Paquet : python3-presto (0.6.2-1)
Liens pour python3-presto
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source presto :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [presto.readthedocs.io]
Paquets similaires :
toolkit for processing B and T cell sequences (Python3 module)
pRESTO is a toolkit for processing raw reads from high-throughput sequencing of B cell and T cell repertoires.
Dramatic improvements in high-throughput sequencing technologies now enable large-scale characterization of lymphocyte repertoires, defined as the collection of trans-membrane antigen-receptor proteins located on the surface of B cells and T cells. The REpertoire Sequencing TOolkit (pRESTO) is composed of a suite of utilities to handle all stages of sequence processing prior to germline segment assignment. pRESTO is designed to handle either single reads or paired-end reads. It includes features for quality control, primer masking, annotation of reads with sequence embedded barcodes, generation of unique molecular identifier (UMI) consensus sequences, assembly of paired-end reads and identification of duplicate sequences. Numerous options for sequence sorting, sampling and conversion operations are also included.
This package provides the presto Python3 module.
Autres paquets associés à python3-presto
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-biopython (>= 1.65)
- bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
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- dep: python3-numpy
- gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
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- dep: python3-pandas (>= 0.15)
- structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
Télécharger python3-presto
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 51,2 ko | 222,0 ko | [liste des fichiers] |