Paquet : python3-biopython (1.78 dfsg-4)

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Paquets similaires :

bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

Le projet Biopython est une association internationale de programmeurs d'outils libres en Python pour la bio-informatique.

C'est une initiative collaborative distribuée pour le développement de bibliothèques et d'applications en Python 3 pour répondre aux besoins des travaux actuels et futurs en bio-informatique. Le code source est disponible sous la licence Biopython qui est extrêmement libérale et compatible avec presque toutes les licences au monde. Le projet travaille avec la Open Bioinformatics Foundation qui fournit généreusement au projet un espace web et CVS.

Autres paquets associés à python3-biopython

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.4)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
dep: python3-numpy-abi9

paquet virtuel fourni par python3-numpy
dep: python3-reportlab

bibliothèque ReportLab pour créer des documents PDF en utilisant Python3

rec: ncbi-blast (>= 2.10.1-3)

suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
rec: python-biopython-doc (= 1.78 dfsg-4)

documentation pour la bibliothèque Biopython

sug: bwa

dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
sug: clustalo

programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
sug: clustalw

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
sug: dialign

alignement de plusieurs séquences par segments
sug: dssp (>= 4.0.0)

protein secondary structure assignment based on 3D structure
sug: emboss

ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
sug: fasttree

arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
sug: mafft

programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
sug: muscle

Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
sug: phylip

paquet de programmes pour déduire les phylogénies
sug: phyml

estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
sug: prank

Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
sug: probcons

alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
sug: python3-matplotlib

système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3
sug: python3-mmtf

encodage binaire de structures biologiques – Python 3
sug: python3-mysqldb

interface de Python pour MySQL
sug: python3-pil

Python Imaging Library (Python3)
sug: python3-psycopg2

Python 3 module for PostgreSQL
sug: python3-rdflib

Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers
sug: python3-renderpm

interface Python de rendu de bas niveau
sug: python3-scipy

outils scientifiques pour Python 3
sug: python3-tk

Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
sug: raxml

ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
sug: samtools

traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
sug: t-coffee

alignement multiple de séquences
sug: w3-dtd-mathml

DTD pour Mathematical Markup Language V2.0
sug: wise

comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines

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