[ Paquet source : circlator ]
Paquet : circlator (1.5.6-5)
Liens pour circlator
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source circlator :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [sanger-pathogens.github.io]
Paquets similaires :
circularisation d'assemblages de génomes
Circlator est un outil pour automatiser la circularisation d'assemblage pour les génomes de bactéries et de petits eucaryotes. Il produit des représentations linéaires précises de séquences circulaires.
Autres paquets associés à circlator
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- dep: bwa (>= 0.7.12)
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
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- dep: canu
- assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
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- dep: fastaq (>= 3.12.1)
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
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- dep: mummer
- Alignement de séquence efficace de génomes complets
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- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-openpyxl
- Python 3 module to read/write OpenXML xlsx/xlsm files
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- dep: python3-pymummer
- Python 3 interface to MUMmer
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- dep: spades
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
Télécharger circlator
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 4 369,4 ko | 10 531,0 ko | [liste des fichiers] |