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Paquet : autogrid (4.2.6-9)

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Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur

AutoDockSuite permet l"analyse de l"amarrage de molécules de faible poids moléculaire à des récepteurs dont la structure tri-dimensionnelle est connue.

Le programme AutoGrid crée les grilles calculées en prévision de l"amarrage moléculaire de ligands à des grilles qui décrivent l"effet de l"environnement créé par la protéine sur des sondes moléculaires ponctuelles, chargées ou non, permettant de décrire les différents types d"interactions intermoléculaires ligand-protéine (charges positives, négatives, liaisons hydrogènes accepteur, liaisons hydrogènes donneur, hydrophobe, aliphatique, ...). L"effet de ces forces est ensuite analysé avec le programme AutoDock.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Biologie structurale, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d"application: Utilitaire, But: use::analysing, works-with-format::TODO, Fonctionne avec: Maquette en trois dimensions

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