Paquet : mustang (3.2.3-4)

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alignement structurel multiple de protéines

Mustang est un algorithme pour aligner des structures multiples de protéines. Avec un ensemble donné de fichiers PDB, le programme utilise l'information spatiale dans les atomes Calpha de l'ensemble pour produire une séquence d'alignement. Basé sur un appairage heuristique progressif, l'algorithme traite ensuite un certain nombre de repasses d'affinage. Mustang rapporte les alignements de séquence multiples et la superposition de structures correspondantes.

Étiquettes: Biologie: Protéines, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c , Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: role::program, use::analysing, But: Comparaison, Format pris en charge: Texte simple

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enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc 6 (>= 5)

bibliothèque standard C de GNU v3

sug: mustang-testdata

alignements structuraux multiples de protéines – données de test

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	102,6 ko	368,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	96,0 ko	363,0 ko	[liste des fichiers]
armel	93,1 ko	363,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	92,8 ko	311,0 ko	[liste des fichiers]
i386	105,1 ko	379,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	103,9 ko	412,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	101,9 ko	402,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	112,0 ko	459,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	99,0 ko	379,0 ko	[liste des fichiers]