Paquet : autogrid (4.2.6-9)

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Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

AutoDockSuite permet l'analyse de l'amarrage de molécules de faible poids moléculaire à des récepteurs dont la structure tri-dimensionnelle est connue.

Le programme AutoGrid crée les grilles calculées en prévision de l'amarrage moléculaire de ligands à des grilles qui décrivent l'effet de l'environnement créé par la protéine sur des sondes moléculaires ponctuelles, chargées ou non, permettant de décrire les différents types d'interactions intermoléculaires ligand-protéine (charges positives, négatives, liaisons hydrogènes accepteur, liaisons hydrogènes donneur, hydrophobe, aliphatique, ...). L'effet de ces forces est ensuite analysé avec le programme AutoDock.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, Mis en œuvre en: implemented-in::c , interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, works-with-format::TODO, Fonctionne avec: Maquette en trois dimensions

Autres paquets associés à autogrid

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suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armel, armhf, ppc64el]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc 6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C de GNU v3

sug: autodock

Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

enh: autodock

Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	46,8 ko	110,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	43,9 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
armel	46,6 ko	104,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	45,2 ko	88,0 ko	[liste des fichiers]
i386	44,6 ko	100,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	45,3 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	45,8 ko	105,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	46,6 ko	166,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	44,1 ko	102,0 ko	[liste des fichiers]