Paquet : nwchem (7.0.2-1)
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Ressources externes :
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Paquets similaires :
logiciel de calcul de haute performance pour la chimie numérique
NWChem est un paquet de programmes de chimie numérique. Il fournit des méthodes évolutives à la fois pour leurs capacités à résoudre efficacement de gros problèmes scientifiques de chimie numérique, et à être utilisées par des ressources de calcul en parallèle à partir de supercalculateurs de hautes performances ou de grappes de calcul conventionnelles.
NWChem peut prendre en charge :
– les méthodes de structure électronique moléculaire utilisant les fonctions gaussiennes de base pour le calcul de haute précision de molécules ; – les méthodes de structure électronique d’ondes planes pseudopotentielles pour le calcul de molécules, liquides, cristaux, surfaces, semi-conducteurs ou métaux ; – les simulations dynamiques moléculaires ab initio et classiques ; – les simulations mixtes quantique-classique ; – la parallélisation jusqu’à des milliers de processeurs.
Les fonctions incluses sont :
– les méthodes de structure électronique moléculaire et dérivées secondes analytiques : – Hartree-Fock restreint ou non (RHF, UHF), – théorie de la fonctionnelle de la densité restreinte (DFT) utilisant de nombreux potentiels échange-corrélation locaux, non locaux (correction de gradient) ou hybrides (locaux, non locaux et HF) ; – les méthodes de structure électronique moléculaire et gradients analytiques : – Hartree-Fock restreinte pour couche ouverte (ROHF), – théorie de la fonctionnelle de la densité non restreinte (DFT), – théorie de la perturbation de Møller-Plesset de second ordre (MP2), utilisant les références RHF et UHF, – MP2 avec résolution de l’approximation de l’intégrale identique (RI-MP2), – espace actif complet SCF (CASSCF), – théorie de la fonctionnelle de la densité dépendant du temps (TDDFT) ; – les méthodes de structure électronique moléculaire et énergie en un seul point : – approche MP2 échelonnée spin-composant (SCS-MP2), – méthode du cluster couplé pour « singles » et « doubles », « triples» ou « pertubative triples » (CCSD, CCSDT, CCSD(T)) utilisant les références RHF et UHF, – interaction de configuration (CISD, CISDT et CISDTQ), – méthode du cluster couplé avec approximation du second ordre pour « simples » et « doubles » (CC2), – méthode du cluster couplé multiréférence à états particuliers (MRCC) (approches de Brillouin-Wigner (BW-MRCC) et Mukherjee (Mk-MRCC)) ; – autres fonctions de structure électronique moléculaire : – optimisation de géométrie comprenant les recherches d’état de transition, chemins d’énergie minimale et contraintes (à l’aide des méthodes Nudged Elastic Band (NEB) et Zero Temperature String), – fréquences vibrationnelles, – équations du mouvement (EOM)-CCSD, EOM-CCSDT, EOM-CCSD(T), CC2, interactions de configuration de « singles » (CIS), HF dépendants du temps (TDHF) et TDDFT, pour les états excités avec référence RHF, UHF, RDFT ou UDFT, – solvatation utilisant le modèle COSMO pour RHF, ROHF et DFT, incluant les gradients analytiques, – calculs hybrides utilisant la méthode ONIOM à deux ou trois couches, – effets relativistes à l’aide des spin-orbites et spin-free monoélectroniques de Douglas-Kroll et des approximations régulières d’ordre zéro (ZORA) et les effets spin-orbites monoélectroniques pour DFT à l’aide des potentiels spin-orbites ; – structure électronique d’onde plane pseudopotentielle : – Pseudopotential Plane-Wave (PSPW), Projector Augmented Wave (PAW) ou méthode de structure de bande pour calculer des molécules, liquides, cristaux, surfaces, semi-conducteurs ou métaux, – optimisation géométrique de cellule incluant les recherches d’état transitionnel, – fréquences vibrationnelles, – échange-corrélation de potentiels LDA, PBE96, et PBE0 (restreint ou non), – méthodes SIC, pert-OEP, Hartree-Fock et fonctionnelles hybrides (restreintes ou non), – pseudopotentiels à norme conservée Hamann, Troullier-Martins et Hartwigsen-Goedecker-Hutter avec corrections « semicore », – tracé de courbe de fonctions d’onde, densité, électrostatique et Wannier, – structure de bande et génération de densité d’états ; – dynamique moléculaire Car-Parrinello ab-initio (CPMD) : – dynamiques d’énergie constante et température constante, – algorithme Verlet pour intégration, – contraintes géométriques en coordonnées cartésiennes ; – dynamique moléculaire classique (MD) : – évaluation de l’énergie en configuration single, – minimisation de l’énergie, – simulation de dynamique moléculaire, – simulation d’énergie libre (méthodes multistep thermodynamic perturbation (MSTP) ou multiconfiguration thermodynamic integration (MCTI) avec options topologies uniques ou duales, échantillonnage double et graduations séparées ou décalées), – champs de force fournissant des potentiels appairés réels, polarisation de premier ordre, polarisation automatique cohérente, maillage de particules régulier Ewald (SPME), conditions périodiques de limites et contraintes SHAKE ; – mélange quantique-classique : – minimisations de mélanges mécanique quantique mécanique moléculaire (QM/MM) et simulations de dynamique moléculaire, – simulation de dynamique moléculaire quantique utilisant toute méthode de mécanique capable de renvoyer des gradients.
Autres paquets associés à nwchem
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- dep: libblas3
- implémentation de référence en algèbre linéaire de base - bibliothèque partagée
- ou libblas.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgfortran5 (>= 10)
- bibliothèque d'exécution pour les applications Fortran GNU
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- dep: liblapack3
- bibliothèque de routines algébriques version⋅3 –⋅version partagée
- ou liblapack.so.3
- paquet virtuel fourni par libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.0)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libpython3.9 (>= 3.9.0~b4)
- Shared Python runtime library (version 3.9)
-
- dep: libscalapack-openmpi2.1 (>= 2.1.0)
- Scalable Linear Algebra Package - Shared libs for OpenMPI
-
- dep: mpi-default-bin
- Standard MPI runtime programs (metapackage)
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- dep: nwchem-data (= 7.0.2-1)
- High-performance computational chemistry software (data files)
Télécharger nwchem
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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s390x | 9 433,6 ko | 61 282,0 ko | [liste des fichiers] |