snakemake
- pythonic workflow management system
-
- dep: trim-galore
- automate quality and adapter trimming for DNA sequencing
Télécharger pigx-rnaseq
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| all | 53,1 ko | 151,0 ko | [liste des fichiers] |