Paquet : mash (2.2.2 dfsg-2)

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Paquets similaires :

estimation rapide de distance entre génomes et métagénomes utilisant MinHash

Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.

Autres paquets associés à mash

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libcapnp-0.7.0

bibliothèque⋅C Cap'n Proto
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)

Portable MurmurHash Implementation
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C de GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger mash

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	149,5 ko	443,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	130,6 ko	383,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	132,1 ko	482,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	148,6 ko	487,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	129,0 ko	431,0 ko	[liste des fichiers]